СИНПО

СИНПО
Идентификаторы
Псевдонимы	СИНПО , синаптоподин
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608155 ; МГИ : 1099446 ; Гомологен : 5274 ; GeneCards : SYNPO ; ОМА : СИНПО - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	150,659,207 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	60,793,214 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; apex of heart; ; Descending thoracic aorta; ; gastrocnemius muscle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; ascending aorta; ; right coronary artery; ; right auricle; ; tendon of biceps brachii; ; left ventricle;
	Top expressed in
	ascending aorta; ; aortic valve; ; muscle of thigh; ; external carotid artery; ; tunica media of zone of aorta; ; lumbar spinal ganglion; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; cumulus cell; ; ankle joint;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; actin binding;
Cellular component	cytoplasm; perikaryon; cell junction; postsynaptic membrane; dendritic spine; plasma membrane; cell projection; synapse; cytoskeleton; membrane; postsynaptic density; bicellular tight junction; Z discdkac; nucleus; actin cytoskeleton; stress fiber; spine apparatus; Schaffer collateral - CA1 synapse; glutamatergic synapse;
Biological process	positive regulation of actin filament bundle assembly; regulation of stress fiber assembly; spine apparatus assembly; visual learning; regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; modification of dendritic spine; postsynaptic modulation of chemical synaptic transmission; positive regulation of postsynaptic cytosolic calcium concentration;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11346
	104027
	ENSG00000171992
	ENSMUSG00000043079
	Q8N3V7
	Q8CC35
	НМ_001109974 ; НМ_001166208 ; НМ_001166209 ; НМ_007286
	НМ_001109975 ; НМ_177340
	НП_001103444 ; НП_001159680 ; НП_001159681 ; НП_009217
	НП_001103445 ; НП_796314
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Синаптоподин — это белок , который у человека кодируется SYNPO геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Синаптоподин представляет собой актин-ассоциированный белок, который может играть роль в форме и подвижности клеток, основанных на актине. Название синаптоподин происходит от ассоциации белка с постсинаптической плотностью и дендритными шипами, а также с подоцитами почек (Mundel et al., 1997). [предоставлено OMIM] ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что SYNPO взаимодействует с MAGI1 . ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171992 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043079 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мандел П., Хайд Х.В., Мандел Т.М., Крюгер М., Райзер Дж., Криц В. (октябрь 1997 г.). «Синаптоподин: актин-ассоциированный белок в дендритах телэнцефала и подоцитах почек» . Журнал клеточной биологии . 139 (1): 193–204. дои : 10.1083/jcb.139.1.193 . ПМК 2139823 . ПМИД 9314539 .
^ Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: синаптоподин SYNPO» .
^ Патри К.М., Дрешер А.Дж., Велихинда А., Мандел П., Марголис Б. (август 2002 г.). «Взаимодействие двух актин-связывающих белков, синаптоподина и альфа-актинина-4, с белком плотного соединения MAGI-1» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30183–90. дои : 10.1074/jbc.M203072200 . ПМИД 12042308 .

Дальнейшее чтение

Адамс МД, Керлавадж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Балт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Э.Ф., Вайнсток К.Г., Гокейн Дж.Д., Уайт О (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и моделей экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Природа . 377 (6547 Приложение): 3–174. ПМИД 7566098 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Патри К.М., Дрешер А.Дж., Велихинда А., Мандел П., Марголис Б. (август 2002 г.). «Взаимодействие двух актин-связывающих белков, синаптоподина и альфа-актинина-4, с белком плотного соединения MAGI-1» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30183–90. дои : 10.1074/jbc.M203072200 . ПМИД 12042308 .
Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Тиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накаи К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Хе Дж.К., Хусейн М., Сунамото М., Д'Агати В.Д., Клотман М.Е., Айенгар Р., Клотман П.Е. (сентябрь 2004 г.). «Nef стимулирует пролиферацию подоцитов клубочков посредством активации Src-зависимых путей Stat3 и MAPK1,2» . Журнал клинических исследований . 114 (5): 643–51. дои : 10.1172/JCI21004 . ПМК 514582 . ПМИД 15343382 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа XM, Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Кремерскотен Дж., Плаас С., Киндлер С., Фротчер М., Барнеков А. (февраль 2005 г.). «Синаптоподин, молекула, участвующая в формировании дендритного аппарата позвоночника, представляет собой двойной белок, связывающий актин/альфа-актинин». Журнал нейрохимии . 92 (3): 597–606. дои : 10.1111/j.1471-4159.2004.02888.x . ПМИД 15659229 . S2CID 1837841 .
Асанума К., Ким К., О Дж., Джардино Л., Чабанис С., Фаул С., Райзер Дж., Мандел П. (май 2005 г.). «Синаптоподин регулирует активность альфа-актинина, связывающую актин, специфичным для изоформы способом» . Журнал клинических исследований . 115 (5): 1188–98. дои : 10.1172/JCI23371 . ПМЦ 1070637 . ПМИД 15841212 .
Хусейн М., Д'Агати В.Д., Хе Дж.К., Клотман М.Е., Клотман П.Е. (ноябрь 2005 г.). «ВИЧ-1 Nef индуцирует дедифференцировку подоцитов in vivo: характерная особенность ВИЧАН» . СПИД . 19 (17): 1975–80. дои : 10.1097/01.aids.0000191918.42110.27 . ПМИД 16260903 . S2CID 40286329 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Хиракава М., Цуруя К., Ёцуэда Х., Токумото М., Икеда Х., Катафучи Р., Фуджими С., Хираката Х., Иида М. (июль 2006 г.). «Экспрессия синаптоподина и GLEPP1 как маркеров чувствительности к стероидам при первичном фокально-сегментарном гломерулосклерозе». Науки о жизни . 79 (8): 757–63. дои : 10.1016/j.lfs.2006.02.031 . ПМИД 16564554 .
Асанума К., Янагида-Асанума Э., Фаул С., Томино Ю., Ким К., Мандел П. (май 2006 г.). «Синаптоподин управляет организацией актина и подвижностью клеток посредством регуляции передачи сигналов RhoA». Природная клеточная биология . 8 (5): 485–91. дои : 10.1038/ncb1400 . ПМИД 16622418 . S2CID 12861229 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Гарович В.Д., Вагнер С.Дж., Петрович Л.М., Грей CE, Холл П., Сугимото Х., Каллури Р., Гранде Дж.П. (апрель 2007 г.). «Кломерулярная экспрессия нефрина и синаптоподина, но не подоцина, снижается в срезах почек у женщин с преэклампсией» . Нефрология, Диализ, Трансплантация . 22 (4): 1136–43. дои : 10.1093/ndt/gfl711 . ПМИД 17255128 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171992 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043079 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9314539-5] Мандел П., Хайд Х.В., Мандел Т.М., Крюгер М., Райзер Дж., Криц В. (октябрь 1997 г.). «Синаптоподин: актин-ассоциированный белок в дендритах телэнцефала и подоцитах почек» . Журнал клеточной биологии . 139 (1): 193–204. дои : 10.1083/jcb.139.1.193 . ПМК 2139823 . ПМИД 9314539 .

[pmid10470851-6] Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: синаптоподин SYNPO» .

[pmid12042308-8] Патри К.М., Дрешер А.Дж., Велихинда А., Мандел П., Марголис Б. (август 2002 г.). «Взаимодействие двух актин-связывающих белков, синаптоподина и альфа-актинина-4, с белком плотного соединения MAGI-1» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30183–90. дои : 10.1074/jbc.M203072200 . ПМИД 12042308 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]