флавобактерии

флавобактерии
	Elizabethkingia meningoseptica на с кровяным агаром пластинке
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бактероидота
Сорт:	Флавобактерии
Заказ:	Флавобактерии
Семья:	флавобактерии ; Райхенбах 1992 г.
Роды
	См. текст.

Семейство Flavobacteriaceae окружающей среды состоит из бактерий . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Большинство видов аэробны , а некоторые от микроаэробов до анаэробов ; например Capnocytophaga и Coenonia . ^{[ 3 ]}

Роды

Семейство Flavobacteriaceae включает следующие роды: ^{[ 4 ]}

Актибактер Ким и др . 2008 год
Аэкворивита Боуман и Николс, 2002 г.
Эстуарная рыба Jeong et al . 2013 год
Эстуариимонас Парк и др . 2018 год
Estuariivivens Park и др . 2015 год
Альгибактер Недашковская и др . 2004 г.
Альгиталия Юн и др . 2015 год
« Алгоримикробиум » Гарсиа-Лопес и др . 2019 год
« Альтибактерир » Чен и др . 2014 год
« Альтуибактер » Чен и др . 2013 год
Amniculibacterium Chen et al . 2020 год
« Кандидат амебината» Greub et al . 2004 г.
Антарктибактерия Li и др . 2018 год
Антарктимонас Ян и др . 2014 год
Aquaticitalea Xamxidin et al . 2016 год
Аквибактер Хамид и др . 2014 год
Акимарина Недашковская и др . 2005 г.
Арктикифлавибактерир Лю и др . 2016 год
Аренибактер Иванова и др . 2001 г.
Арениталия Чжан и др . 2013 год
« Ascidiaceibacter » Chen et al . 2018 год
Асцидиимонас Юн и др . 2016 год
Аурантиачичелла Терамото и др . 2016 год
Aurantibacter García-López и др . 2020 год
Аурантивирга Сонг и др . 2015 год
Аурейбакулум Чжао и др . 2021 год
Aureicoccus Park и др . 2013 год
Aureisphaera Yoon и др . 2015 год
Ауреиталия Парк и др . 2012 год
Аурейвирга Хабер и др . 2013 год
« Аврилелла » Лейер и др . 2020 год
Бизиония Недашковская и др . 2005 г.
Capnocytophaga Leadbetter et al . 1982 год
Целлюлофага Йохансен и др . 1999 год
Чанчэнчжания Ван и др . 2017 г.
« Цитреибактер » Юн и др . 2018 год
Citreitalea Yoon и др . 2014 год
« Кохлейкола » Шин и др . 2016 год
Ценония Вандамм и др . 1999 год
Confluentibacter Park и др . 2016 год
« Коралииталия » Юн и др . 2018 год
Кораллибактер Ким и др . 2012 год
Костертония Квон и др . 2006 г.
Кроцейбактер Чо и Джованнони 2003 г.
Кросейтелеа Ли и др . 2008 год
Кросейвирга Ху и др . 2017 год
Тэджония Сиддики и др . 2017 год
Докдония Юн и др . 2005 г.
« Кандидат на эндобриопсис » Зан и др . 2019 год ^{[ 5 ]}
Эвдорея Ален и др . 2008 год
Эузебелла Лусена и др . 2010 год
Faecalibacter Chen et al . 2020 год
« Фейфантангия » Чжэн и др . 2015 г.
Флавичелла Терамото и Нисидзима 2015
Флавихалобактер Инь и др . 2021 год
Flavimarina Nedashkovskaya et al . 2015
Флавирамулюс Эйнен и Овреос, 2006 г.
Флавивирга Йи и др . 2012 год
Флавобактерия Берги и др . 1923 г. (утвержденные списки 1980 г.)
Формоза Иванова и др . 2004 г.
Фрондибактер Юн и др . 2015 год
« Фукобактер » Сакаи и др . 2002 г.
Фульвибактерир Хан и др . 2008 год
Gaetbulibacter Jung и др . 2005 г.
Гальбибактер Хан и др . 2007 год
Ганджина Ли и др . 2011 год
Gelatiniphilus Tang et al . 2016 год
Гелидибактер Боуман и др . 1997 год
Геоедония Парк и др . 2013 год
Гиллисия Ван Траппен и др . 2004 г.
Гилвибактер Хан и др . 2007 год
Грамелла Недашковская и др . 2005 г.
Галофлавибактерий Фэн и др . 2020 год
Ханструпера Хамид и др . 2015 год
« Кандидат гемобактерий» Чжан и Рикихиса, 2004 г.
Хоппея Квон и др . 2014 год
