Гомологичный белок кальциневрина В 1

CHP1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2E30
Идентификаторы
Псевдонимы	CHP1 , CHP, SLC9A1BP, SID470P, P22, P24, кальциневрин, как EF-ручный белок 1, SPAX9
Внешние идентификаторы	Омим : 606988 ; MGI : 1927185 ; Гомологен : 5235 ; GeneCards : CHP1 ; OMA : CHP1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	41,281,887 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	119,417,508 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	mucosa of colon; ; mucosa of sigmoid colon; ; jejunal mucosa; ; vulva; ; mucosa of transverse colon; ; nasal epithelium; ; mucosa of ileum; ; duodenum; ; mucosa of pharynx; ; gums;
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; decidua; ; lateral septal nucleus; ; pontine nuclei; ; ventral tegmental area; ; ventromedial nucleus; ; lobe of prostate; ; subiculum; ; anterior amygdaloid area;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	calcium ion binding; transporter activity; microtubule binding; protein kinase inhibitor activity; metal ion binding; calcium-dependent protein binding; potassium channel regulator activity; kinase binding; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; focal adhesion; microtubule cytoskeleton; Golgi membrane; plasma membrane; transport vesicle; endoplasmic reticulum; extracellular exosome; cytoskeleton; endomembrane system; nucleus; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment;
Biological process	negative regulation of protein phosphorylation; positive regulation of protein glycosylation; negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade; hyaluronan catabolic process; negative regulation of protein autophosphorylation; negative regulation of protein kinase activity; positive regulation of sodium:proton antiporter activity; negative regulation of phosphatase activity; small GTPase mediated signal transduction; protein stabilization; cellular response to acidic pH; membrane fusion; regulation of intracellular pH; positive regulation of protein transport; negative regulation of protein ubiquitination; potassium ion transport; protein complex oligomerization; microtubule bundle formation; cytoplasmic microtubule organization; protein export from nucleus; membrane docking; regulation of neuron death; protein transport; membrane organization; negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; calcium-ion regulated exocytosis; positive regulation of protein targeting to membrane; negative regulation of protein import into nucleus; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11261
	56398
	ENSG00000187446
	Ensmusg00000014077
	Q99653
	P61022
	NM_007236
	NM_019769
	NP_009167
	NP_062743
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Гомологичный белок 1 кальциневрина В является белком, кодируемым у людей геном ( CHP1 ранее CHP ). ^{[ 5 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой фосфопротеин , который связывается с обменниками натрия-гидрогена (NHES). Этот белок служит важным кофактором , который поддерживает физиологическую активность членов семейства NHE. Он имеет сходство последовательности белка с кальциневрином В и, как известно, является эндогенным ингибитором активности кальциневрина . ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что гомологичный белок 1 кальциневрин В взаимодействует с

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000187446 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000014077 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: CHP -связывающий белок P22» .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Иноуэ Х, Накамура Ю., Нагита М., Такай Т., Масуда М., Накамура Н., Каназава Х (февраль 2003 г.). «Изоформа гомологичного белка кальциневрина 2 (CHP2), Na+/H+-обмен-связывающий белок, экспрессируется в эпителии кишечника» . Биологический и фармацевтический бюллетень . 26 (2): 148–55. doi : 10.1248/bpb.26.148 . PMID 12576672 .
^ Лин X, Барбер Д.Л. (октябрь 1996 г.). «Гомологичный белок кальциневрина ингибирует стимулированный GTPase NA-H Exchange» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (22): 12631–6. Bibcode : 1996pnas ... 9312631L . doi : 10.1073/pnas.93.22.12631 . PMC 38044 . PMID 8901634 .
^ Панг Т, Су Х, Вакабаяши С., Шигекава М (май 2001). «Гомологичный белок кальциневрина как необходимый кофактор для обменов Na+/H+» . Журнал биологической химии . 276 (20): 17367–72. doi : 10.1074/jbc.m100296200 . PMID 11350981 .
^ Zhang-James Y, Dasbanerjee T, Sagvolden T, Middleton FA, Faraone SV (Dec 2011). «Мутации SLC9A9, экспрессия генов и белковые взаимодействия в моделях крыс с дефицитом внимания/гиперактивности» . Американский журнал медицинской генетики часть б . 156b (7): 835–43. doi : 10.1002/ajmg.b.31229 . PMC 3168688 . PMID 21858920 .

