ЭсыН
| Оригинальный автор(ы) | Кембриджский центр системной биологии |
|---|---|
| Первоначальный выпуск | Сентябрь 2014 г. |
| Стабильная версия | 2.1 / 17 января 2016 г |
| Написано в | JavaScript |
| Тип | Программное обеспечение для биоинформатики |
| Веб-сайт | www |
esyN (Простые сети) [1] [2] — биоинформатический веб-инструмент для визуализации , построения и анализа сетей молекулярного взаимодействия . esyN основан на Cytoscape.js, и его цель — облегчить каждому выполнение сетевого анализа. esyN связан с рядом баз данных, в частности: Pombase, Flybase и большинством хранилищ данных InterMine , DrugBank и BioGRID , из которых можно загрузить белок-белок или генетические взаимодействия для любого белка или гена в ряде различных организмов.
Сети, опубликованные в esyN, можно легко опубликовать на других веб-сайтах с помощью <iframe> методология. [3]
Использование [ править ]
по состоянию на январь 2016 года esyN просматривают 1500 уникальных пользователей в день (около 16 000 в месяц) По данным Google Analytics, .
Возможности встраивания esyN используются рядом баз данных для отображения данных их взаимодействия:
См. также [ править ]
- Вычислительная геномика
- Моделирование метаболической сети
- Прогнозирование белок-белкового взаимодействия
Ссылки [ править ]
- ^ Боб; и др. (2014). «esyN: построение сети, совместное использование и публикация» . ПЛОС ОДИН . 9 (9): е106035. дои : 10.1371/journal.pone.0106035 . ПМЦ 4152123 . ПМИД 25181461 .
- ^ Хоффман; и др. (2015). «Древние дрожжи для молодых генетиков: введение в модельную систему Schizosaccharomyces pombe» . Генетика . 201 (2): 403–423. doi : 10.1534/genetics.115.181503 . ПМЦ 4596657 . ПМИД 26447128 .
- ^ «Учебник: Добро пожаловать в esyN» . esyN.org . 2018 . Проверено 10 февраля 2019 г.
- ^ «Отчет о физическом взаимодействии» . ФлайБейс . 21 декабря 2018 года . Проверено 10 февраля 2019 г.
- ^ «Аллель: ttk[MI01174] D. melanogaster» . ФлайМайн . Ноябрь 2018 года . Проверено 10 февраля 2019 г.
- ^ «Страница отчета» . ЧеловекМой . Ноябрь 2018 года . Проверено 10 февраля 2019 г.
- ^ «Делящиеся дрожжи GO slim» . ПомБаза . Проверено 10 февраля 2019 г.