ППЭФ1

ППЭФ1
Идентификаторы
Псевдонимы	PPEF1 , PP7, PPEF, PPP7C, PPP7CA, протеинфосфатаза с доменом EF-hand 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 300109 ; МГИ : 1097157 ; Гомологен : 55960 ; GeneCards : PPEF1 ; OMA : PPEF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	18,827,921 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	159,518,761 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; secondary oocyte; ; endothelial cell; ; spinal ganglia; ; testicle; ; left testis; ; right testis; ; C1 segment; ; prefrontal cortex; ; orbitofrontal cortex;
	Top expressed in
	spermatid; ; secondary oocyte; ; zygote; ; testicle; ; primary oocyte; ; spermatocyte; ; spinal ganglia; ; embryo; ; embryo; ; ganglion of neuraxis;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	iron ion binding; calcium ion binding; protein serine/threonine phosphatase activity; phosphoprotein phosphatase activity; manganese ion binding; hydrolase activity; metal ion binding; protein binding;
Cellular component	cytosol; nucleus;
Biological process	protein dephosphorylation; detection of stimulus involved in sensory perception; regulation of rhodopsin mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5475
	237178
	ENSG00000086717
	ENSMUSG00000062168
	О14829
	О35655
showНМ_006240 ; НМ_152223 ; НМ_152224 ; НМ_152225 ; НМ_152226 ;
	NM_001377986; NM_001377993; NM_001377994; NM_001377995; NM_001377996; NM_001378381; NM_001378382; NM_001389620; NM_001389621; NM_001389623; NM_001389624
	НМ_011147
showНП_006231 ; НП_689410 ; НП_689412 ; НП_001364915 ; НП_001364922 ;
	NP_001364923; NP_001364924; NP_001364925; NP_001365310; NP_001365311
	НП_035277
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Серин/треонин-протеинфосфатаза с EF-руками 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется PPEF1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена серин/треонинового протеинфосфатазы с семейством мотивов EF-hand. Белок содержит каталитический домен протеинфосфатазы и по меньшей мере два кальцийсвязывающих мотива EF-hand на С-конце. Хотя его субстрат(ы) неизвестен, предполагается, что кодируемый белок играет роль в специфической функции и/или развитии сенсорных нейронов. Этот ген имеет большое сходство последовательности с геном дегенерации сетчатки сетчатки дрозофилы (rdgC). Описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, каждый из которых кодирует отдельную изоформу. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PPEF1 взаимодействует с кальмодулином 1 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000086717 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062168 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Монтини Э., Ругарли Э.И., Ван де Воссе Э., Андольфи Г., Мариани М., Пука А.А., Консалес Г.Г., ден Даннен Дж.Т., Баллабио А., Франко Б (июль 1997 г.). «Новая серин-треониновая фосфатаза человека, родственная гену C дегенерации сетчатки дрозофилы (rdgC), избирательно экспрессируется в сенсорных нейронах нервного гребня» . Молекулярная генетика человека . 6 (7): 1137–45. дои : 10.1093/hmg/6.7.1137 . ПМИД 9215685 .
^ Шерман П.М., Сан Х., Маке Дж.П., Уильямс Дж., Смоллвуд П.М., Натанс Дж. (октябрь 1997 г.). «Идентификация и характеристика консервативного семейства белков серин/треонинфосфатаз, гомологичных дегенерации сетчатки C дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11639–44. дои : 10.1073/pnas.94.21.11639 . ПМК 23563 . ПМИД 9326663 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: протеинфосфатаза PPEF1, кальцийсвязывающий домен 1 EF-hand» .
^ Кутузов М.А., Соловьева О.В., Андреева А.В., Беннетт Н. (май 2002 г.). «Протеиновые Ser/Thr-фосфатазы PPEF взаимодействуют с кальмодулином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 293 (3): 1047–52. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00338-8 . ПМИД 12051765 .

Дальнейшее чтение

Херциг С., Нойман Дж. (январь 2000 г.). «Влияние серин/треониновых протеинфосфатаз на ионные каналы в возбудимых мембранах». Физиологические обзоры . 80 (1): 173–210. дои : 10.1152/physrev.2000.80.1.173 . ПМИД 10617768 . S2CID 17770945 .
Хуан X, Хонканен Р.Э. (январь 1998 г.). «Молекулярное клонирование, экспрессия и характеристика новой серин/треониновой протеинфосфатазы человека, PP7, которая гомологична продукту гена C-дегенерации сетчатки дрозофилы (rdgC)» . Журнал биологической химии . 273 (3): 1462–8. дои : 10.1074/jbc.273.3.1462 . ПМИД 9430683 .
Рамулу П., Кеннеди М., Сюн В.Х., Уильямс Дж., Коуэн М., Блеш Д., Яу К.В., Херли Дж.Б., Натанс Дж. (декабрь 2001 г.). «Нормальная реакция на свет, целостность фоторецепторов и дефосфорилирование родопсина у мышей, у которых отсутствуют обе протеинфосфатазы с руками EF (PPEF-1 и PPEF-2)» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (24): 8605–14. дои : 10.1128/MCB.21.24.8605-8614.2001 . ПМК 100021 . ПМИД 11713293 .
Кутузов М.А., Соловьева О.В., Андреева А.В., Беннетт Н. (май 2002 г.). «Протеиновые Ser/Thr-фосфатазы PPEF взаимодействуют с кальмодулином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 293 (3): 1047–52. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00338-8 . ПМИД 12051765 .
Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Хиллман Р.Т., Грин Р.Э., Бреннер С.Е. (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК» . Геномная биология . 5 (2): С8. дои : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . ПМЦ 395752 . ПМИД 14759258 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000086717 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062168 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9215685-5] Монтини Э., Ругарли Э.И., Ван де Воссе Э., Андольфи Г., Мариани М., Пука А.А., Консалес Г.Г., ден Даннен Дж.Т., Баллабио А., Франко Б (июль 1997 г.). «Новая серин-треониновая фосфатаза человека, родственная гену C дегенерации сетчатки дрозофилы (rdgC), избирательно экспрессируется в сенсорных нейронах нервного гребня» . Молекулярная генетика человека . 6 (7): 1137–45. дои : 10.1093/hmg/6.7.1137 . ПМИД 9215685 .

[pmid9326663-6] Шерман П.М., Сан Х., Маке Дж.П., Уильямс Дж., Смоллвуд П.М., Натанс Дж. (октябрь 1997 г.). «Идентификация и характеристика консервативного семейства белков серин/треонинфосфатаз, гомологичных дегенерации сетчатки C дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11639–44. дои : 10.1073/pnas.94.21.11639 . ПМК 23563 . ПМИД 9326663 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: протеинфосфатаза PPEF1, кальцийсвязывающий домен 1 EF-hand» .

[pmid12051765-8] Кутузов М.А., Соловьева О.В., Андреева А.В., Беннетт Н. (май 2002 г.). «Протеиновые Ser/Thr-фосфатазы PPEF взаимодействуют с кальмодулином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 293 (3): 1047–52. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00338-8 . ПМИД 12051765 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]