Дальнейшее чтение

Робертсон Н.Г., Хетарпал У, Гутиресс-Эплета Г.А., Бибер Ф.Р., Мортон К.С. (сентябрь 1994). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кохлеарной кДНК человека с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика . 23 (1): 42–50. doi : 10.1006/geno.1994.1457 . PMID 7829101 .
Баррозо М.Р., Бернд К.К., ДеВитт Н.Д., Чанг А., Миллс К., Штул Эс (апрель 1996 г.). «Новый Ca2+-связывающий белок, P22, необходим для конститутивного мембранного трафика» . Журнал биологической химии . 271 (17): 10183–7. doi : 10.1074/jbc.271.17.10183 . PMID 8626580 .
Лин X, Барбер Д.Л. (октябрь 1996 г.). «Гомологичный белок кальциневрина ингибирует стимулированный GTPase NA-H Exchange» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (22): 12631–6. Bibcode : 1996pnas ... 9312631L . doi : 10.1073/pnas.93.22.12631 . PMC 38044 . PMID 8901634 .
Лин Х, Сиккинк Р.А., Руснак Ф., Барбер Д.Л. (декабрь 1999). «Ингибирование активности фосфатазы кальциневрина гомологичным белком кальциневрина В» . Журнал биологической химии . 274 (51): 36125–31. doi : 10.1074/jbc.274.51.36125 . PMID 10593895 .
Панг Т, Су Х, Вакабаяши С., Шигекава М (май 2001). «Гомологичный белок кальциневрина как необходимый кофактор для обменов Na+/H+» . Журнал биологической химии . 276 (20): 17367–72. doi : 10.1074/jbc.m100296200 . PMID 11350981 .
Matsumoto M, Miyake Y, Nagita M, Inoue H, Sithakubo D, Takemoto K, Ohtsuka C, Murakami H, Nakamura N, Kanazawa H (август 2001 г.). «Серин/треонинкиназа, которая вызывает апоптоз, подобную гибели клеток, взаимодействует с белком кальциневрина B-подобного, способным связывать Na (+)/H (+) обменник». Журнал биохимии . 130 (2): 217–25. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002975 . PMID 11481038 .
Накамура Н., Мияке Ю., Мацушита М., Танака С., Иноуэ Х, Каназава Х (сентябрь 2002). «KIF1BBeta2, способный взаимодействовать с ТЭЦ, локализуется в синаптических везикулах». Журнал биохимии . 132 (3): 483–91. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a003246 . PMID 12204119 .
Панг Т., Вакабаяши С., Шигекава М (ноябрь 2002). «Экспрессия гомологичного белка 2 кальциневрина В защищает индуцированную сывороткой депривацией гибель клеток с помощью сыворотки, независимой активации Na+/H+ теплообменника» . Журнал биологической химии . 277 (46): 43771–7. doi : 10.1074/jbc.m208313200 . PMID 12226101 .
Иноуэ Х, Накамура Ю., Нагита М., Такай Т., Масуда М., Накамура Н., Каназава Х (февраль 2003 г.). «Изоформа гомологичного белка кальциневрина 2 (CHP2), Na+/H+-обмен-связывающий белок, экспрессируется в эпителии кишечника» . Биологический и фармацевтический бюллетень . 26 (2): 148–55. doi : 10.1248/bpb.26.148 . PMID 12576672 .
Панг Т, Хисамицу Т., Мори Х, Шигекава М., Вакабаяши С (март 2004 г.). «Роль гомологичного белка кальциневрина В в регуляции pH с помощью Na+/H+ обменника 1: плотно связанные ионы Ca2+ в качестве важных структурных элементов». Биохимия . 43 (12): 3628–36. doi : 10.1021/bi0360004 . PMID 15035633 .
Andrade J, Pearce St, Zhao H, Barroso M (Dec 2004). «Взаимодействие между P22, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой и микротрубочками» . Биохимический журнал . 384 (Pt 2): 327–36. doi : 10.1042/bj20040622 . PMC 1134116 . PMID 15312048 .
Бен Аммар Y, Такеда С., Сугавара М., Миано М., Мори Х, Вакабаяши С (октябрь 2005 г.). «Кристаллизация и предварительный кристаллографический анализ человеческого гомологичного белка кальциневрина CHP2, связанного с цитоплазматической областью Na+/H+ Обменной обмена NHE1» . Acta Crystallographica Раздел f . 61 (Pt 10): 956–8. doi : 10.1107/s1744309105030836 . PMC 1991313 . PMID 16511206 .
Мишима М., Вакабаяши С., Кодзима С (январь 2007). «Структура раствора цитоплазматической области Na+/H+ Обменение 1, в комплекте с незаменимым кофактором гомологичного белка 1 кальциневрина В» . Журнал биологической химии . 282 (4): 2741–51. doi : 10.1074/jbc.m604092200 . PMID 17050540 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома CHP1 и страница детали гена CHP1 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене о хромосоме человека 15 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000187446 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000014077 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: CHP -связывающий белок P22» .

[pmid12576672-6] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Иноуэ Х, Накамура Ю., Нагита М., Такай Т., Масуда М., Накамура Н., Каназава Х (февраль 2003 г.). «Изоформа гомологичного белка кальциневрина 2 (CHP2), Na+/H+-обмен-связывающий белок, экспрессируется в эпителии кишечника» . Биологический и фармацевтический бюллетень . 26 (2): 148–55. doi : 10.1248/bpb.26.148 . PMID 12576672 .

[pmid8901634-7] Лин X, Барбер Д.Л. (октябрь 1996 г.). «Гомологичный белок кальциневрина ингибирует стимулированный GTPase NA-H Exchange» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (22): 12631–6. Bibcode : 1996pnas ... 9312631L . doi : 10.1073/pnas.93.22.12631 . PMC 38044 . PMID 8901634 .

[pmid11350981-8] Панг Т, Су Х, Вакабаяши С., Шигекава М (май 2001). «Гомологичный белок кальциневрина как необходимый кофактор для обменов Na+/H+» . Журнал биологической химии . 276 (20): 17367–72. doi : 10.1074/jbc.m100296200 . PMID 11350981 .

[pmid21858920-9] Zhang-James Y, Dasbanerjee T, Sagvolden T, Middleton FA, Faraone SV (Dec 2011). «Мутации SLC9A9, экспрессия генов и белковые взаимодействия в моделях крыс с дефицитом внимания/гиперактивности» . Американский журнал медицинской генетики часть б . 156b (7): 835–43. doi : 10.1002/ajmg.b.31229 . PMC 3168688 . PMID 21858920 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]