Хвандония Юнг и др . 2013 год
Хёнсунлеэлла Юн и др . 2010 год
Ихтиэнтеробактерии Shakeela et al . 2015 год
Имтечелла Сурендра и др . 2012 год
Чехудония Парк и др . 2013 год
Чеджу Ли и др . 2009 год
Джоостелла Куан и др . 2008 год
Кордиа Зон и др . 2004 г.
Кригелла Недашковская и др . 2008 год
Лацинутрикс Боуман и Николс, 2005 г.
Леувенхукиелла Недашковская и др . 2005 г.
Лептобактерия Митра и др . 2009 год
Литорибакулум Джин и Чон 2015
Лутаонелла Арун и др . 2009 год
Лютибактер Чой и Чо 2006
Лутимонас Янг и др . 2007 год
Мангровимонас Ли и др . 2013 год
Maribacter Nedashkovskaya et al . 2004
Mariniflexile Nedashkovskaya et al . 2006
Маринерхабдус Ву и др . 2016 год
« Мариниталеа » Ким и др . 2011 год
Маринивирга Парк и др . 2013 год
Маритимимонас Парк и др . 2009 год
Мариксантомонас Романенко и др . 2007 год
Меридианимарибактер Ван и др . 2010 год
Мезофлавибактерир Аскер и др . 2008 год
Мезогалобактер Фэн и др . 2020 год
Мезония Недашковская и др . 2003 г.
Мурикауда Брунс и др . 2001 г.
Мурикола Канг и др . 2010 год
Миродес Ванканнейт и др . 1996 год
Намхаейкола Юнг и др . 2012 год
Нептуниталея Юн и Касаи 2015
Нонлабенс Лау и др . 2005 г.
Oceanic Чжан и др . 2016 год
« Охровирга » Квон и др . 2014 год
Оллея Манкузо Николс и др . 2005 г.
Парамезония Ван и др . 2020 год
Парёзебиелла Хуанг и др . 2021 год
Патриизоциус Кавано и др . 2020 год
Пауцигалобактер Ву и др . 2020 год
Пелагическое жилище Wang et al . 2020 год
Пибоцелла Недашковская и др . 2005 г.
Planktosalinus Zhong et al . 2016 год
Polaribacter Gosink et al . 1998 год
Понтимикробий Янтра и др . 2020 год
Poritiphilus Wang и др . 2020 год
Постечиелла Ли и др . 2012 год
Цены Ю и др . 2012 год
« Candidatus Prosiliicoccus» Фрэнсис и др . 2019 год
Псевдобизиония Парк и др . 2018 год
Псевдофульвибактерии Yoon и др . 2013 год
Pseudotenacibaculum Huang et al . 2016 год
Pseudozobellia Nedashkovskaya et al . 2009
Психрофлексус Боуман и др . 1999 год
Psychroserpens Bowman et al . 1997 год
« Пукьонгия » Ким и др . 2020 год
Пустулибактерия Ванга и др . 2013 год
Роберткочиа Хамид и др . 2014 год
Робигиниталия Чо и Джованнони, 2004 г.
Сабулилиторибактер Парк и др . 2014 год
Салегентибактер Маккаммон и Боуман, 2000 г.
Salinimicrobium Lim et al . 2008 год
Саония Фагервольд и др . 2017 год
Седиминибактер Хан и др . 2007 год
Седиминикола Хан и др . 2006 г.
Сеонамхайкола Парк и др . 2014 год
Сиенсивирга Хамид и др . 2013 год
Sinomirobium Xu et al . 2013 год
Снуэлла Йи и Чун, 2011 г.
« Сподиобактер » Томида и др . 2019 год
Spongiferula Yoon и др . 2016 год
Spongiimicrobium Yoon et al . 2016 год
Spongiivirga Yoon и др . 2015 год
« Spongitalea » Митра и др . 2012 год
Субсаксибактер Боуман и Николс, 2005 г.
Субсаксимикробий Боуман и Николс 2005 г.
« Суффлавибактерир » Квон и др . 2007 год
Сунгюнквания Юн и др . 2013 год
Тэания Юнг и др . 2016 год
Тамлана Ли, 2007 г.
Тенацибакулум Сузуки и др . 2001 г.
Ульвибактер Недашковская и др . 2004 г.
Ulvibacterium Zhang et al . 2021 год
Уречидикола Шин и Йи 2020
« Вагинелла » Диоп и др . 2017 год
Wenyingzhuangia Liu и др . 2014 год
Winogradskyella Nedashkovskaya et al . 2005
Вокания Хе и др . 2020 год
Ксантомарина Вайдья и др . 2015 год
Йосуана Квон и др . 2006 г.
Зеаксантинибактер Аскер и др . 2007 год
Чжоу Лю и др . 2006 г.
Зобеллия Барбейрон и др . 2001 г.
Цунонгвангия корриг. Цинь и др . 2007 год

