Дансилхлорид
| |
| |
| Имена | |
|---|---|
| Предпочтительное название ИЮПАК
5-(Диметиламино)нафталин-1-сульфонилхлорид | |
| Идентификаторы | |
3D model ( JSmol )
|
|
| КЭБ | |
| ХимическийПаук | |
| Информационная карта ECHA | 100.009.175 |
ПабХим CID
|
|
| номер РТЭКС |
|
| НЕКОТОРЫЙ | |
Панель управления CompTox ( EPA )
|
|
| Характеристики | |
| С 12 Н 12 Cl NO 2 S | |
| Молярная масса | 269.74 g·mol −1 |
| Температура плавления | 70 ° C (158 ° F; 343 К) |
| Опасности | |
| СГС Маркировка : | |
| |
| H314 | |
| P260 , P264 , P280 , P303+P361+P353 , P304+P340 , P305+P351+P338 , P310 , P321 , P363 , P405 , P501 | |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
| |
Дансилхлорид или 5-(диметиламино)нафталин-1-сульфонилхлорид представляет собой реагент, который реагирует с первичными аминогруппами как в алифатических, так и в ароматических аминах с образованием стабильных сине- или сине-зелено- флуоресцентных сульфонамидных аддуктов. Его также можно ввести в реакцию с вторичными аминами. Дансилхлорид широко используется для модификации аминокислот; в частности, секвенирование белков и аминокислот . анализ [ 2 ] [ 3 ] Дансилхлорид также может обозначаться DNSC . Аналогично, аналогичное производное, дансиламид, известно как DNSA.
Кроме того, эти конъюгаты белок-ДНСК чувствительны к своему непосредственному окружению. Это, в сочетании с их способностью принимать энергию (как при резонансном переносе энергии флуоресценции ) от аминокислоты триптофана , позволяет использовать этот метод мечения при исследовании сворачивания и динамики белков.
Флуоресценцию этих сульфонамидных аддуктов можно усилить добавлением альфа-циклодекстрина . [ 4 ] Дансилхлорид неустойчив в диметилсульфоксиде , который ни в коем случае нельзя использовать для приготовления растворов реагента. [ 5 ]
Коэффициент экстинкции производных дансила важен для измерения их концентрации в растворе. Дансилхлорид — одно из простейших производных сульфонамида, поэтому он обычно служит исходным реагентом для производства других производных. Экзотические производные могут иметь очень разные коэффициенты экстинкции, но другие, такие как дансиламид , аналогичны дансилхлориду по характеристикам поглощения и флуоресценции. Но даже для дансилхлорида имеются различные значения коэффициента экстинкции. Некоторые значения используются для оценки степени успеха попыток конъюгировать краситель с белком. Другие значения могут использоваться для определения точной концентрации исходного раствора. В таблице ниже приведены конкретные значения и их использование.
Для всех исследований, приведенных ниже, значение поглощения всегда принимается по максимуму , который появляется между 310 и 350 нм. Пик широкий, поэтому измерение не очень чувствительно к неправильной калибровке длины волны спектрофотометра, и ошибки из-за неправильной калибровки можно избежать, приняв максимальное значение вместо строгого использования 330 нм.
| Разновидность | Коэффициент вымирания [M −1 ·см −1 ] | Примечания |
|---|---|---|
| DNSC-белок | 3300 [ 6 ] | Использование для конъюгатов DNSC-белок; Используется для определения степени мечения химотрипсина и овальбумина. |
| DNSC | 4350 [ 7 ] | В бикарбонатном буфере; максимум сдвинут до ~315 нм |
| DNSC | 4550 [ 8 ] | В воде; пик сдвинут до 312 нм |
| DNSA | 4050 [ 8 ] | В 60% этаноле; Измерено при длине волны 329 нм |
| DNSC | 4000 [ 9 ] | Условия не указаны; нет ссылки на источник этого значения |
Подготовка
[ редактировать ]Это соединение можно получить путем взаимодействия соответствующей сульфоновой кислоты с избытком оксихлорида фосфора (POCl 3 ) при комнатной температуре. [ 10 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Паспорт безопасности» . Сигма-Олдрич . Архивировано из оригинала 27 декабря 2007 г. Проверено 2 декабря 2007 г.
- ^ Уокер Дж. М. (1994). «Метод Дэнсила для идентификации N-концевых аминокислот». Основные белковые и пептидные протоколы . Методы Мол. Биол. Том. 32. С. 321–8. дои : 10.1385/0-89603-268-X:321 . ISBN 0-89603-268-Х . ПМИД 7951732 .
- ^ Уокер Дж. М. (1994). «Метод Дэнсила-Эдмана для секвенирования пептидов». Основные белковые и пептидные протоколы . Методы Мол. Биол. Том. 32. С. 329–34. дои : 10.1385/0-89603-268-X:329 . ISBN 0-89603-268-Х . ПМИД 7951733 .
- ^ Киносита Т., Иинума Ф., Цудзи А. (1974). «Микроанализ белков и пептидов. I. Повышение интенсивности флуоресценции дансиламинокислот и дансилбелков в водных средах и его применение для анализа аминокислот и белков» . хим. Фарм. Бык . 22 (10): 2413–20. дои : 10.1248/cpb.22.2413 . ПМИД 4468087 .
- ^ Бойл, RE (1966). «Реакция диметилсульфоксида и 5-диметиламинонафталин-1-сульфонилхлорида». Журнал органической химии . 31 (11): 3880–3882. дои : 10.1021/jo01349a529 .
- ^ Хартли, бакалавр наук; В. Мэсси (1956). «Активный центр химотрипсина: 1. Мечение флуоресцентным красителем». Биохимика и биофизика Acta . 21 (1): 58–70. дои : 10.1016/0006-3002(56)90093-2 . ПМИД 13363860 .
- ^ Чен, РФ (1968). «Белки, меченные дансилом». Аналитическая биохимия . 25 (1): 412–416. дои : 10.1016/0003-2697(68)90116-4 . ПМИД 5704757 .
- ^ Jump up to: а б Вебер, Г. (1952). «Поляризованная флуоресценция белковых конъюгатов» . Биохимический журнал . 51 (2): 145–155. дои : 10.1042/bj0510145 . ПМК 1197814 . ПМИД 14944566 .
- ^ «Справочник по молекулярным зондам: кумарины, пирены и другие флуорофоры, возбудимые ультрафиолетовым светом (раздел 1.7)» . Проверено 12 июня 2009 г.
- ^ Артур Мендель (1970). «Улучшенный препарат 5-диметиламино-1-нафталинсульфонилхлорида». Дж. Хим. англ. Данные . 15 (2): 340–341. дои : 10.1021/je60045a010 .