Экологический

Экологический
Доступные структуры
PDB	Поиск UNIPROT человека: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1LM8, 1LQB, 1VCB, 2C9W, 2IZV, 2JZ3, 2MA9, 3DCG, 3ZKJ, 3ZNG, 3ZRC, 3ZRF, 3ZTC, 3ZTD, 3ZUN, 4AJY, 4AWJ, 4B95, 4B9K, 4BKS, 4BKT, 4N9F, 4W9C, 4W9D, 4W9E, 4W9F, 4W9G, 4W9H, 4W9I, 4W9J, 4W9K, 4W9L, 4WQO, 5BO4
Идентификаторы
Псевдонимы	Elob , SIII, TCEB2, Фактор удлинения транскрипции B Субъединица 2, Elongin B
Внешние идентификаторы	Омим : 600787 ; Гомологен : 134544 ; GeneCards : Elob ; OMA : Elob - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	2,777,289 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; apex of heart; ; muscle of thigh; ; stromal cell of endometrium; ; anterior pituitary; ; nucleus accumbens; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; prefrontal cortex; ; ganglionic eminence;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	Cul2-RING ubiquitin ligase complex; cytosol; Cul5-RING ubiquitin ligase complex; VCB complex; nucleus; elongin complex; nucleoplasm;
Biological process	transcription elongation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; protein ubiquitination; post-translational protein modification; protein-containing complex assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6923
	n/a
	ENSG00000103363
	n/a
	Q15370
	n/a
	NM_207013 ; NM_007108
	n/a
	NP_009039 ; NP_996896
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека

Elongin B - это белок , который у людей кодируется Elob геном . ^{[ 3 ]}

Функция

Elongin B является субъединицей комплекса транскрипционного фактора B (SIII). Комплекс SIII состоит из Elongins A/A2, B и C. Он активирует удлинение РНК -полимеразой II , подавляя переходную паузупозующую полимеразу во многих сайтах во многих блоках транскрипции. Elongin A функционирует как транскрипционно активный компонент комплекса SIII, тогда как Elongins B и C являются регуляторными субъединицами. Elongin A2 специально экспрессируется в яичке и способен образовывать стабильный комплекс с Elongins B и C. Фон Хиппель-Линдау-супрессор-супрессор опухоль связывается с элонгинами B и C и тем самым ингибирует удлинение транскрипции. Для этого гена были описаны два альтернативных варианта сплайсированных транскриптов, кодирующих различные изоформы. ^{[ 4 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TCEB2 взаимодействует :

CUL2 , ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}
TCEB1 , ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и
Фон Хиппель-Линдау-супрессор . ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000103363 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Гаррет К.П., Асо Т., Брэдшер Дж.Н., основатель С.И., Лейн В.С., Конвей Р.К., Конвей Дж.В. (сентябрь 1995). «Позитивная регуляция общего транскрипционного фактора SIII гомологом убиквитина» . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (16): 7172–6. Bibcode : 1995pnas ... 92.7172G . doi : 10.1073/pnas.92.16.7172 . PMC 41301 . PMID 7638163 .
^ "Elob ilongin B [Homo sapiens (после)] "
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Wei N (2008). «Ассоциация SAP130/SF3B-3 с комплексами убиквитин-лигазы Cullin-Ring и ее регуляцией сигнальной сигналом COP9» . BMC Biochem . 9 : 1. doi : 10.1186/1471-2091-9-1 . PMC 2265268 . PMID 18173839 .
^ Kamura T, Burian D, Yan Q, Schmidt SL, Lane WS, Querido E, Branton PE, Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (август 2001 г.). «MUF1, новый Elongin BC-Interacting Leucine, богатый повторным белком, который может собираться с CUL5 и RBX1, чтобы восстановить убиквитин-лигазу» . Дж. Биол. Химический 276 (32): 29748–53. doi : 10.1074/jbc.m103093200 . PMID 11384984 .
^ Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж.С., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сиропа Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А, Босак С., Проявление Р., растяжение заместителя L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (Octoo 2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (Dec 1999). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между Elongin C, Elongin B и белком фон Хиппель-Линдау» . J. Clin. Инвестировать 104 (11): 1583–91. doi : 10.1172/jci8161 . PMC 481054 . PMID 10587522 .
^ Krumm A, Groudine M (сентябрь 1995 г.). «Подавление опухоли и удлинение транскрипции: страшные последствия меняющихся партнеров». Наука . 269 (5229): 1400–1. Bibcode : 1995sci ... 269.1400K . doi : 10.1126/science.7660121 . PMID 7660121 . S2CID 39758696 .
^ Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (февраль 2002 г.). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон-Хиппель-Линдау» . Дж. Биол. Химический 277 (7): 4656–62. doi : 10.1074/jbc.m108269200 . PMID 11739384 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ Мин Дж. Х., Ян Х., Иван М., Гертлер Ф., Кэлин В.Г., Павлетик Н.П. (июнь 2002 г.). «Структура комплекса HIF -1ALPHA -PVHL: распознавание гидроксипролина в передаче сигналов» . Наука . 296 (5574): 1886–9. Bibcode : 2002sci ... 296.1886m . doi : 10.1126/science.1073440 . PMID 12004076 . S2CID 19641938 .
^ Хакер К.Е., Ли К.М., Ратмелл В.К. (2008). Чжан Б (ред.). «Мутации VHL типа 2B сохраняют комплексную форму и функцию VBC» . Plos один . 3 (11): E3801. Bibcode : 2008ploso ... 3.3801h . doi : 10.1371/journal.pone.0003801 . PMC 2583047 . PMID 19030229 .