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатурное положение. ^{[ 4 ]} а филогения основана на полногеномных последовательностях. ^{[ 6 ]}^{[ а ]}

флавобактерии

	Флавобактерия

	Мироидес

Капноцитофага

	Пустулибактерии

	Имтечелла

Чжоу

	Заморозить

	Гальбибактер

Ауреитала

Маринебабдус

	Ульвибактер

	Невозмутимость

Нонлабены

	Леувенгуекелла

	Докдония

Акимарина

Кроцейбактер

	Психрофлексус

	Мезония

Салинимикробиум

Гиллисия

Салегентибактер

	Грамелла

	Не волнуйся

Кордия

Ауантибактер

	Мезофлавибактерия

	Олея

	Битиония

	Флавирхабдус

Виноградскиелла

Гелидибактер

	Ихтиэнтеробактерия

	Психрозерпенс

	Житель океана

	Лацинутрикс

	Мангровимон

	Формоза

Ксантомарина

	Мужская труппа оперы

	« Алгоримикробиум ».

	Тамлана

	Альгибактер

	Гаетбулибактер

	Сиансивирга

Конфлюентибактер

Желтая девственница

Флавирамулюс

Арениталея

	Чеджуйя

	Хёнсунлеэлла

Синомикробий

аурейкокк

	Кросейвирга

	Крочеиталия

	Псевдозобеллия

	Зобеллия

Вэньинчжуангия

Лютибактер

	Тенацибакулум

	Полярибактер

внешняя группа

Ихтиобактерии

Примечания

^ Actibacter , Aestuariibaculum , Aestuariimonas , Aestuariivivens , Algitalea , Amniculibacterium , Arcticimonas , Aquaticitalea , Arcticiflavibacter , Aquibacter , , , Ascidiimonas , Aurantiacicella , Aurantivirga , Auribaculum , Aureisphaera , Aureivirga Ch , angchengzhania , Citreitalea , Coenonia Corallibacter , Costertonia , Daejeonia , Euzebyella , Faecalibacter , Flavicella , Flavimarina , Frondibacter , FLAVIBACE , Marinivirga , Gangjinia , Gelatiniphilus , Geojedonia , Gilatiniphilus , Mesohalobacter Hoppeia , Hwangdonia , Hoppeia , Lotaonellacterium , Ibacter , LutoNa , Lutimonas , Mariniflexile , Mariniananthomona Namhaeicola s Lostbacter , , Meridianimar , , , Namhaeicola, Neptunitalea Paramesonia, Pareuzebyella, Patiriisocius, Paucihalobacter, Pelagihabitans, Pibocella, Planktosalinus, Pontimicrobium, Poritiphilus, Postechiella, Pseudobizionia, Pseudofulvibacter, Pseudotenacibaculum, Robertkochia, Sabulilitoribacter, Saonia, Sediminibacter, Sediminicola, . , Snuella , Spongiiferula , Spongiimicrobium , Spongiivirga , Subsaxibacter , Subsaximicrobium , Sungkyunkwania , Taeania , Ulvibacterium , Urechidicola , Wocania и Yeosuana не включены в это филогенетическое древо.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Райхенбах Х. (1989). «Отряд 1. Cytophagales Leadbetter 1974, 99*=". В Стейли Дж.Т., Брайант, член парламента, Пфенниг Н., Холт Дж.Г. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 3. Балтимор: The Williams & Wilkins Co., стр. 2011–2013 гг.
^ Бун Д.Р., Кастенхольц Р.В., ред. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии) (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Springer-Verlag. стр. 465–466.
^ «Введение в семейство флавобактерий». Прокариоты . Нью-Йорк: Спрингер. 2006. С. 455–480 . ISBN 978-0-387-25497-5 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Эузеби Ж.П., Парте AC. « Флавобактерии » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 29 июня 2021 г.
^ Зан Дж., Ли З., Тианеро М.Д., Дэвис Дж., Хилл Р.Т., Дония М.С. (2019). «Микробная фабрика защитных кахалалидов в трехстороннем морском симбиозе». Наука 364 ( 6445 ): eaaw6 дои : 10.1126/science.aaw6732 . ПМИД 31196985 . S2CID 189818260 .
^ Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Х.П., Тиндалл Б.Дж., Гронов С., Войк Т., Кирпидес Н.К., Ханке Р.Л., Гёкер М. (2019). «Анализ 1000 геномов типовых штаммов улучшает таксономическую классификацию Bacteroidetes » . Передний микробиол . 10 :2083.дои : 10.3389 / fmicb.2019.02083 . ПМК 6767994 . ПМИД 31608019 .

