Метанобревибактер оральный
| Метанобревибактер оральный | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Архея |
| Королевство: | Эвриархеота |
| Сорт: | Метанобактерии |
| Заказ: | Метанобактерии |
| Семья: | Метанобактерии |
| Род: | Метанобревибактер |
| Разновидность: | М. оральный
|
| Биномиальное имя | |
| Метанобревибактер оральный Феррари и др. 1995 год
| |
Methanobrevibacter oralis — метаногенный вид архей, считающийся членом микробиоты человека , главным образом ассоциированным с ротовой полостью . M. oralis собой формы из неподвижный микроорганизм одноклеточный грамположительный коккобациллярной представляет области архей . жизни [ 1 ] Этот вид был выделен и секвенирован у людей в зубных бляшках и желудочно-кишечном тракте . [ 1 ] [ 2 ] Будучи метаногеном и гидрогенотрофом , этот прокариот может производить метан , используя водород и углекислый газ в качестве субстратов посредством процесса, называемого метаногенезом .
Открытие и сравнение с Methanobrevibacter smithii.
[ редактировать ]Первоначально выделенный в 1994 году из зубного налета человека, Methanobrevibacter oralis стал третьей по распространенности метаногенной архей, встречающейся в организме человека, после Methanobrevibacter smithii и Methanosphaera stadtmanae . Этот вид архей не описан у других видов. [ 3 ] Это наблюдалось в древних зубных камнях человека , а также в различных исследованиях патологий полости рта на разных континентах, в Европе , Азии , Америке и Африке . [ 4 ] [ 5 ]
Однако первый проект геномной последовательности был получен из штамма, выделенного из стула. [ 6 ] Этот вид во многом филогенетически связан с M. smithii, однако он не является отдельным членом кишечника человека , а наиболее распространен в ротовой полости человека. Сравнение их геномных последовательностей показывает явные различия в генах между двумя видами, которые могут дать некоторую информацию о различии ниш. Еще одно отличие, которое отличает M. oralis от M. smithii , заключается в том, что для метаногенеза он использует только газообразный водород (H 2 ) и углекислый газ (CO 2 ), тогда как M. smithii использует эти два субстрата, а также формиат . [ 7 ]
Влияние на здоровье полости рта и микробиом человека
[ редактировать ]Основной интерес к M. oralis заключается в том, что она связана с заболеваниями пародонта , при этом наблюдается увеличение численности этой археи по сравнению с ее численностью в здоровых образцах. Пародонтит — это инфекция, вызываемая множеством различных анаэробных бактерий, и было высказано предположение, что увеличение количества M. oralis способствует этому заболеванию из-за потенциальных синтрофических взаимодействий с другими представителями этой инфекции. [ 8 ] [ 9 ] Эти синтрофические взаимодействия включают поддержку микробной ферментации за счет потребления водорода в результате указанного процесса. Хотя в настоящее время он не считается возбудителем этого заболевания, многочисленные исследования направлены на понимание его связи с этим заболеванием с помощью более независимых от культивирования наборов образцов, эволюционных исследований и иммунологических реакций. [ 5 ] [ 10 ]
Хотя основное внимание уделялось микробиому полости рта , исследования с помощью ПЦР и метагеномного секвенирования выявили доказательства наличия этого вида в кишечнике человека, абсцессах головного мозга , дыхательных путях и аппендикулярных абсцессах . Необходимо провести дополнительные исследования, чтобы понять роль M. oralis в этих нишах. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Феррари, Аннамария; Бруса, Туллио; Рут, Анна; Канци, Генри; Бьявати, Бруно (1 июля 1994 г.). «Выделение и характеристика Methanobrevibacter oralis sp. nov » Современная микробиология . 29 (1):7–12. дои : 10.1007/BF01570184 . ISSN 1432-0991 . S2CID 37098688 .