Дальнейшее чтение

Duan DR, Pause A, Burgess WH, Aso T, Chen Dy, Garrett KP, Conaway RC, Conaway JW, Linehan WM, Klausner Rd (1995). «Ингибирование удлинения транскрипции белком супрессора VHL» . Наука . 269 (5229): 1402–6. Bibcode : 1995sci ... 269.1402d . doi : 10.1126/science.7660122 . PMID 7660122 . S2CID 22334719 .
Aso T, Lane WS, Conaway JW, Conaway RC (1995). «Элонгин (SIII): мультиспасный регулятор удлинения РНК -полимеразой II». Наука . 269 (5229): 1439–43. Bibcode : 1995sci ... 269.1439a . doi : 10.1126/science.7660129 . PMID 7660129 . S2CID 37649908 .
Kibel A, Iliopoulos O, Decaprio JA, Kaelin WG (1995). «Связывание белка супрессора опухоли фон Хиппель-Линдау с элонгином B и C». Наука . 269 (5229): 1444–6. Bibcode : 1995sci ... 269.1444K . doi : 10.1126/science.7660130 . PMID 7660130 . S2CID 25410108 .
Брэдшер Дж.Н., Джексон К.В., Конвей Р.К., Конауэй Дж.В. (1994). «РНК -полимераза II фактор транскрипции SIII. I. Идентификация, очистка и свойства» . Дж. Биол. Химический 268 (34): 25587–93. doi : 10.1016/s0021-9258 (19) 74431-7 . PMID 8244996 .
Пауза А., Ли С., Уоррелл Р.А., Чен Дай, Берджесс В.Х., Линехан В.М., Клауснер Р.Д. (1997). «Продукт гена фон Хиппель-Линдау-супрессора образует стабильный комплекс с человеком CUL-2, членом семейства белков CDC53» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (6): 2156–61. Bibcode : 1997pnas ... 94.2156p . doi : 10.1073/pnas.94.6.2156 . PMC 20057 . PMID 9122164 .
Li XY, Green MR (1998). «Коактиватор TAT-клеток ВИЧ-1 TAT-SF1 является общим фактором удлинения транскрипции» . Гены Дев . 12 (19): 2992–6. doi : 10.1101/gad.12.19.2992 . PMC 317190 . PMID 9765201 .
Zhang JG, Farley A, Nicholson SE, Willson TA, Zugaro LM, Simpson RJ, Moritz RL, Cary D, Richardson R, Hausmann G, Kile BJ, Kent SB, Alexander WS, Metcalf D, Hilton DJ, Никола На, Бака М. (1999). «Консервативный мотив SOCS Box в супрессорах передачи сигналов цитокинов связывается с элонгинами B и C и может пара связанных белков с протеасомной деградацией» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (5): 2071–6. Bibcode : 1999pnas ... 96.2071Z . doi : 10.1073/pnas.96.5.2071 . PMC 26738 . PMID 10051596 .
Stebbins CE, Kaelin WG, Pavletich NP (1999). «Структура комплекса VHL-Elonginc-ElonginB: последствия для функции супрессора опухоли VHL». Наука . 284 (5413): 455–61. Bibcode : 1999sci ... 284..455s . doi : 10.1126/science.284.5413.455 . PMID 10205047 .
Пауза А., Петерсон Б., Шаффар Г., Стерман Р., Клауснер Р.Д. (1999). «Изучение взаимодействий четырех белков в двухгибридной системе дрожжей: структурное сходство комплекса PVHL/Elongin BC/HCUL-2 с комплексом убиквитин лигазы SKP1/Cullin/F-Box Белок» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (17): 9533–8. Bibcode : 1999pnas ... 96.9533p . doi : 10.1073/pnas.96.17.9533 . PMC 22243 . PMID 10449727 .
