Ensifer Medical
| Ensifer Medical | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Pseudomonadota |
| Сорт: | Alphaproteobacteria |
| Заказ: | Hyphomicrobiales |
| Семья: | Rhizobiaceae |
| Род: | Ensifer |
| Разновидность: | E. Медицинский
|
| Биномиальное название | |
| Ensifer Medical Rome et al. 1996
| |
Ensifer Medicae (также известный как Medicae ) является видом грамотрицательных азота в форме Sinorhizobium бактерий . Они могут быть свободными или симбионтами бобовых растений в корневых узлах . E.Medicae был сначала выделен из корневых узелков на растениях в роде Medicago . [ 1 ] Некоторые штаммы E.Medicae , такие как WSM419, являются аэробными. Они представляют собой хеморганотрофные мезофилы , которые предпочитают температуры около 28 ° C. В дополнение к их первичному геному, эти организмы также имеют три известные плазмиды, размером 1 570 951 п.н., 1 245 408 п.н. и 219 313 п.н. [ 2 ]
Колонии Ensifer Medicae являются слизистым и кольцом и могут быть просмотрены здесь .
Филогения/Таксономия
[ редактировать ]Род иногда называют Sinorhizobium вместо Ensifer (см. Объяснение в родовой статье ). Две основные подгруппы включают штамм E.Medicae A321 и E. Medicae штамм WSM419. Это филогенетическое дерево показывает родственность с остальной частью семейства Rhizobiaceae на основе последовательностей генов 16S рРНК.
Ecological role and symbiosis with legumes
[edit]This bacterium is often involved in mutualistic relationships with legumes. It performs atmospheric nitrogen fixation for the plants and in exchange it receives organic carbon through the process of rhizodeposition. Free-living bacteria become housed inside specialized root cells in root nodules, which creates anaerobic microhabitat in which efficient N-fixation can occur. This mutualism has been observed with many plant species, including Medicago polymorpha and Medicago truncatula plants from around the world.[3] The extent of the mutualism may be dependent upon soil pH, as it was thought that acidity can constrain Sinorhizobium medicae. Current thinking is that acid resistance, particularly in strain WSM419, can be transferred on plasmids.[4]
Agricultural Importance
[edit]Because E. medicae associates well with plants in the genus Medicago and increases plants growth, crop fields are commonly inoculated with the bacteria in addition to or in replacement of synthetic fertilizers.[5]
Specialized strains are developed for challenging conditions. The SRDI554 strain is highly halotolerant, making it an ideal inoculum for the salt-tolerant pasture legume Melilotus siculus (messina).[6] The WSM1115 is, on the other hand, acid-tolerant.[7]
References
[edit]- ^ Chen, WX; Yan, GH; Li, JL (1988). "Numerical taxonomic study of fast-growing soybean rhizobia and a proposal that Rhizobium fredii be assigned to Sinorhizobium gen. nov". International Journal of Systematic Bacteriology. 38 (4): 392–397. doi:10.1099/00207713-38-4-392.
- ^ Reeve, W; Chain, P; O'Hara, G; Ardley, J; Nandesena, K; Bräu, L; Tiwari, R; Malfatti, S; Kiss, H; Lapidus, A; Copeland, A; Nolan, M; Land, M; Hauser, L; Chang, YJ; Ivanova, N; Mavromatis, K; Markowitz, V; Kyrpides, N; Gollagher, M; Yates, R; Dilworth, M; Howieson, J (2010). "Complete genome sequence of the Medicago microsymbiont Ensifer(Sinorhizobium) medicae strain WSM419". Standards in Genomic Sciences. 2 (1): 77–86. doi:10.4056/sigs.43526. PMC 3035259. PMID 21304680.
- ^ Рим, с; Фернандес, депутат; Брунел, б; Норманд, P; Cleyet-Marel, JC (1996). «Sinorhizobium Medicae sp. Nov., Изолирован от ежегодного Medicago SPP» . Международный журнал систематической бактериологии . 46 (4): 972–980. doi : 10.1099/00207713-46-4-972 . PMID 8863426 .
- ^ «Sanginhizobium Medical WSM419» . JGI Genome Portal . Министерство энергетики США.
- ^ Ши, Руихуа. Секвенирование генома Sinorhizoibum, аннотация и азотная фиксация . Университет Оклахомы. ISBN 9780549576518 .
- ^ «Нептун Мессина - новый пастбищный бобовой для физиологических почв, склонных к разрушению» . www.agric.wa.gov.au .
- ^ Рив, w; Баллард, R; Хоуисон, J; Дрю, E; Tian, R; Bräu, L; Munk, c; Давенпорт, K; Цепь, p; Гудвин, л; Пагани, я; Huntemann, M; Mavrommatis, K; Пати, а; Марковиц, V; Иванова, н; Войке, т; Kyrpides, N (15 июня 2014 г.). «Последовательность генома штамма Ensifer Medicae WSM1115; кислотный микросимбионт с кислотой, устойчивым к медикааго из Самотраки, Греция» . Стандарты в геномных науках . 9 (3): 514–26. doi : 10.4056/sigs.4938652 . PMC 4148968 . PMID 25197437 .