USP5

USP5
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2DAG, 2DAK, 2G43, 2G45, 3IHP
Идентификаторы
Псевдонимы	USP5 , ISOT, убиквитин -специфическая пептидаза 5
Внешние идентификаторы	Омим : 601447 ; MGI : 1347343 ; Гомологен : 55758 ; GeneCards : USP5 ; OMA : USP5 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	6,866,632 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	124,806,447 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	prefrontal cortex; ; left testis; ; right testis; ; right frontal lobe; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; Brodmann area 9; ; left adrenal gland; ; lateral nuclear group of thalamus; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; perirhinal cortex; ; entorhinal cortex; ; ventricular zone; ; otic vesicle; ; lip; ; medulla oblongata;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	peptidase activity; cysteine-type peptidase activity; cysteine-type endopeptidase activity; zinc ion binding; ubiquitin binding; protein binding; hydrolase activity; metal ion binding; thiol-dependent deubiquitinase;
Cellular component	lysosome; cytosol;
Biological process	protein K48-linked deubiquitination; positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; ubiquitin-dependent protein catabolic process; proteolysis; protein deubiquitination; protein ubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8078
	22225
	ENSG00000111667
	Ensmusg00000038429
	P45974
	P56399
	NM_001098536 ; NM_003481
	NM_013700 ; NM_001326594
showNP_001092006 ; NP_003472 ; NP_001369517 ; NP_001369518 ; NP_001369519 ;
	NP_001369520
	NP_001313523 ; NP_038728
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Убиквитин -специфическая пептидаза 5 представляет собой фермент , который у людей кодируется USP5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Показано, что USP5 взаимодействует с TADA3L . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000111667 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000038429 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Puente XS, Sánchez LM, общий CM, López-Otín C (Jul 2003). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Nature Reviews Genetics . 4 (7): 544–58. doi : 10.1038/nrg1111 . PMID 12838346 . S2CID 2856065 .
^ Ансари-Лари М.А., Музни Д.М., Лу Дж., Лу Ф., Лилли С.Е., Спанос С., Малли Т., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Богатый гены кластер между генами CD4 и триозофосфат изомеразы у хромосомы человека 12P13» . Исследование генома . 6 (4): 314–26. doi : 10.1101/gr.6.4.314 . PMID 8723724 .
^ «Ген Entrez: USP5 -специфическая пептидаза 5 (изопептидаза T)» .
^ Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Ламошас Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х. , Смоляр А., Босак С., Процессов Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