[7] Actibacter , Aestuariibaculum , Aestuariimonas , Aestuariivivens , Algitalea , Amniculibacterium , Arcticimonas , Aquaticitalea , Arcticiflavibacter , Aquibacter , , , Ascidiimonas , Aurantiacicella , Aurantivirga , Auribaculum , Aureisphaera , Aureivirga Ch , angchengzhania , Citreitalea , Coenonia Corallibacter , Costertonia , Daejeonia , Euzebyella , Faecalibacter , Flavicella , Flavimarina , Frondibacter , FLAVIBACE , Marinivirga , Gangjinia , Gelatiniphilus , Geojedonia , Gilatiniphilus , Mesohalobacter Hoppeia , Hwangdonia , Hoppeia , Lotaonellacterium , Ibacter , LutoNa , Lutimonas , Mariniflexile , Mariniananthomona Namhaeicola s Lostbacter , , Meridianimar , , , Namhaeicola, Neptunitalea Paramesonia, Pareuzebyella, Patiriisocius, Paucihalobacter, Pelagihabitans, Pibocella, Planktosalinus, Pontimicrobium, Poritiphilus, Postechiella, Pseudobizionia, Pseudofulvibacter, Pseudotenacibaculum, Robertkochia, Sabulilitoribacter, Saonia, Sediminibacter, Sediminicola, . , Snuella , Spongiiferula , Spongiimicrobium , Spongiivirga , Subsaxibacter , Subsaximicrobium , Sungkyunkwania , Taeania , Ulvibacterium , Urechidicola , Wocania и Yeosuana не включены в это филогенетическое древо.

[Reichenbach-1] Перейти обратно: ^а ^б Райхенбах Х. (1989). «Отряд 1. Cytophagales Leadbetter 1974, 99*=". В Стейли Дж.Т., Брайант, член парламента, Пфенниг Н., Холт Дж.Г. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 3. Балтимор: The Williams & Wilkins Co., стр. 2011–2013 гг.

[2] Бун Д.Р., Кастенхольц Р.В., ред. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии) (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Springer-Verlag. стр. 465–466.

[3] «Введение в семейство флавобактерий». Прокариоты . Нью-Йорк: Спрингер. 2006. С. 455–480 . ISBN 978-0-387-25497-5 .

[LPSN-4] Перейти обратно: ^а ^б Эузеби Ж.П., Парте AC. « Флавобактерии » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 29 июня 2021 г.

[5] Зан Дж., Ли З., Тианеро М.Д., Дэвис Дж., Хилл Р.Т., Дония М.С. (2019). «Микробная фабрика защитных кахалалидов в трехстороннем морском симбиозе». Наука 364 ( 6445 ): eaaw6 дои : 10.1126/science.aaw6732 . ПМИД 31196985 . S2CID 189818260 .

[García-López-6] Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Х.П., Тиндалл Б.Дж., Гронов С., Войк Т., Кирпидес Н.К., Ханке Р.Л., Гёкер М. (2019). «Анализ 1000 геномов типовых штаммов улучшает таксономическую классификацию Bacteroidetes » . Передний микробиол . 10 :2083.дои : 10.3389 / fmicb.2019.02083 . ПМК 6767994 . ПМИД 31608019 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ а ]