Малая специфичная для тела Кахаля РНК 24
Малая специфичная для тела Кахаля РНК 24 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SCARNA24 | |
Идентификаторы | |
Символ | СКАРНА24 |
Альт. Символы | snoACA12 |
Рфам | RF00422 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; скаРНК |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0015030 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000275 |
PDB Структуры | ПДБе |
Малая специфичная для телец Кахаля РНК 24 (также известная как scaRNA24 или ACA12 ) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, в тельцах Кахаля и предположительно участвующую в псевдоуридилировании ( изомеризации уридина обнаруживаемую в псевдоуридин ) сплайсосомальной РНК U6 .
scaRNAs представляют собой специфический класс малых ядрышковых РНК , которые локализуются в тельцах Кахаля и направляют модификацию РНК-полимеразой II , транскрибируемых сплайсосомальных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12 . [ 1 ]
ACA12 принадлежит к классу направляющих РНК H/ACA-бокса , поскольку он имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост», консервативные мотивы H/ACA-бокса и ассоциирован с белком GAR1 . [ 2 ] Предполагается, что ACA12 управляет псевдоуридилированием остатка U40 сплайсосомной мяРНК U6. [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс направляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–56. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
- ^ Jump up to: а б Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .