Домен, связывающий тРНК B3/B4
| Б3_4 | |||
|---|---|---|---|
 фенилаланил-тРНК-синтетаза из Thermus thermophilus в комплексе с тРНК и аналогом фенилаланиладенилата | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Б3_4 | ||
| Пфам | PF03483 | ||
| Пфам Клан | CL0383 | ||
| ИнтерПро | ИПР005146 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1пыс / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
B3/B4 Домен обнаружен в тРНК- синтетазы бета- субъединицах , а также в некоторых белках, не являющихся тРНК-синтетазой .
Функция
[ редактировать ]Аминоацил-тРНК-синтетазы могут катализировать редактирования реакции для исправления ошибок, возникающих во время аминокислот активации и эстерификации тРНК, чтобы предотвратить присоединение неправильных аминокислот к тРНК. Домен B3/B4 бета-субъединицы содержит сайт редактирования, который расположен рядом с активным сайтом альфа-субъединицы. [ 1 ] Нарушение этого сайта упразднило редактирование тРНК — процесс, необходимый для точной трансляции генетического кода .
Структура
[ редактировать ]Этот домен имеет трехслойную структуру, содержит бета-сэндвич- складку необычной топологии и содержит предполагаемый структурный мотив , связывающий тРНК . [ 2 ] У Thermus thermophilus как каталитические альфа-, так и некаталитические бета-субъединицы составляют характерную складку активного центра класса II доменов . Наличие РНК -связывающего домена, аналогичного домену сплайсосомного белка U1A , в бета-субъединице тРНК-синтетазы указывает на структурные взаимоотношения между различными семействами РНК-связывающих белков .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Рой Х., Линг Дж., Ирнов М., Ибба М. (ноябрь 2004 г.). «Редактирование после переноса in vitro и in vivo с помощью бета-субъединицы фенилаланил-тРНК-синтетазы» . ЭМБО Дж . 23 (23): 4639–48. дои : 10.1038/sj.emboj.7600474 . ПМК 533057 . ПМИД 15526031 .
- ^ Мосяк Л., Решетникова Л., Голдгур Ю., Деларю М., Сафро М.Г. (июль 1995 г.). «Структура фенилаланил-тРНК-синтетазы Thermus thermophilus». Нат. Структура. Биол . 2 (7): 537–47. дои : 10.1038/nsb0795-537 . ПМИД 7664121 . S2CID 13042127 .