Slash2

PPP4R3B
Идентификаторы
Псевдонимы	PPP4R3B , FLFL2, PP4R3B, PSY2, SMK1, SMEK2, Регуляторная субъединица белка фосфатазы 4 3B 3B
Внешние идентификаторы	Омим : 610352 ; MGI : 2144474 ; Гомологен : 68886 ; GeneCards : PPP4R3B ; OMA : PPP4R3B - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	55,618,880 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	29,220,797 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	bronchial epithelial cell; ; buccal mucosa cell; ; jejunal mucosa; ; ventricular zone; ; Achilles tendon; ; ganglionic eminence; ; mucosa of paranasal sinus; ; mucosa of sigmoid colon; ; epithelium of colon; ; tonsil;
	Top expressed in
	saccule; ; spermatocyte; ; otic placode; ; otic vesicle; ; spermatid; ; genital tubercle; ; olfactory epithelium; ; blood; ; medullary collecting duct; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	cytoplasm; centrosome; protein phosphatase 4 complex; cytoskeleton; nucleus; nucleoplasm; microtubule organizing center; nuclear speck;
Biological process	regulation of lipid metabolic process; protein dephosphorylation; positive regulation of gluconeogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	57223
	104570
	ENSG00000275052
	Ensmusg00000020463
	Q5miz7
	Q922R5
	NM_001122964 ; NM_001282850 ; NM_020463
	NM_134034
	NP_001116436 ; NP_001269779 ; NP_065196
showNP_598795 ; NP_001350287 ; NP_001350288 ; NP_001350289 ; NP_001350290 ;
	NP_001350291
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Регуляторная субъединица 3B сериновой/треониновой фосфатазы 4 -это фермент , который у людей кодируется SMEK2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SMEK2 взаимодействует с PPP4C . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000275052 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000020463 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Rauge B, Aebersold R (ноябрь 2005 г.). «Новый, эволюционно консервативный белкофосфатазный комплекс, участвующий в чувствительности к цисплатину» (PDF) . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (11): 1725–40. doi : 10.1074/mcp.m500231-mcp200 . PMID 16085932 . S2CID 7531012 . Архивировано из оригинала (PDF) на 2021-03-02 . Получено 2019-09-20 .
^ Chowdhury D, Xu X, Zhong X, Ahmed F, Zhong J, Liao J, Dykxhoorn DM, Weinstock DM, Pfeifer GP, Lieberman J (июль 2008). «PP4-фосфатазный комплекс дефосфорилирует гамма-H2AX, генерируемый во время репликации ДНК» . Молекулярная клетка . 31 (1): 33–46. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.016 . PMC 3242369 . PMID 18614045 .
^ «Ген Entrez: Smek2 Smek Homolog 2, супрессор MEK1 (диктиостел)» .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ Chen Gi, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (октябрь 2008 г.). «PP4R4/KIAA1622 образует новый стабильный цитозольный комплекс с фосфопротеинфосфатазой 4» . Журнал биологической химии . 283 (43): 29273–84. doi : 10.1074/jbc.m803443200 . PMC 2662017 . PMID 18715871 .

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Кикуно Р., Ишикава Ки, Хиросава М., Охара О (февраль 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVI. Полные последовательности из 150 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК -исследования . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .
Wiemann S, потому что B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Behrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder A, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder. , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (март 2001 г.). «На пути к каталогу генов человека и белка: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Исследование генома . 11 (3): 422–35. Doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Киттлер Р., Гипл Г., Пеллетье Л., Попер И., Хенингер А.К., Дрехсель Д., Фишер С., Константинова И., Хаберманн Б., Грабнер Х., Ясло М.Л., Гиммельбауэр Х., Корн Б., Ноугебауэр К., Писабарро М.Т., Буххольц Ф (декабрь 2004 ) «На эндорибонуклеаз-подготовленном скрининг миРНК в клетках человека идентифицирует гены, необходимые для деления клеток». Природа . 432 (7020): 1036–40. Bibcode : 2004natur.432.1036K . Doi : 10.1038/nature03159 . PMID 15616564 . S2CID 4372785 .
Mendoza MC, Du F, Iranfar N, Tang N, Ma H, Loomis WF, Firtel RA (сентябрь 2005 г.). «Потеря Smek, нового, консервативного белка, подавляет полярность нулевых клеток MEK1, хемотаксис и дефекты экспрессии генов» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (17): 7839–53. doi : 10.1128/mcb.25.17.7839-7853.2005 . PMC 1190274 . PMID 16107728 .
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (октябрь 2006 г.). «Основанный на вероятности подход для высокопроизводительного анализа фосфорилирования белка и локализации сайта». Nature Biotechnology . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 2 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000275052 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000020463 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid16085932-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Rauge B, Aebersold R (ноябрь 2005 г.). «Новый, эволюционно консервативный белкофосфатазный комплекс, участвующий в чувствительности к цисплатину» (PDF) . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (11): 1725–40. doi : 10.1074/mcp.m500231-mcp200 . PMID 16085932 . S2CID 7531012 . Архивировано из оригинала (PDF) на 2021-03-02 . Получено 2019-09-20 .

[pmid18614045-6] Chowdhury D, Xu X, Zhong X, Ahmed F, Zhong J, Liao J, Dykxhoorn DM, Weinstock DM, Pfeifer GP, Lieberman J (июль 2008). «PP4-фосфатазный комплекс дефосфорилирует гамма-H2AX, генерируемый во время репликации ДНК» . Молекулярная клетка . 31 (1): 33–46. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.016 . PMC 3242369 . PMID 18614045 .

[entrez-7] «Ген Entrez: Smek2 Smek Homolog 2, супрессор MEK1 (диктиостел)» .

[pmid17353931-8] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[pmid18715871-9] Chen Gi, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (октябрь 2008 г.). «PP4R4/KIAA1622 образует новый стабильный цитозольный комплекс с фосфопротеинфосфатазой 4» . Журнал биологической химии . 283 (43): 29273–84. doi : 10.1074/jbc.m803443200 . PMC 2662017 . PMID 18715871 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]