Малая специфичная для тела Кахаля РНК 6

Малая специфичная для тела Кахаля РНК 6
Малая специфичная для тела Кахаля РНК 6
	Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SCARNA6
Идентификаторы
Символ	СКАРНА6
Альт. Символы	U88
Рфам	RF00478
Другие данные
РНК Тип	Джин ; мяРНК ; мякРНК ; скаРНК
Домен(ы)	Эукариоты
ИДТИ	ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730
ТАК	ТАК: 0000275
PDB Структуры	ПДБе

Малая специфичная для телец Кахаля РНК 6 (также известная как SCARNA6 или U88 ) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, в тельцах Кахаля и предположительно участвующую в псевдоуридилировании ( изомеризации уридина обнаруживаемую в псевдоуридин ) сплайсосомальной РНК U5 .

scaРНК представляют собой особый класс малых ядрышковых РНК , которые локализуются в тельцах Кахаля и управляют модификацией РНК-полимеразой II, , транскрибируемых сплайсосомальных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12. ^{[ 1 ]}

U88 связан как с фибрилларином, так и с Gar1p, и локализуется совместно с коилином в тельцах Кахаля. ^{[ 1 ]} Это необычная направляющая РНК, поскольку она состоит из консервативных доменов как H/ACA-бокса , так и C/D-бокса . Предполагается, что он управляет 2'- O -метилированием остатка U41 мяРНК U5. ^{[ 1 ]}

U88 также тесно связан с другими мякРНК человека scaRNA U87 и мышиным гомологом MBI-46. ^{[ 2 ]} В геноме человека scaРНК U88 и U87 имеют один и тот же ген-хозяин. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс направляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–56. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .

Внешние ссылки

Страница с малой специфичной для тела Кахаля РНК 6 в Rfam
Запись о SCARNA6 на сайте snoRNABase

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid12032087-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс направляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–56. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .

[pmid11387227-2] Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .

[pmid16381836-3] Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]