TRA2B

TRA2B
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2CQC, 2KXN, 2RRA, 2RRB
Идентификаторы
Псевдонимы	TRA2B , HTRA2-бета, PPP1R156, SFRS10, SRFS10, TRA2-бета, Tran2B, трансформатор 2 бета-гомолог (Drosophila), трансформатор 2 бета-гомолог
Внешние идентификаторы	Омим : 602719 ; MGI : 106016 ; Гомологен : 20965 ; GeneCards : TRA2B ; OMA : TRA2B - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	185,938,103 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	22,084,755 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	germinal epithelium; ; parietal pleura; ; ventricular zone; ; embryo; ; visceral pleura; ; endothelial cell; ; ganglionic eminence; ; amniotic fluid; ; tibia; ; epithelium of nasopharynx;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; yolk sac; ; embryo; ; embryo; ; spermatocyte; ; neural layer of retina; ; morula; ; blastocyst;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	nucleic acid binding; mRNA binding; protein binding; poly-purine tract binding; RNA binding; protein domain specific binding; pre-mRNA binding; identical protein binding;
Cellular component	nucleus; nuclear inner membrane; nucleoplasm; spliceosomal complex; ribonucleoprotein complex;
Biological process	RNA splicing, via transesterification reactions; RNA splicing; cerebral cortex regionalization; mRNA processing; negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome; embryonic brain development; mRNA splicing, via spliceosome; positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; regulation of RNA splicing; protein complex oligomerization; cellular response to glucose stimulus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6434
	20462
	ENSG00000136527
	Ensmusg00000022858
	P62995
	P62996
	NM_001243879 ; NM_004593
	NM_009186 ; NM_001330554 ; NM_001330555
	NP_001230808 ; NP_004584
	NP_001317483 ; NP_001317484 ; NP_033212
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Бета-гомолог трансформатора-2 , также известный как TRA2B , ранее известный как фактор сплайсинга, Arginine/Serine, 10 (гомолог 2 Transformer 2, Drosophila) ( SFRS10 ), является белком , который у людей кодируется TRA2B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TRA2B взаимодействует с RBMX . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000136527 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022858 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS10, Arginine/Serine Rich 10 (гомолог Transformer 2, Drosophila)» .
^ Найлер О., Кэп С, Стамм С (октябрь 1998). «Человеческий трансформер-2-бета-ген (SFRS10): полная нуклеотидная последовательность, хромосомная локализация и генерация тканеспецифической изоформы». Геномика . 53 (2): 191–202. doi : 10.1006/geno.1998.5471 . PMID 9790768 .
^ Хофманн, Ивонн; Вирт Брунхилд (август 2002 г.). «HNRNP-G способствует включению экзона 7 моторного нейрона выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с HTRA2-бета1» . Гул Мол Генет . 11 (17): 2037–49. doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . ISSN 0964-6906 . PMID 12165565 .