- ^ Хелафия, Сабер; Гарибаль, Марк; Роберт, Кэтрин; Рауль, Дидье; Дранкур, Мишель (20 февраля 2014 г.). «Проект секвенирования генома штамма Methanobrevibacter oralis JMR01, выделенного из кишечной микробиоты человека» . Геномные объявления . 2 (1): e00073–14. doi : 10.1128/genomeA.00073-14 . ISSN 2169-8287 . ПМЦ 3931360 . ПМИД 24558239 .
- ^ Гиндо, Шейк Умар; Даву, Бернар; Дранкур, Мишель; Грин, Жайлз (23 декабря 2020 г.). «Разнообразие метаногенов в кишечнике животных» . Микроорганизмы . 9 (1): 13. doi : 10.3390/microorganisms9010013 . ISSN 2076-2607 . ПМЦ 7822204 . ПМИД 33374535 .
- ^ Гранехель, Лена; Хуанг, Кун Д.; Тетт, Адриан; Манги, Паоло; Паладин, Алиса; О'Салливан, Найл; Рота-Стабелли, Омар; Сегата, Никола; Цинк, Альберт; Майкснер, Франк (30 сентября 2021 г.). «Метагеномный анализ древнего зубного камня обнаруживает неизведанное разнообразие ротовых архей Methanobrevibacter» . Микробиом . 9 (1): 197. дои : 10.1186/s40168-021-01132-8 . ISSN 2049-2618 . ПМЦ 8485483 . ПМИД 34593021 .
- ^ Jump up to: а б Согодого, Элизабет; Думбо, Огобара; Абудхарам, Жерар; Куриба, Бурема; Диавара, Усейну; Койта, Хапса; Тогора, Сулейман; Дранкур, Мишель (30 октября 2019 г.). «Первая характеристика метаногенов в полости рта у малийских пациентов с патологиями полости рта» . BMC Здоровье полости рта . 19 (1): 232. дои : 10.1186/s12903-019-0929-8 . ISSN 1472-6831 . ПМК 6820998 . ПМИД 31666044 .
- ^ Хелафия, Сабер; Гарибаль, Марк; Роберт, Кэтрин; Рауль, Дидье; Дранкур, Мишель (27 февраля 2014 г.). «Проект секвенирования генома штамма Methanobrevibacter oralis JMR01, выделенного из кишечной микробиоты человека» . Геномные объявления . 2 (1). doi : 10.1128/genomeA.00073-14 . ISSN 2169-8287 . ПМЦ 3931360 . ПМИД 24558239 .
- ^ Гачи, Надя; Боррель, Гийом; Тотти, Уильям; О'Тул, Пол Уильям; Брюжер, Жан-Франсуа (21 ноября 2014 г.). «Архея и кишечник человека: новое начало старой истории» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 20 (43): 16062–16078. дои : 10.3748/wjg.v20.i43.16062 . ISSN 1007-9327 . ПМЦ 4239492 . ПМИД 25473158 .
- ^ Мохаммадзаде, Рохсаре; Манерт, Александр; Даллер, Стефани; Мойссль-Айхингер, Кристина (01 июня 2022 г.). «Ключевые резиденты архей в микробиоме человека: характеристики, взаимодействие и участие в здоровье и заболеваниях» . Современное мнение в микробиологии . 67 : 102146. doi : 10.1016/j.mib.2022.102146 . ISSN 1369-5274 . ПМИД 35427870 .
- ^ Чаудхари, Прем Прашант; Конвей, Патрисия Линн; Шлундт, Йорген (01 апреля 2018 г.). «Метаногены в организме человека: потенциально полезные или вредные для здоровья» . Прикладная микробиология и биотехнология . 102 (7): 3095–3104. дои : 10.1007/s00253-018-8871-2 . ISSN 1432-0614 . ПМИД 29497795 . S2CID 3605290 .
- ^ Хираи, Кимито; Маэда, Хироши; Омори, Кадзухиро; Ямамото, Тадаши; Кокегути, Сусуму; Такасиба, Сёго (2013). « Ответ сывороточных антител на шаперонин группы II из Methanobrevibacter oralis и шаперонин человека CCT » . Патогены и болезни . 68 (1): 12–19. дои : 10.1111/2049-632X.12041 . ПМИД 23620386 .
