SMARCA1

SMARCA1
Идентификаторы
Псевдонимы	SMARCA1 , ISWI, NURF140, SNF2L, SNF2L1, SNF2LB, SNF2LT, SWI, SWI2, hSNF2L, SWI/SNF-связанный, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, член 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 300012 ; МГИ : 1935127 ; Гомологен : 55711 ; Генные карты : SMARCA1 ; OMA : SMARCA1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	129,523,500 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	46,981,851 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Epithelium of choroid plexus; ; tibia; ; endothelial cell; ; ventricular zone; ; right adrenal cortex; ; left adrenal cortex; ; parietal pleura; ; seminal vesicula; ; stromal cell of endometrium; ; cartilage tissue;
	Top expressed in
	Gonadal ridge; ; vas deferens; ; fossa; ; efferent ductule; ; internal carotid artery; ; atrium; ; trigeminal ganglion; ; ureter; ; external carotid artery; ; ovary;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ATP-dependent DNA/DNA annealing activity; DNA binding; nucleotide binding; ATP-dependent activity, acting on DNA; helicase activity; hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides; protein binding; nucleic acid binding; nucleosome binding; hydrolase activity; ATP binding; transcription factor binding; ATPase activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	CERF complex; nucleus; nucleoplasm; intracellular membrane-bounded organelle; NURF complex;
Biological process	chromatin remodeling; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; brain development; neuron differentiation; chromatin organization; regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6594
	93761
	ENSG00000102038
	ENSMUSG00000031099
	P28370
	Q6PGB8
showНМ_001282874 ; НМ_001282875 ; НМ_003069 ; НМ_139035 ; НМ_001378261 ;
	NM_001378262; NM_001378263; NM_001378264
	НМ_001290708 ; НМ_053123 ; НМ_001358618 ; НМ_001358619
showНП_001269803 ; NP_001269804 ; НП_003060 ; НП_001365190 ; НП_001365191 ;
	NP_001365192; NP_001365193
	НП_001277637 ; НП_444353 ; НП_001345547 ; НП_001345548
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Вероятный глобальный активатор транскрипции SNF2L1 представляет собой белок , который у человека кодируется SMARCA1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства SWI/SNF белков . Члены этого семейства обладают геликазной и АТФазной активностью и, как полагают, регулируют транскрипцию определенных генов, изменяя структуру хроматина вокруг этих генов. два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена обнаружено ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000102038 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031099 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Окабе И., Бейли Л.К., Аттри О., Шринивасан С., Перкель Дж.М., Лоран Б.С., Карлсон М., Нельсон Д.Л., Нуссбаум Р.Л. (октябрь 1992 г.). «Клонирование человеческих и бычьих гомологов SNF2/SWI2: глобальный активатор транскрипции в дрожжах S. cerevisiae» . Нуклеиновые кислоты Рез . 20 (17): 4649–55. дои : 10.1093/нар/20.17.4649 . ПМК 334196 . ПМИД 1408766 .
^ Барак О., Лаззаро М.А., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Пикеттс DJ, Шихаттар Р. (ноябрь 2003 г.). «Выделение человеческого NURF: регулятор экспрессии гена Engrailed» . ЭМБО Дж . 22 (22): 6089–100. дои : 10.1093/emboj/cdg582 . ПМК 275440 . ПМИД 14609955 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Entrez: SMARCA1 SWI/SNF, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, член 1» .

Дальнейшее чтение

Боженок Л., Уэйд П.А., Варга-Вайс П. (2002). «Комплекс ремоделирования хроматина WSTF-ISWI нацелен на фокусы гетерохроматической репликации» . ЭМБО Дж . 21 (9): 2231–41. дои : 10.1093/emboj/21.9.2231 . ПМЦ 125993 . ПМИД 11980720 .
Магуайр П.Б., Винн К.Дж., Харни Д.Ф. и др. (2003). «Идентификация протеома фосфотирозина из активированных тромбином тромбоцитов» . Протеомика . 2 (6): 642–8. doi : 10.1002/1615-9861(200206)2:6<642::AID-PROT642>3.0.CO;2-I . ПМИД 12112843 . S2CID 22665513 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Барак О., Лаззаро М.А., Куч Н.С. и др. (2004). «Тканеспецифичный природный вариант SNF2L человека инактивирует ремоделирование хроматина» . Ж. Биол. Хим . 279 (43): 45130–8. дои : 10.1074/jbc.M406212200 . ПМИД 15310751 .
Ван Ф., Чжан Р., Beischlag TV и др. (2004). «Роль Брахмы и гена 1, связанного с Брахмой / SWI2, в гипоксической индукции гена эритропоэтина» . Ж. Биол. Хим . 279 (45): 46733–41. дои : 10.1074/jbc.M409002200 . ПМИД 15347669 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Бантинг Г.С., Барак О., Эймс Т.М. и др. (2005). «CECR2, белок, участвующий в нейруляции, образует новый комплекс ремоделирования хроматина с SNF2L» . Хм. Мол. Жене . 14 (4): 513–24. дои : 10.1093/hmg/ddi048 . ПМИД 15640247 .
Росс М.Т., Графэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека» . Природа . 434 (7031): 325–37. Бибкод : 2005Natur.434..325R . дои : 10.1038/nature03440 . ПМЦ 2665286 . ПМИД 15772651 .
Лаззаро М.А., Пепин Д., Пескадор Н. и др. (2006). «Белок переключения имитации SNF2L регулирует экспрессию стероидогенного острого регуляторного белка во время терминальной дифференцировки клеток гранулезы яичников» . Мол. Эндокринол . 20 (10): 2406–17. дои : 10.1210/me.2005-0213 . ПМИД 16740656 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000102038 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031099 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1408766-5] Окабе И., Бейли Л.К., Аттри О., Шринивасан С., Перкель Дж.М., Лоран Б.С., Карлсон М., Нельсон Д.Л., Нуссбаум Р.Л. (октябрь 1992 г.). «Клонирование человеческих и бычьих гомологов SNF2/SWI2: глобальный активатор транскрипции в дрожжах S. cerevisiae» . Нуклеиновые кислоты Рез . 20 (17): 4649–55. дои : 10.1093/нар/20.17.4649 . ПМК 334196 . ПМИД 1408766 .

[pmid14609955-6] Барак О., Лаззаро М.А., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Пикеттс DJ, Шихаттар Р. (ноябрь 2003 г.). «Выделение человеческого NURF: регулятор экспрессии гена Engrailed» . ЭМБО Дж . 22 (22): 6089–100. дои : 10.1093/emboj/cdg582 . ПМК 275440 . ПМИД 14609955 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Entrez: SMARCA1 SWI/SNF, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, член 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]