Дальнейшее чтение

Matsuo N, Ogawa S, Imai Y, et al. (1996). «Клонирование нового полипептида, связывающего РНК (RA301), вызванное гипоксией/реоксигенацией» . Дж. Биол. Химический 270 (47): 28216–22. doi : 10.1074/jbc.270.47.28216 . PMID 7499316 .
Lennon G, Auffray C, Polymeropoulos M, Soares MB (1996). «Консорциум изображения: интегрированный молекулярный анализ геномов и их экспрессии» . Геномика . 33 (1): 151–2. doi : 10.1006/Geno.1996.0177 . PMID 8617505 .
Beil B, Screaton G, Stamm S (1997). «Молекулярное клонирование HTRA2-бета-1 и HTRA2-бета-2, два человека гомолога TRA-2, созданные альтернативным сплайсингом». ДНК -клеточная биол . 16 (6): 679–90. doi : 10.1089/dna.1997.16.679 . PMID 9212162 .
Imai Y, Matsuo N, Ogawa S, et al. (1998). «Клонирование гена, YT521, для нового белка, связанного с сплайсингом РНК, индуцированного гипоксией/реоксигенацией». Brain Res. Мол Brain Res . 53 (1–2): 33–40. doi : 10.1016/s0169-328x (97) 00262-3 . PMID 9473574 .
Tacke R, Tohyama M, Ogawa S, Manley JL (1998). «Человеческие белки TRA2 являются последовательными активаторами сплайсинга пре-мРНК» . Клетка . 93 (1): 139–48. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81153-8 . PMID 9546399 . S2CID 15384749 .
Найлер О., Кэп С., Стамм С. (1998). «Человеческий трансформер-2-бета-ген (SFRS10): полная нуклеотидная последовательность, хромосомная локализация и генерация тканеспецифической изоформы». Геномика . 53 (2): 191–202. doi : 10.1006/geno.1998.5471 . PMID 9790768 .
Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). «Сплайсинг SRM160/300 для функции экзон-энханса» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (11): 6125–30. Bibcode : 1999pnas ... 96.6125e . doi : 10.1073/pnas.96.11.6125 . PMC 26846 . PMID 10339552 .
Lai MC, Lin Ri, Huang Sy, et al. (2000). «Белок семейства импоринов-бета человека, Transportin-Sr2, взаимодействует с фосфорилированным доменом RS белков SR» . Дж. Биол. Химический 275 (11): 7950–7. doi : 10.1074/jbc.275.11.7950 . PMID 10713112 .
Venables JP, Elliott DJ, Makarova OV, et al. (2000). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека и другие белки HNRNP G взаимодействуют с TRA2Beta и влияют на сплайсинг» . Гул Мол Генет . 9 (5): 685–94. doi : 10.1093/hmg/9.5.685 . PMID 10749975 .
Helmken C, Wirth B (2001). «Исключение HTRA2-BETA1, повышенного регулятора транскрипта SMN2 полноразмерного, в качестве модифицирующего гена для мышечной атрофии позвоночника». Гул Генет . 107 (6): 554–8. doi : 10.1007/s004390000409 . PMID 11153908 . S2CID 30528707 .
Young PJ, Didonato CJ, Hu D, et al. (2002). «SRP30C-зависимая стимуляция моторного нейрона выживаемости (SMN) экзона 7 облегчается прямым взаимодействием с бета 1 HTRA2» . Гул Мол Генет . 11 (5): 577–87. doi : 10.1093/hmg/11.5.577 . PMID 11875052 .
Hofmann Y, Wirth B (2003). «HNRNP-G способствует включению экзона 7 моторного нейрона выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с HTRA2-бета1» . Гул Мол Генет . 11 (17): 2037–49. doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . PMID 12165565 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Тран Q, Коулман Т.П., Россер младший (2003). «Человеческий трансформатор 2beta и srp55 взаимодействуют с кальцитонином-специфическим энхансером сращивания». Биохим. Биофиз. Акт . 1625 (2): 141–52. doi : 10.1016/s0167-4781 (02) 00600-0 . PMID 12531473 .
El Yazidi-Belkoura I, Adriaenssens E, Dollé L, et al. (2003). «Связанный белок домена домена, ассоциированного с рецептором некроза опухоли участвует в антиапоптотической активности нейропоптотической активности фактора роста нервов в клетках рака молочной железы, опосредованной нейротрофиновым рецептором» . Дж. Биол. Химический 278 (19): 16952–6. doi : 10.1074/jbc.m300631200 . PMID 12604596 .
Jiang Z, Tang H, Havlioglu N, et al. (2003). «Мутации в экзоне 10 Tau, связанные с FTDP-17, изменяют активность экзонического энхансера сплайсинга для взаимодействия с бета TRA2» . Дж. Биол. Химический 278 (21): 18997–9007. doi : 10.1074/jbc.m301800200 . PMC 2140226 . PMID 12649279 .
Chen X, Guo L, Lin W, Xu P (2004). «Экспрессия изоформ Tra2beta регулируется развитием в тканевой и височно-специфической схеме». Клеточная биол. Инт . 27 (6): 491–6. doi : 10.1016/s1065-6995 (03) 00072-6 . PMID 12798777 . S2CID 44758770 .
Helmken C, Hofmann Y, Schoenen F, et al. (2004). «Доказательства изменения пути в дискордантных семьях SMA: снижение уровня SMN уменьшает количество его взаимодействующих партнеров и HTRA2-бета1». Гул Генет . 114 (1): 11–21. doi : 10.1007/s00439-003-1025-2 . PMID 14520560 . S2CID 19872246 .
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, et al. (2003). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью SRRP86 и его взаимодействующих белков» . Мол Клетка. Биол . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/mcb.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 3 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000136527 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022858 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS10, Arginine/Serine Rich 10 (гомолог Transformer 2, Drosophila)» .

[pmid9790768-6] Найлер О., Кэп С, Стамм С (октябрь 1998). «Человеческий трансформер-2-бета-ген (SFRS10): полная нуклеотидная последовательность, хромосомная локализация и генерация тканеспецифической изоформы». Геномика . 53 (2): 191–202. doi : 10.1006/geno.1998.5471 . PMID 9790768 .

[pmid12165565-7] Хофманн, Ивонн; Вирт Брунхилд (август 2002 г.). «HNRNP-G способствует включению экзона 7 моторного нейрона выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с HTRA2-бета1» . Гул Мол Генет . 11 (17): 2037–49. doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . ISSN 0964-6906 . PMID 12165565 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]