CHMP1A

CHMP1A
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 2JQ9, 2YMB, 4A5X
Идентификаторы
Псевдонимы	CHMP1A , CHMP1, PCH8, PCOLN3, PRSM1, VPS46-1, VPS46A, заряженный мультивестный белок тела 1A 1A
Внешние идентификаторы	Омим : 164010 ; MGI : 1920159 ; Гомологен : 56240 ; GeneCards : CHMP1A ; OMA : CHMP1A - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 16 (human) Band 16q24.3 Start 89,640,816 bp End 89,657,738 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 8 (mouse) Band 8|8 E1 Start 123,931,003 bp End 123,939,502 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in mucosa of transverse colon left testis right testis granulocyte right uterine tube skin of leg skin of abdomen body of stomach right frontal lobe cingulate gyrus Top expressed in lip granulocyte esophagus transitional epithelium of urinary bladder right kidney interventricular septum stroma of bone marrow duodenum dentate gyrus of hippocampal formation granule cell intestinal villus More reference expression data BioGPS n/a
showДжин Онтология Molecular function protein homodimerization activity protein domain specific binding zinc ion binding protein binding identical protein binding metallopeptidase activity Cellular component cytoplasm endosome membrane microtubule organizing center condensed nuclear chromosome early endosome endosome membrane extracellular exosome endomembrane system nucleus nuclear matrix ESCRT III complex multivesicular body Biological process carbon catabolite repression of transcription by glucose regulation of centrosome duplication regulation of transcription, DNA-templated viral budding via host ESCRT complex nucleus organization multivesicular body assembly regulation of mitotic spindle assembly transcription, DNA-templated cell division protein transport cell cycle septum digestion after cytokinesis mitotic metaphase plate congression negative regulation of transcription, DNA-templated vacuolar transport ESCRT III complex disassembly proteolysis mitotic chromosome condensation vesicle-mediated transport transport endosome transport via multivesicular body sorting pathway late endosome to vacuole transport negative regulation of cell cycle midbody abscission Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 5119 234852 Набор ENSG00000131165 Ensmusg00000000743 Uniprot Q9HD42 Q921W0 Refseq (мРНК) NM_001083314 NM_002768 NM_145606 Refseq (белок) NP_001076783 NP_002759 NP_663581 Расположение (UCSC) CHR 16: 89,64 - 89,66 МБ Chr 8: 123,93 - 123,94 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Заряженный мультивескулярный белок тела 1а является белком , который у людей кодируется CHMP1A геном .

Функция

Этот ген кодирует члена CHMP/CHMP белков, которые участвуют в мультивескулярной сортировке белков в интерьеры лизосом. Первоначальный прогноз белковой последовательности, кодируемой этим геном, показал, что кодированный белок представлял собой металлопептидазу. Номенклатура была недавно обновлена, чтобы отразить правильную биологическую функцию этого кодируемого белка.

Взаимодействия

Было показано, что CHMP1A взаимодействует с VPS4A .

Внешние ссылки

• человека Расположение генома CHMP1A и CHMP1A страница генов в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

• Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, et al. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), выведенные с помощью анализа клонов кДНК из клеточной линии человека KG-1» . ДНК -исследования . 1 (5): 223–9. doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . PMID   7584044 .
• Скотт И.К., Халила Р., Дженкинс Дж. М., Механ С., Апостолу С., Уинквист Р. и др. (Сентябрь 1996). «Молекулярное клонирование, экспрессия и хромосомная локализация гена человека, кодирующего 33 кДа, предполагаемой металлопептидазы (PRSM1)». Ген . 174 (1): 135–43. doi : 10.1016/0378-1119 (96) 00510-0 . PMID   8863740 .
• Йошида Х, Хейз К, Янаги Х, Юра Т., Мори К (декабрь 1998 г.). «Идентификация цис-действующего эндоплазматического ретикулума-элемента реакции реакции, ответственного за транскрипционную индукцию белков, регулируемых глюкозой млекопитающих. Вовлечение основных факторов транскрипции лейциновой молнии» . Журнал биологической химии . 273 (50): 33741–9. doi : 10.1074/jbc.273.50.33741 . PMID   9837962 .
• Тонг Ви, Нагано-Фудзи М., Хидаджат Р., Денг Л., Такигава Й, Хотта Х (декабрь 2002 г.). «Физическое взаимодействие между белком NS4B вируса гепатита С и CREB-RP/ATF6Beta» (PDF) . Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 299 (3): 366–72. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 02638-4 . PMID   12445808 . Архивировано из оригинала (PDF) 2020-07-12 . Получено 2020-07-12 .
• Strack B, Calistri A, Craig S, Popova E, Göttlinger HG (сентябрь 2003 г.). «AIP1/Alix является партнером по связыванию для функционирования ВИЧ-1 P6 и EIAV P9 в вирусной почку» . Клетка . 114 (6): 689–99. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00653-6 . PMID   14505569 . S2CID   10733770 .
• Von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B, Ward DM, Chung HY, Morita E, et al. (Сентябрь 2003 г.). «Белковая сеть подверженности ВИЧ» . Клетка . 114 (6): 701–13. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00714-1 . PMID   14505570 . S2CID   16894972 .
• Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D, Bieniasz PD, Yaravoy A (октябрь 2003 г.). «Дивергентные ретровирусные домены с поздним буджетом рекрутируют коэффициенты сортировки вакуолярного белка с использованием альтернативных белков адаптера» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (21): 12414–9. Bibcode : 2003pnas..10012414M . doi : 10.1073/pnas.2133846100 . PMC   218772 . PMID   14519844 .
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC   1847948 . PMID   17353931 .
• Row PE, Liu H, Hayes S, Welchman R, Charalabous P, Hofmann K, et al. (Октябрь 2007 г.). «MIT -домен UBPY представляет собой сигнал связывания CHMP и эндосомной локализации, необходимый для эффективного деградации рецептора эпидермального фактора роста» (PDF) . Журнал биологической химии . 282 (42): 30929–37. doi : 10.1074/jbc.m704009200 . PMID   17711858 . S2CID   28086824 .