ПЛОД3

ПЛОД3
Идентификаторы
Псевдонимы	PLOD3 , LH3, проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат-5-диоксигеназа 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 603066 ; МГИ : 1347008 ; Гомологен : 843 ; Генные карты : PLOD3 ; ОМА : PLOD3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	101,218,420 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	137,025,502 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; pancreatic ductal cell; ; tibial nerve; ; mucosa of transverse colon; ; C1 segment; ; body of uterus; ; granulocyte; ; upper lobe of left lung; ; muscle layer of sigmoid colon; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	granulocyte; ; calvaria; ; yolk sac; ; stroma of bone marrow; ; ankle joint; ; tibiofemoral joint; ; gastrula; ; lactiferous gland; ; muscle of thigh; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	iron ion binding; L-ascorbic acid binding; dioxygenase activity; metal ion binding; protein binding; oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; procollagen galactosyltransferase activity; oxidoreductase activity; procollagen-lysine 5-dioxygenase activity; procollagen glucosyltransferase activity; catalytic activity; transferase activity; glycosyltransferase activity;
Cellular component	rough endoplasmic reticulum membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; extracellular exosome; endoplasmic reticulum; Golgi apparatus; trans-Golgi network; extracellular matrix; extracellular region; extracellular space; endoplasmic reticulum lumen; rough endoplasmic reticulum; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	protein localization; lung morphogenesis; collagen fibril organization; epidermis morphogenesis; endothelial cell morphogenesis; vasodilation; in utero embryonic development; basement membrane assembly; cellular response to hormone stimulus; neural tube development; protein O-linked glycosylation; hydroxylysine biosynthetic process; peptidyl-lysine hydroxylation; collagen metabolic process; metabolism;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8985
	26433
	ENSG00000106397
	ENSMUSG00000004846
	О60568
	Q9R0E1
	НМ_001084
	НМ_011962
	НП_001075
	НП_036092
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Проколлаген-лизин,2-оксоглутарат-5-диоксигеназа 3 — это фермент , который у человека кодируется PLOD3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой мембраносвязанный гомодимерный фермент, локализованный в цистернах шероховатой эндоплазматической сети . Фермент (кофакторы железо и аскорбат ) катализирует гидроксилирование лизильных остатков в коллагеноподобных пептидах . Образующиеся гидроксилизильные группы являются местами прикрепления углеводов в коллагене и, таким образом, имеют решающее значение для стабильности межмолекулярных сшивок. У некоторых пациентов с синдромом Элерса-Данлоса типа VIB наблюдается дефицит активности лизилгидроксилазы. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106397 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004846 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пассоя К., Раутавуома К., Ала-Кокко Л., Косонен Т., Кивирикко К.И. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика третьей изоформы лизилгидроксилазы человека» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (18): 10482–10486. Бибкод : 1998PNAS...9510482P . дои : 10.1073/pnas.95.18.10482 . ПМК 27920 . ПМИД 9724729 .
^ Валтаваара М., Шпирер С., Шпирер Дж., Мюллила Р. (июнь 1998 г.). «Первичная структура, распределение в тканях и хромосомная локализация новой изоформы лизилгидроксилазы (лизилгидроксилазы 3)» . J Биол Хим . 273 (21): 12881–12886. дои : 10.1074/jbc.273.21.12881 . ПМИД 9582318 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: проколлаген-лизин PLOD3, 2-оксоглутарат-5-диоксигеназа 3» .

Дальнейшее чтение

Сало А.М., Ван С., Сипиля Л. и др. (2006). «Лизилгидроксилаза 3 (LH3) модифицирует белки во внеклеточном пространстве, что представляет собой новый механизм ремоделирования матрикса». Дж. Селл. Физиол . 207 (3): 644–653. дои : 10.1002/jcp.20596 . ПМИД 16447251 . S2CID 19594208 .
Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . ДНК Рез . 12 (2): 117–126. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД 16303743 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Хиллер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК 7-й хромосомы человека» . Природа . 424 (6945): 157–164. Бибкод : 2003Natur.424..157H . дои : 10.1038/nature01782 . ПМИД 12853948 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ван С., Луосуярви Х., Хейккинен Дж. и др. (2003). «Третье действие лизилгидроксилазы 3: галактозилирование гидроксилизильных остатков в коллагенах in vitro». Матрица Биол . 21 (7): 559–566. дои : 10.1016/S0945-053X(02)00071-9 . ПМИД 12475640 .
Раутавуома К., Такалуома К., Пассоя К. и др. (2002). «Характеристика трех фрагментов, которые составляют мономеры изоферментов лизилгидроксилазы человека 1–3. N-концевой фрагмент массой 30 кДа не требуется для активности лизилгидроксилазы» . Ж. Биол. Хим . 277 (25): 23084–23091. дои : 10.1074/jbc.M112077200 . ПМИД 11956192 .
Руотсалайнен Х., Ванхатупа С., Тампио М. и др. (2001). «Полная геномная структура мышиной лизилгидроксилазы 2 и лизилгидроксилазы 3/коллагенглюкозилтрансферазы». Матрица Биол . 20 (2): 137–146. дои : 10.1016/S0945-053X(01)00130-5 . ПМИД 11334715 .
Хейккинен Дж., Ристели М., Ван С. и др. (2000). «Лизилгидроксилаза 3 представляет собой многофункциональный белок, обладающий активностью коллаген-глюкозилтрансферазы» . Ж. Биол. Хим . 275 (46): 36158–36163. дои : 10.1074/jbc.M006203200 . ПМИД 10934207 .
Раутавуома К., Пассоя К., Хелаакоски Т., Кивирикко К.И. (2000). «Полная экзон-интронная организация гена лизилгидроксилазы 3 человека (LH3)». Матрица Биол . 19 (1): 73–79. дои : 10.1016/S0945-053X(99)00058-X . ПМИД 10686427 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106397 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004846 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9724729-5] Пассоя К., Раутавуома К., Ала-Кокко Л., Косонен Т., Кивирикко К.И. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика третьей изоформы лизилгидроксилазы человека» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (18): 10482–10486. Бибкод : 1998PNAS...9510482P . дои : 10.1073/pnas.95.18.10482 . ПМК 27920 . ПМИД 9724729 .

[pmid9582318-6] Валтаваара М., Шпирер С., Шпирер Дж., Мюллила Р. (июнь 1998 г.). «Первичная структура, распределение в тканях и хромосомная локализация новой изоформы лизилгидроксилазы (лизилгидроксилазы 3)» . J Биол Хим . 273 (21): 12881–12886. дои : 10.1074/jbc.273.21.12881 . ПМИД 9582318 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: проколлаген-лизин PLOD3, 2-оксоглутарат-5-диоксигеназа 3» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]