Jump to content

ПНКП

ПНКП
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы PNKP , EIEE10, MCSZ, PNK, AOA4, полинуклеотидкиназа 3'-фосфатаза, CMT2B2
Внешние идентификаторы Опустить : 605610 ; МГИ : 1891698 ; Гомологен : 5247 ; Генные карты : ПНКП ; ОМА : ПНКП - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_007254

НМ_001290764
НМ_001290766
НМ_001290767
НМ_021549

RefSeq (белок)

НП_009185

н/д

Местоположение (UCSC) Чр 19: 49,86 – 49,88 Мб Чр 7: 44,51 – 44,51 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Бифункциональная полинуклеотидная фосфатаза/киназа представляет собой фермент , который у человека кодируется PNKP геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Детальное структурное исследование кристаллизованного мышиного белка исследовало активность как 5'-полинуклеотидкиназы, так и 3'-полинуклеотидфосфатазы. [ 8 ] Дополнительные особенности пептидной последовательности включают домен ассоциации вилкообразной головки (FHA), сайт связывания АТФ и последовательности ядерной и митохондриальной локализации.

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что PNKP взаимодействует с ДНК-полимеразой бета. [ 9 ] и XRCC1 . [ 9 ] [ 10 ]

Роль в неврологических заболеваниях

[ редактировать ]

У пациентов наблюдались мутации человеческого гена, кодирующего PNKP. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] при микроцефалии, судорогах и дефектах репарации ДНК. Тип рецессивной атаксии также связан с мутациями PNKP. [ 15 ] Существуют также недавно охарактеризованные патологические варианты PNKP. [ 16 ] Модельные организмы, такие как мыши и дрозофилы, использовались для получения дальнейших знаний. [ 17 ] [ 18 ]

