Малая специфичная для тела Кахаля РНК 20

Малая специфичная для тела Кахаля РНК 20
Малая специфичная для тела Кахаля РНК 20
	Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SCARNA20
Идентификаторы
Символ	СКАРНА20
Рфам	РФ00601
Другие данные
РНК Тип	Джин ; мяРНК ; мякРНК ; скаРНК
Домен(ы)	Эукариоты
ИДТИ	ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0015030 ПОЙДИТЕ: 0005730
ТАК	ТАК: 0000275
PDB Структуры	ПДБе

В молекулярной биологии малая специфичная для телец Кахаля РНК 20 (также известная как scaRNA20 или ACA66 ) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, обнаруженную в тельцах Кахаля и, как полагают, участвует в минорной псевдоуридилировании сплайсосомальной РНК U12 .

scaRNAs представляют собой специфический класс малых ядрышковых РНК , которые локализуются в тельцах Кахаля и направляют модификацию РНК-полимеразой II , транскрибируемых сплайсосомальных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12 . ^{[ 1 ]}

ACA66 (SCARNA20) является членом класса H/ACA-бокса мякРНК, которые направляют сайты модификации уридинов в псевдоуридины. Эта мякРНК была идентифицирована с помощью компьютерного скрининга, а ее экспрессия у мышей экспериментально подтверждена с помощью нозерн-блоттинга и анализа удлинения праймера. ^{[ 2 ]} Предполагается, что ACA66 управляет псевдоуридилированием остатка U28 в мяРНК U12. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс 2'-O-метилирования и направляющих псевдоуридилирования РНК» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–2756. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
^ Шаттнер П., Барберан-Солер С., Лоу Т.М. (январь 2006 г.). «Вычислительный скрининг направляющих псевдоуридилирования РНК H/ACA млекопитающих» . РНК . 12 (1): 15–25. дои : 10.1261/rna.2210406 . ПМЦ 1370881 . ПМИД 16373490 .
^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .

Внешние ссылки

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid12032087-1] Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс 2'-O-метилирования и направляющих псевдоуридилирования РНК» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–2756. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .

[pmid16373490-2] Шаттнер П., Барберан-Солер С., Лоу Т.М. (январь 2006 г.). «Вычислительный скрининг направляющих псевдоуридилирования РНК H/ACA млекопитающих» . РНК . 12 (1): 15–25. дои : 10.1261/rna.2210406 . ПМЦ 1370881 . ПМИД 16373490 .

[pmid16381836-3] Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]