Малая специфичная для тела Кахаля РНК 8
Малая специфичная для тела Кахаля РНК 8 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SCARNA8 | |
Идентификаторы | |
Символ | СКАРНА8 |
Альт. Символы | U92 |
Рфам | RF00286 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; скаРНК |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0015030 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000275 |
PDB Структуры | ПДБе |
Малая специфичная для телец Кахаля РНК 8 (также известная как SCARNA8 или U92 ) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, в тельцах Кахаля и предположительно участвующую в псевдоуридилировании ( изомеризации уридина обнаруживаемую в псевдоуридин ) сплайсосомальной РНК U2 .
scaRNAs представляют собой специфический класс малых ядрышковых РНК , которые локализуются в тельцах Кахаля и направляют модификацию РНК-полимеразой II , транскрибируемых сплайсосомальных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12 . [ 1 ]
U92 принадлежит к классу направляющих РНК H/ACA-бокса , поскольку он имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост», консервативные мотивы H/ACA-бокса и обнаружен связанный с GAR1. [ 1 ] Предполагается, что он управляет псевдоуридилированием остатков U44 в мяРНК U2. [ 1 ] Эта мякРНК родственна мякРНК H/ACA-бокса мыши MBI-57. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс направляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–56. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .