DDX21

DDX21
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2M3D
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX21 , GUA, Gurdb, RH-II/GU, RH-II/GUA, Dead Box Helicase 21, Dexd-Box Helicase
Внешние идентификаторы	Омим : 606357 ; MGI : 1860494 ; Гомологен : 3473 ; GeneCards : DDX21 ; OMA : DDX21 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	68,985,068 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	62,438,060 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	pericardium; ; cartilage tissue; ; mucosa of urinary bladder; ; mucosa of pharynx; ; gingival epithelium; ; vena cava; ; lower lobe of lung; ; nipple; ; lactiferous duct; ; human penis;
	Top expressed in
	epiblast; ; cumulus cell; ; somite; ; primitive streak; ; tail of embryo; ; hair follicle; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; abdominal wall; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	nucleotide binding; rRNA binding; helicase activity; 7SK snRNA binding; protein binding; nucleic acid binding; double-stranded RNA binding; hydrolase activity; ATP binding; snoRNA binding; RNA binding; miRNA binding; identical protein binding;
Cellular component	membrane; nucleoplasm; nucleus; nucleolus; cytoplasm; mitochondrion; cytosol;
Biological process	epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; response to exogenous dsRNA; response to virus; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; osteoblast differentiation; RNA secondary structure unwinding; rRNA processing; immune system process; positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; innate immune response; defense response to virus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9188
	56200
	ENSG00000165732
	EMSMUSM0000000020075
	Q9NR30
	Q9
	NM_001256910 ; NM_004728
	NM_019553
	NP_001243839 ; NP_004719
	NP_062426
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Нуклеолярная РНК -геликаза 2 является ферментом , который у людей кодируется DDX21 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Мертвые белки коробки, характеризующиеся консервативным мотивом ASP-Glu-Ala-ASP (Dead), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерная и митохондриальная сплайсинг, а также сборка рибосомы и сплайсосомы. Основываясь на их моделях распределения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также клеточном росте и разделении. Этот ген кодирует белок мертвого ящика, который является антигеном, распознаваемым аутоиммунными антителами от пациента с болезнью желудка арбуза. Этот белок разматывает двухцепочечную РНК, складывает одноцепочечную РНК и может играть важную роль в биогенезе рибосомального РНК, редактирование РНК, транспорт РНК и общую транскрипцию. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что DDX21 взаимодействует с C-Jun . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000165732 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000020075 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Вальдес Б.К., Хеннинг Д., Буш Р.К., Вудс К., Флорес-Розас Х., Хервиц Дж., Перлаки Л., Буш Х (июнь 1996 г.). «Нуклеолярная РНК -геликаза, распознаваемая аутоиммунными антителами от пациента с болезнью для живота арбуза» . Нуклеиновые кислоты Res . 24 (7): 1220–4. doi : 10.1093/nar/24.7.1220 . PMC 145780 . PMID 8614622 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: DDX21 Dead (ASP-GLU-ALA-ASP) Бокс-полипептид 21» .
^ Westarmarck J, Weiss C, Saffrich R, Kast J, Musti AM, Westi AM, Wesorly M, Ansorge W, Séraphin B, Wilm M, Valdez BC, Bohmann D (февраль 2002 г.). «РНК-геликаза DEXD/H-BOX RHII/GU является совместным фактором транскрипции, активируемой C-Jun » » Embo j 21 (3): 451–6 Doi : 10.1093/ emboj/ 2 125820PMC 11823437PMID

Дальнейшее чтение

Вальдес Б.К., Хеннинг Д., Перлаки Л., Буш Р.К., Буш Х. (1997). «Клонирование и характеристика белка, связывающего Gu/RH-II». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 234 (2): 335–40. doi : 10.1006/bbrc.1997.6642 . PMID 9177271 .
Вальдес Б.К., Ван В. (2000). «Мышиная РНК -геликаза II/GU: кДНК и геномные последовательности, хромосомная локализация и регуляция экспрессии». Геномика . 66 (2): 184–94. doi : 10.1006/geno.2000.6209 . PMID 10860663 .
Чжу К., Хеннинг Д., Вальдес Б., Буш Х (2001). «Человеческая РНК -геликаза II/GU: геномная организация и анализ промотора». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 281 (4): 1006–11. doi : 10.1006/bbrc.2001.4446 . PMID 11237763 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). «Переданный протеомный анализ человеческого ядры» . Карт Биол . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002cbio ... 12 .... 1a . doi : 10.1016/s0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Westarmark J, Weiss C, Saffrich R, Kast J, Musti AM, Ossely M, Ansorge W, Séraphin B, Wilm M, Valdez BC, Bohmann D (2002). «РНК-геликаза DEXD/H-BOX RHII/GU является совместным фактором транскрипции, активируемой C-Jun » » Embo j 21 (3): 451–6 Doi : 10.1093/ emboj/ 2 125820PMC 11823437PMID
Вальдес Б.К., Ян Х., Хонг Е., Секедитин А.М. (2002). «Геномная структура недавно идентифицированного паралога РНК -геликазы II/GU: обнаружение псевдогенов и множественные альтернативно сплайсированные мРНК». Ген . 284 (1–2): 53–61. doi : 10.1016/s0378-1119 (01) 00888-5 . PMID 11891046 .
Henning D, SO RB, Jin R, Lau LF, Valdez BC (2003). «Связывание РНК -геликазы II/GualphA ингибирует продукцию рибосомальной РНК млекопитающих» . Дж. Биол. Химический 278 (52): 52307–14. doi : 10.1074/jbc.m310846200 . PMID 14559904 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005natur.433 ... 77a . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Ян Х., Хеннинг Д., Вальдес Б.К. (2005). «Функциональное взаимодействие между РНК -геликазой II/GU (альфа) и рибосомным белком L4». Февраль J. 272 (15): 3788–802. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04811.x . PMID 16045751 . S2CID 85629514 .
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigge EA, Körner R (2006). «Анализ фосфопротеома человеческого митотического веретена» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 103 (14): 5391–6. Bibcode : 2006pnas..103.5391n . doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365 . PMID 16565220 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Dudewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 10 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000165732 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000020075 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8614622-5] Вальдес Б.К., Хеннинг Д., Буш Р.К., Вудс К., Флорес-Розас Х., Хервиц Дж., Перлаки Л., Буш Х (июнь 1996 г.). «Нуклеолярная РНК -геликаза, распознаваемая аутоиммунными антителами от пациента с болезнью для живота арбуза» . Нуклеиновые кислоты Res . 24 (7): 1220–4. doi : 10.1093/nar/24.7.1220 . PMC 145780 . PMID 8614622 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: DDX21 Dead (ASP-GLU-ALA-ASP) Бокс-полипептид 21» .

[pmid11823437-7] Westarmarck J, Weiss C, Saffrich R, Kast J, Musti AM, Westi AM, Wesorly M, Ansorge W, Séraphin B, Wilm M, Valdez BC, Bohmann D (февраль 2002 г.). «РНК-геликаза DEXD/H-BOX RHII/GU является совместным фактором транскрипции, активируемой C-Jun » » Embo j 21 (3): 451–6 Doi : 10.1093/ emboj/ 2 125820PMC 11823437PMID

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]