- ^ Джемай, К.; Гурье, Ф.; Селезнев И.; Меге, Д.; Дранкур, М.; Грин, Г. (01 декабря 2021 г.). «Обнаружение метаногенов в периаппендикулярных абсцессах: отчет о четырех случаях» . Анаэроб . 72 : 102470. doi : 10.1016/j.anaerobe.2021.102470 . ISSN 1075-9964 . ПМИД 34743984 .
- ^ Дранкур, Мишель; Нкамга, Ванесса Демонфорт; Лакхе, Ндейе Айссату; Режи, Жан-Мари; Дюфур, Генри; Фурнье, Пьер-Эдуар; Беха, Ясина; Майкл Шельд, W; Рауль, Дидье (01 июля 2017 г.). «Свидетельства присутствия архейных метаногенов в абсцессе головного мозга» . Клинические инфекционные болезни . 65 (1): 1–5. дои : 10.1093/cid/cix286 . ISSN 1058-4838 . ПМИД 28379309 .
- ^ Коскинен, Кайса; Паусан, Мануэла Р.; Перрас, Александра К.; Бек, Майкл; Банг, Коринна; Мора, Максимилиан; Шилхабель, Анке; Шмитц, Рут; Мойссль-Айхингер, Кристина (29 декабря 2017 г.). Шлепер, Криста М.; Янссон, Джанет К. (ред.). «Первые сведения о разнообразии археомы человека: специфическое обнаружение архей в желудочно-кишечном тракте, легких, носу и на коже» . мБио . 8 (6). дои : 10.1128/mBio.00824-17 . ISSN 2161-2129 . ПМЦ 5686531 . ПМИД 29138298 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Лепп, П.В.; Бриниг, ММ; Оверни, CC; Палм, К.; Армитидж, GC; Релман, Д.А. (2004). «Метаногенные археи и заболевания пародонта человека» . Труды Национальной академии наук . 101 (16): 6176–6181. Бибкод : 2004PNAS..101.6176L . дои : 10.1073/pnas.0308766101 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 395942 . ПМИД 15067114 .
- Хорц Х.П., Конрадс Г. (февраль 2011 г.). «Метаногенные археи и инфекции полости рта — способы разгадать черный ящик» . J Оральный микробиол . 3 . дои : 10.3402/jom.v3i0.5940 . ПМК 3086593 . ПМИД 21541092 .
- Вианна М.Э., Конрадс Г., Гомеш Б.П., Хорц Х.П. (апрель 2006 г.). «Идентификация и количественная оценка архей, участвующих в первичных эндодонтических инфекциях» . J Clin Микробиол . 44 (4): 1274–82. doi : 10.1128/JCM.44.4.1274-1282.2006 . ПМЦ 1448633 . ПМИД 16597851 .
- Вианна М.Э., Холтгреве С., Зейфарт И., Конрадс Г., Хорц Х.П. (май 2008 г.). «Количественный анализ трех гидрогенотрофных микробных групп, метаногенных архей, сульфатредуцирующих бактерий и ацетогенных бактерий в биопленках бляшек, связанных с заболеваниями пародонта у человека» . J Бактериол . 190 (10): 3779–85. дои : 10.1128/JB.01861-07 . ПМК 2394984 . ПМИД 18326571 .
- Вейрих Л.С., Дюшен С., Субриер Дж., Арриола Л., Лламас Б., Брин Дж., Моррис А.Г., Альт К.В., Карамелли Д., Дрезели В., Фаррелл М., Фаррер А.Г., Франкен М., Галли Н., Хаак В., Харди К., Харвати К. , Хелд П., Холмс Э.К., Кайдонис Дж., Лалуэса-Фокс С., де ла Расилья М., Роузес А, Семаль П., Солтисиак А., Таунсенд Г., Усай Д., Уол Дж., Хьюсон Д.Х., Добни К., Купер А. (апрель 2017 г.). «Поведение, диета и болезни неандертальцев, выведенные из древней ДНК зубного камня». Природа . 544 (7650): 357–361. дои : 10.1038/nature21674 . ПМИД 28273061 .
