Малая специфичная для тела Кахаля РНК 15
| Малая специфичная для тела Кахаля РНК 15 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SCARNA15 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СКАРНА15 |
| Альт. Символы | snoACA45 |
| Рфам | RF00426 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; скаРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0015030 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000275 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Малая специфичная для телец Кахаля РНК 15 (также известная как SCARNA15 или ACA45 ) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, в тельцах Кахаля и предположительно участвующую в псевдоуридилировании ( изомеризации уридина обнаруживаемую в псевдоуридин ) сплайсосомной РНК U1 .
scaRNAs представляют собой специфический класс малых ядрышковых РНК , которые локализуются в тельцах Кахаля и направляют модификацию РНК-полимеразой II , транскрибируемых сплайсосомальных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12 . [ 1 ]
ACA45 принадлежит к классу направляющих РНК H/ACA-бокса , поскольку он имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост», консервативные мотивы H/ACA-бокса и обнаруживается, что он связан с GAR1. [ 2 ] Предполагается, что ACA45 управляет псевдоуридилированием остатка U37 сплайсосомной мяРНК U2. [ 3 ]
Было показано, что человеческая ACA45 может процессироваться в длиной 21 нуклеотид зрелую микроРНК с помощью семейства РНКазы III эндорибонуклеазы dicer . [ 4 ] Этот продукт мякРНК ранее был идентифицирован как mmu-miR-1839. [ 5 ] и было показано, что он процессируется независимо от другой микроРНК, генерирующей эндорибонуклеазу дроша . [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс направляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–56. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Эндер С., Крек А., Фридлендер М.Р., Бейтцингер М., Вайнманн Л., Чен В., Пфеффер С., Раевски Н., Мейстер Г. (ноябрь 2008 г.). «Человеческая мяРНК с функциями, подобными микроРНК» . Молекулярная клетка . 32 (4): 519–28. doi : 10.1016/j.molcel.2008.10.017 . ПМИД 19026782 .
- ^ "ммму-миР-1839" . МиРБаза .
- ^ Бабиарз Дж. Э., Руби Дж. Г., Ван Й., Бартель Д. П., Блеллох Р. (октябрь 2008 г.). «Мышиные ES-клетки экспрессируют эндогенные shRNA, siRNA и другие независимые от микропроцессора и Dicer-зависимые малые РНК» . Гены и развитие . 22 (20): 2773–85. дои : 10.1101/gad.1705308 . ПМК 2569885 . ПМИД 18923076 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |