Малая специфичная для тела Кахаля РНК 18
малая специфичная для организма РНК Кахаля 18 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SCARNA18 | |
Идентификаторы | |
Символ | СКАРНА18 |
Альт. Символы | U91 |
Рфам | RF00283 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; скаРНК |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0015030 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000275 |
PDB Структуры | ПДБе |
малая специфичная для тела Кахаля РНК 18 (также известная как U91 или U4-8 ) представляет собой тип малой ядерной РНК , которая локализуется в телецах Кахаля и, как предполагается, управляет модификацией РНК-полимеразы II, транскрибируемой сплайсосомальными РНК U1 , U2 , U4 , U5. и U12 . [ 1 ]
Эта мякРНК U91, по-видимому, принадлежит к C/D-бокса . классу мякРНК [ 2 ] Он был идентифицирован Дарзаком. [ 1 ] и, по прогнозам, управляет метилированием 2'O-рибозы U4 мяРНК C8. Позже было обнаружено, что этот домен C/D связан с другим доменом C/D U12-22 . Как дублетная (U12-22/U4-8), так и синглетная (U4-8) формы этой мяРНК были выделены из клеток Hela. [ 1 ] Было показано, что дублетная форма U12-22/U4-8 локализуется в нуклеоплазме и, как предполагается, находится в тельцах Кахаля, тогда как одиночный домен U4-8, по-видимому, накапливается в ядрышке. [ 3 ] У людей геномное расположение U12-88/U4-8 является межгенным, и было показано, что очищенный транскрипт обладает метилированным гуанозиновым кэпом, что позволяет предположить, что он независимо транскрибируется РНК pol II. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (2002). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс направляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . ЭМБО Дж . 21 (11): 2746–56. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Jump up to: а б Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Дополнение 1: Проблема с базой данных): D158–D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]