Iwai K, Yamanaka K, Kamura T, Minato N, Conaway RC, Conaway JW, Klausner Rd, Pause A (1999). «Идентификация белка-супрессора фон Хиппель-Линдау в рамках активного комплекса убиквитиновой лигазы E3» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (22): 12436–41. Bibcode : 1999pnas ... 9612436i . doi : 10.1073/pnas.96.22.12436 . PMC 22941 . PMID 10535940 .
Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (2000). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между Elongin C, Elongin B и белком фон Хиппель-Линдау» . J. Clin. Инвестировать 104 (11): 1583–91. doi : 10.1172/jci8161 . PMC 481054 . PMID 10587522 .
Aso T, Yamazaki K, Amimoto K, Kuroiwa A, Higashi H, Matsuda Y, Kitajima S, Hatakeyama M (2000). «Идентификация и характеристика Elongin A2, нового члена семейства элонгинских факторов удлинения транскрипции, специально выраженных в яичке» . Дж. Биол. Химический 275 (9): 6546–52. doi : 10.1074/jbc.275.9.6546 . PMID 10692460 .
Камура Т., Сато С., Иваи К, Чизик-Керзеска М., Конауэй Р.К., Конвей Дж.В. (2000). «Активация убиквитинирования HIF1ALPHA реконструированным комплексом супрессора VON Hippel-Lindau (VHL)» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (19): 10430–5. Bibcode : 2000pnas ... 9710430K . doi : 10.1073/pnas.190332597 . PMC 27041 . PMID 10973499 .
Aso T, Yamazaki K, Aigaki T, Kitajima S (2000). «Комплекс Drosophila von Hippel-Lindau-супрессора обладает активностью убиквитин лигазы E3». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 276 (1): 355–61. doi : 10.1006/bbrc.2000.3451 . PMID 11006129 .
Камура Т., Буриан Д., Ян К., Шмидт С.Л., Лейн В.С., Керидо Е., Брантон П.Е., Шилатифард А., Конвей Р.К., Конвей Дж.В. (2001). «MUF1, новый Elongin BC-Interacting Leucine, богатый повторным белком, который может собираться с CUL5 и RBX1, чтобы восстановить убиквитин-лигазу» . Дж. Биол. Химический 276 (32): 29748–53. doi : 10.1074/jbc.m103093200 . PMID 11384984 .
Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (2002). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон-Хиппель-Линдау» . Дж. Биол. Химический 277 (7): 4656–62. doi : 10.1074/jbc.m108269200 . PMID 11739384 .
Yamazaki K, Guo L, Sugahara K, Zhang C, Enzan H, Nabappu Y, Kitajima S, Dog T (2002). «Идентификация и биохимическая характеристика нового фактора элегации транспрессии, Elongin A3 » Дж. Биол. химический 277 (29): 26444–5 Doi : 10.1074/ jbc.m20285 PMID 11994304 .
Мин Дж.Х., Ян Х., Иван М., Гертлер Ф., Келин В.Г., Павлетик Н.П. (2002). «Структура комплекса HIF -1ALPHA -PVHL: распознавание гидроксипролина в передаче сигналов» . Наука . 296 (5574): 1886–9. Bibcode : 2002sci ... 296.1886m . doi : 10.1126/science.1073440 . PMID 12004076 . S2CID 19641938 .
Hon WC, Wilson Mi, Harlos K, Claridge TD, Schofield CJ, Pugh CW, Maxwell PH, Ratcliffe PJ, Stuart Di, Jones EY (2002). «Структурная основа для распознавания гидроксипролина в HIF-1 Alpha от PVHL». Природа . 417 (6892): 975–8. Bibcode : 2002natur.417..975h . doi : 10.1038/nature00767 . PMID 12050673 . S2CID 4388644 .