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000039650 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002963 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Джилани А., Рамотар Д., Слэк С., Онг С., Ян К.М., Шерер С.В., Ласко Д.Д. (сентябрь 1999 г.). «Молекулярное клонирование человеческого гена PNKP, кодирующего полинуклеотидкиназу 3'-фосфатазу, и доказательства его роли в восстановлении разрывов цепей ДНК, вызванных окислительным повреждением» . Ж. Биол. Хим . 274 (34): 24176–86. дои : 10.1074/jbc.274.34.24176 . ПМИД   10446192 .
  6. ^ Карими-Бушери Ф, Дэйли Дж., Робинс П., Канас Б., Паппин Д.Д., Сгурос Дж., Миллер Г.Г., Фахрай Х., Дэвис Э.М., Ле Бо М.М., Вайнфельд М. (сентябрь 1999 г.). «Молекулярная характеристика ДНК-киназы человека» . Ж. Биол. Хим . 274 (34): 24187–94. дои : 10.1074/jbc.274.34.24187 . ПМИД   10446193 .
  7. ^ «Ген Энтрез: полинуклеотидкиназа PNKP 3'-фосфатаза» .
  8. ^ Гарсес, Фернандо; Перл, Лоуренс Х.; Оливер, Энтони В. (ноябрь 2011 г.). «Структурная основа распознавания субстрата полинуклеотидкиназой 3'-фосфатазой млекопитающих» . Молекулярная клетка . 44 (3): 385–396. doi : 10.1016/j.molcel.2011.08.036 . ПМК   4820033 . ПМИД   22055185 .
  9. ^ Перейти обратно: а б Уайтхаус СиДжей, Тейлор Р.М., Тистлетуэйт А., Чжан Х., Карими-Бушери Ф., Ласко Д.Д., Вайнфельд М., Калдекотт К.В. (январь 2001 г.). «XRCC1 стимулирует активность полинуклеотидкиназы человека на поврежденных концах ДНК и ускоряет восстановление одноцепочечных разрывов ДНК» . Клетка . 104 (1): 107–17. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00195-7 . ПМИД   11163244 . S2CID   1487128 .
  10. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Сераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .
  11. ^ Думитраче, Лавиния К.; Маккиннон, Питер Дж. (2017). «Мутации полинуклеотидкиназы-фосфатазы (PNKP) и неврологические заболевания» . Механизмы старения и развития . 161 (Часть А): 121–129. дои : 10.1016/j.mad.2016.04.009 . ПМК   5161711 . ПМИД   27125728 .
  12. ^ Шен, Цзюнь; Гилмор, Эдвард С; Маршалл, Кристина А; Хаддадин, Мэри; Рейнольдс, Джон Дж; Эйяид, Вафаа; Боделл, Адриа; Барри, Бренда; Глисон, Даниэль; Аллен, Кэтрин; Ганеш, Виджай С. (2010). «Мутации в PNKP вызывают микроцефалию, судороги и дефекты репарации ДНК» . Нат Жене . 42 (3): 245–249. дои : 10.1038/ng.526 . ISSN   1061-4036 . ПМЦ   2835984 . ПМИД   20118933 .
  13. ^ Исса, Лина; Мюллер, Катрин; Зойферт, Катя; Кремер, Надин; Розенкокоттер, Хеннинг; Ниннеманн, Олаф; Буоб, Майкл; Кайндл, Анджела М; Моррис-Розендаль, Дебора Дж (2013). «Клинические и клеточные особенности у пациентов с первичной аутосомно-рецессивной микроцефалией и новой мутацией CDK5RAP2» . Сиротский журнал редких заболеваний . 8 (1): 59. дои : 10.1186/1750-1172-8-59 . ISSN   1750-1172 . ПМК   3639195 . ПМИД   23587236 .
  14. ^ Каласова, Илона; Ханзликова, Хана; Гупта, Нирджа; Ли, Юн; Альтмюллер, Джанин; Рейнольдс, Джон Дж.; Стюарт, Грант С.; Воллник, Бернд; Йигит, Гекхан; Калдекотт, Кейт В. (2019). «Новые мутации PNKP, вызывающие дефектное восстановление разрыва цепи ДНК и гиперактивность PARP1 в MCSZ» . Нейрол Генет . 5 (2): е320. дои : 10.1212/NXG.0000000000000320 . ISSN   2376-7839 . ПМК   6454307 . ПМИД   31041400 .
  15. ^ БРЛАР, Хосе; АЛОНСО, Изабель; БАРбот, Клара; КОСТА, Мария Мануэла; Дарвент, Ли; ОРМЕ, Татьяна; Секейрос, Хорхе; Харди, Джон; КОУТИНЬО, Паула; Геррейро, Рита (2015). «Мутации в PNKP вызывают рецессивную атаксию с глазодвигательной апраксией 4 типа» . Американский журнал генетики человека . 96 (3): 474–479. дои : 10.1016/j.ajhg.2015.01.005 . ПМЦ   4375449 . ПМИД   25728773 .
  16. ^ Гатти, Марта; Магри, Стефания; Нанетти, Лоренцо; Сарто, Элиза; ДиБелла, Даниэла; Сальсано, Этторе; Панталеони, Кьяра; Мариотти, Катерина; Тарони, Франко (2019). «От врожденной микроцефалии до мозжечковой атаксии у взрослых: различные и перекрывающиеся фенотипы у пациентов с мутациями гена PNKP». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 179 (11): 2277–2283. дои : 10.1002/ajmg.a.61339 . ISSN   1552-4825 . ПМИД   31436889 . S2CID   201275630 .
  17. ^ Симада, Микио; Думитраче, Лавиния С; Рассел, Хелен Р.; Маккиннон, Питер Дж (2015). «Полинуклеотидкиназа-фосфатаза обеспечивает нейрогенез посредством нескольких путей репарации ДНК для поддержания стабильности генома» . Журнал ЭМБО . 34 (19): 2465–2480. дои : 10.15252/embj.201591363 . ISSN   0261-4189 . ПМК   4601665 . ПМИД   26290337 .
  18. ^ Чакраборти, Анирбан; Тапрял, Ниша; Венкова Татьяна; Митра, Джой; Васкес, Вельмарини; Саркер, Альтаф Х.; Дуарте-Сильва, Сара; Хуай, Вэйхан; Асидзава, Тецуо; Гош, Гурисанкар; Масиэль, Патрисия (07 апреля 2020 г.). «Дефицит классической негомологичной репарации транскрибируемых генов, опосредованной соединением концов, связан с патогенезом SCA3» . Труды Национальной академии наук . 117 (14): 8154–8165. Бибкод : 2020PNAS..117.8154C . дои : 10.1073/pnas.1917280117 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   7148577 . ПМИД   32205441 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]


Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 6731ab9159fc16fc428a1ad644ebdeeb__1701623160
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/67/eb/6731ab9159fc16fc428a1ad644ebdeeb.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
PNKP - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)