Дальнейшее чтение

Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Критические обзоры биохимии и молекулярной биологии . 33 (5): 337–52. doi : 10.1080/10409239891204251 . PMID 9827704 .
Falquet L, допрос N, Frutiter S, Houses GJ, Jaton JC (Dec 1995). «Клонирование кДНК человеческого дебиквитинирующего фермента на 100 кДа: 100 кДа дебиквитиназа человека принадлежит убиквитиновой С-терминальной гидролазной семейству 2 (UCH2)». Febs Письма 376 (3): 233–7. doi : 10.1016/0014-5793 (95) 01287-7 PMID 7498549 . 19521632S2CID
Wilkinson KD, Tashayev VL, O'Connor LB, Larsen CN, Kasperek E, Pickart CM (ноябрь 1995). «Метаболизм сигнала деградации полиубикитина: структура, механизм и роль изопептидазы T». Биохимия . 34 (44): 14535–46. doi : 10.1021/bi00044a032 . PMID 7578059 .
Falquet L, Paquet N, Frutiger S, Hughes GJ, Hoang-Van K, Jaton JC (февраль 1995 г.). «Деубиквитинирующий фермент человека с активностью изопептидазы и пептидазы in vitro» . Письма Febs . 359 (1): 73–7. doi : 10.1016/0014-5793 (94) 01451-6 . PMID 7851534 . S2CID 39667023 .
Ансари-Лари М.А., Шен Ю., Музни Д.М., Ли В., Гиббс Р.А. (март 1997 г.). «Крупномасштабное секвенирование в хромосоме человека 12P13: экспериментальное и вычислительное определение структуры генов» . Исследование генома . 7 (3): 268–80. doi : 10.1101/gr.7.3.268 . PMID 9074930 .
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugono J, Hata H, Ota T, Igai T, Tanaka T, Nakura Y, Suyama Y, Sakaki Y, Morishita S, Okubo, Sugano S, (май 2001 г.) Полем «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида человеческих генов » Geome Research 11 (5): 677–8 Doi : 10.1101/gr.gr-1640r . 311086PMC PMID 1137467
Engidawork E, Juranville JF, Fountoulakis M, Dierssen M, Lubec G (2001). «Селективная активация белков протеолитического пути убиквитин-протеасом, цепь протеасом и изопептидазы T при синдроме плода-дауна». Экспрессия белка в мозге синдрома Дауна . С. 117–30. doi : 10.1007/978-3-7091-6262-0_10 . ISBN 978-3-211-83704-7 Полем PMID 11771738 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помощь )
Габриэль Дж. М., Лакомб Т., Кэронбио С., Пакет Н., Бисиг Р., Кокс Дж.А., Джатон Дж.С. (ноябрь 2002 г.). «Цинк требуется для каталитической активности деубиквитинирующей изопептидазы человека» человека ». Биохимия . 41 (46): 13755–66. doi : 10.1021/bi026096m . PMID 12427038 .
Lacombe T, Gabriel JM (ноябрь 2002 г.). «Дальнейшая характеристика предполагаемого человеческого каталитического сайта T -каталитического сайте» . Письма Febs . 531 (3): 469–74. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 03586-x . PMID 12435595 . S2CID 26832850 .
Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р., Гатлин Т., Тирумалай Р.С., Конрадс Т.П., Венстра Т.Д., Адкинс Дж.Н., Фунс Дж., Фаган Р., Лобе А (апрель 2004). «Протеом плазмы человека: нередактирующий список, разработанный комбинацией четырех отдельных источников» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (4): 311–26. doi : 10.1074/mcp.m300127-mcp200 . PMID 14718574 .
Бранденбергер Р., Вей Х., Чжан С., Лей С., Мураге Дж., Фиск Г.Дж., Ли Й., Сюй С., Фан Р., Гюглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стентон Л.В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома выясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих клеток». Nature Biotechnology . 22 (6): 707–16. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
Colland F, Jacq X, Truplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (Jul 2004). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Исследование генома . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сиропа Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смолььяр А, Босак С., Проявление Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Reyes-Turcu FE, Horton JR, Mullally JE, Heroux A, Cheng X, Wilkinson KD (март 2006 г.). «Убиквитин-связывающий домен Znf UBP распознает C-концевой мотитель диглицина без заправковатого убиквитина» . Клетка . 124 (6): 1197–208. doi : 10.1016/j.cell.2006.02.038 . PMID 16564012 . S2CID 1312137 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 12 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000111667 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000038429 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid12838346-5] Puente XS, Sánchez LM, общий CM, López-Otín C (Jul 2003). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Nature Reviews Genetics . 4 (7): 544–58. doi : 10.1038/nrg1111 . PMID 12838346 . S2CID 2856065 .

[pmid8723724-6] Ансари-Лари М.А., Музни Д.М., Лу Дж., Лу Ф., Лилли С.Е., Спанос С., Малли Т., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Богатый гены кластер между генами CD4 и триозофосфат изомеразы у хромосомы человека 12P13» . Исследование генома . 6 (4): 314–26. doi : 10.1101/gr.6.4.314 . PMID 8723724 .

[entrez-7] «Ген Entrez: USP5 -специфическая пептидаза 5 (изопептидаза T)» .

[pmid16189514-8] Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Ламошас Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х. , Смоляр А., Босак С., Процессов Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]