Внешние ссылки

PDBE-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человека Elongin-B

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000103363 - ENSEMBL , май 2017 г.

[2] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7638163-3] Гаррет К.П., Асо Т., Брэдшер Дж.Н., основатель С.И., Лейн В.С., Конвей Р.К., Конвей Дж.В. (сентябрь 1995). «Позитивная регуляция общего транскрипционного фактора SIII гомологом убиквитина» . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (16): 7172–6. Bibcode : 1995pnas ... 92.7172G . doi : 10.1073/pnas.92.16.7172 . PMC 41301 . PMID 7638163 .

[entrez-4] "Elob ilongin B [Homo sapiens (после)] "

[pmid18173839-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Wei N (2008). «Ассоциация SAP130/SF3B-3 с комплексами убиквитин-лигазы Cullin-Ring и ее регуляцией сигнальной сигналом COP9» . BMC Biochem . 9 : 1. doi : 10.1186/1471-2091-9-1 . PMC 2265268 . PMID 18173839 .

[pmid11384984-6] Kamura T, Burian D, Yan Q, Schmidt SL, Lane WS, Querido E, Branton PE, Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (август 2001 г.). «MUF1, новый Elongin BC-Interacting Leucine, богатый повторным белком, который может собираться с CUL5 и RBX1, чтобы восстановить убиквитин-лигазу» . Дж. Биол. Химический 276 (32): 29748–53. doi : 10.1074/jbc.m103093200 . PMID 11384984 .

[pmid16189514-7] Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж.С., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сиропа Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А, Босак С., Проявление Р., растяжение заместителя L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (Octoo 2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

[pmid10587522-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (Dec 1999). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между Elongin C, Elongin B и белком фон Хиппель-Линдау» . J. Clin. Инвестировать 104 (11): 1583–91. doi : 10.1172/jci8161 . PMC 481054 . PMID 10587522 .

[pmid7660129-9] Krumm A, Groudine M (сентябрь 1995 г.). «Подавление опухоли и удлинение транскрипции: страшные последствия меняющихся партнеров». Наука . 269 (5229): 1400–1. Bibcode : 1995sci ... 269.1400K . doi : 10.1126/science.7660121 . PMID 7660121 . S2CID 39758696 .

[pmid11739384-10] Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (февраль 2002 г.). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон-Хиппель-Линдау» . Дж. Биол. Химический 277 (7): 4656–62. doi : 10.1074/jbc.m108269200 . PMID 11739384 .

[pmid17353931-11] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[pmid12004076-12] Мин Дж. Х., Ян Х., Иван М., Гертлер Ф., Кэлин В.Г., Павлетик Н.П. (июнь 2002 г.). «Структура комплекса HIF -1ALPHA -PVHL: распознавание гидроксипролина в передаче сигналов» . Наука . 296 (5574): 1886–9. Bibcode : 2002sci ... 296.1886m . doi : 10.1126/science.1073440 . PMID 12004076 . S2CID 19641938 .

[pmid19030229-13] Хакер К.Е., Ли К.М., Ратмелл В.К. (2008). Чжан Б (ред.). «Мутации VHL типа 2B сохраняют комплексную форму и функцию VBC» . Plos один . 3 (11): E3801. Bibcode : 2008ploso ... 3.3801h . doi : 10.1371/journal.pone.0003801 . PMC 2583047 . PMID 19030229 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]