USF2

USF2
Идентификаторы
Псевдонимы	USF2 , FIP, bHLHb12, вышестоящий фактор транскрипции 2, взаимодействие c-fos
Внешние идентификаторы	Опустить : 600390 ; МГИ : 99961 ; Гомологен : 2527 ; Генные карты : USF2 ; ОМА : USF2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	35,279,821 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	30,656,228 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; apex of heart; ; right frontal lobe; ; C1 segment; ; ganglionic eminence; ; left ovary; ; anterior pituitary; ; right ovary; ; right lobe of thyroid gland; ; ventricular zone;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; ventricular zone; ; granulocyte; ; superior frontal gyrus; ; lip; ; muscle of thigh; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; primary visual cortex; ; yolk sac; ; genital tubercle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	sequence-specific DNA binding; DNA binding; protein dimerization activity; protein homodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity; bHLH transcription factor binding; protein binding; protein heterodimerization activity; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	intracellular membrane-bounded organelle; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose; regulation of transcription by RNA polymerase II; late viral transcription; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose; lipid homeostasis; lactation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7392
	22282
	ENSG00000105698
	ENSMUSG00000058239
	Q15853
	Q64705
	НМ_003367 ; НМ_207291 ; НМ_001321150
	НМ_011680
	НП_001308079 ; НП_003358 ; НП_997174
	НП_035810
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Вышестоящий стимулирующий фактор 2 представляет собой белок , который у человека кодируется USF2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена основного семейства лейциновых застежек спираль-петля-спираль и может функционировать как фактор клеточной транскрипции. Кодируемый белок может активировать транскрипцию посредством богатых пиридином элементов инициатора (Inr) и мотивов E-box. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что USF2 взаимодействует с USF1 (геном человека) . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} PPRC1 ^{[ 9 ]} и BRCA1 . ^{[ 10 ]}

Регулирование

Ген USF2 репрессируется микроРНК миР - 10а . ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105698 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058239 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гроенен П.М., Гарсия Э., Дебир П., Девриендт К., Фринс Дж.П., Ван де Вен У.Дж. (декабрь 1996 г.). «Структура, последовательность и локализация на хромосоме 19 человеческого USF2 и его перестройка у пациента с поликистозной дисплазией почек». Геномика . 38 (2): 141–8. дои : 10.1006/geno.1996.0609 . ПМИД 8954795 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: вышестоящий транскрипционный фактор 2 USF2, взаимодействие c-fos» .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Анрион А., Кан А., Раймонжан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и действующие свойства вышестоящих изоформ стимулирующего фактора» . Журнал биологической химии . 271 (3): 1405–15. дои : 10.1074/jbc.271.3.1405 . ПМИД 8576131 .
^ Мур М.Л., Парк Э.А., Макмиллин Дж.Б. (май 2003 г.). «Вышестоящий стимулирующий фактор подавляет индукцию экспрессии карнитинпальмитоилтрансферазы-Ибета с помощью PGC-1» . Журнал биологической химии . 278 (19): 17263–8. дои : 10.1074/jbc.M210486200 . ПМИД 12611894 .
^ Кейбл PL, Уилсон, Калифорния, Кальцоне Ф.Дж., Раушер Ф.Дж., Скалли Р., Ливингстон Д.М., Ли Л., Блэквелл CB, Фуреал, Пенсильвания, Афшари, Калифорния (октябрь 2003 г.). «Новая консенсусная ДНК-связывающая последовательность белковых комплексов BRCA1» . Молекулярный канцерогенез . 38 (2): 85–96. дои : 10.1002/mc.10148 . ПМИД 14502648 . S2CID 24956554 .
^ Агирре Х, Хименес-Веласко А, Сан-Хосе-Энерис Е, Гарате Л, Бандрес Е, Кордеу Л, Апарисио О, Саес Б, Наварро Г, Вилас-Сорноса А, Перес-Рожер I, Гарсиа-Фонсильяс Х, Торрес А, Хейнигер А., Каласанс М.Дж., Фортес П., Роман-Гомес Дж., Проспер Ф. (декабрь 2008 г.). «Снижение уровня регуляции hsa-miR-10a в CD34+ клетках хронического миелолейкоза увеличивает рост клеток, опосредованный USF2» . Молекулярные исследования рака . 6 (12): 1830–40. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-08-0167 . ПМИД 19074828 .

Дальнейшее чтение

Корре С., Галиберт, доктор медицинских наук (январь 2006 г.). «[USF как ключевой регуляторный элемент экспрессии генов]» (PDF) . Медицина/Науки . 22 (1): 62–7. дои : 10.1051/medsci/200622162 . ПМИД 16386222 .
Сирито М., Уокер С., Лин К., Козловски М.Т., Кляйн В.Х., Савадого М. (1993). «Члены семейства белков спираль-петля-спираль USF связывают ДНК как гомо-, так и гетеродимеры» . Экспрессия генов . 2 (3): 231–40. ПМК 6057381 . ПМИД 1450663 .
Бланар М.А., Раттер В.Дж. (май 1992 г.). «Взаимодействующее клонирование: идентификация белка застежки-молнии спираль-петля-спираль, который взаимодействует с c-Fos». Наука . 256 (5059): 1014–8. Бибкод : 1992Sci...256.1014B . дои : 10.1126/science.1589769 . ПМИД 1589769 .
Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Анрион А., Кан А., Раймонжан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и действующие свойства вышестоящих изоформ стимулирующего фактора» . Журнал биологической химии . 271 (3): 1405–15. дои : 10.1074/jbc.271.3.1405 . ПМИД 8576131 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Гош А.К., Датта П.К., Джейкоб С.Т. (февраль 1997 г.). «Двойная роль белка USF спираль-петля-спираль-молния в транскрипции гена рибосомальной РНК in vivo» . Онкоген . 14 (5): 589–94. дои : 10.1038/sj.onc.1200866 . ПМИД 9053857 .
Куршнер С., Морган Дж.И. (февраль 1997 г.). «USF2 / FIP связывается с транскрипционным фактором b-Zip, c-Maf, через его домен bHLH и ингибирует активность связывания ДНК c-Maf». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 231 (2): 333–9. дои : 10.1006/bbrc.1997.6097 . ПМИД 9070273 .
Брин Г.А., Джордан Э.М. (апрель 1997 г.). «Регуляция ядерного гена, который кодирует альфа-субъединицу митохондриального комплекса F0F1-АТФ-синтаза. Активация вышестоящим стимулирующим фактором 2» . Журнал биологической химии . 272 (16): 10538–42. дои : 10.1074/jbc.272.16.10538 . ПМИД 9099698 .
Нечуштан Х., Чжан З., Разин Э. (апрель 1997 г.). «Микрофтальмия (ми) в тучных клетках мышей: регуляция ее стимул-опосредованной экспрессии на уровне трансляции» . Кровь . 89 (8): 2999–3008. дои : 10.1182/blood.V89.8.2999 . ПМИД 9108421 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Брин Г.А., Джордан Э.М. (август 1999 г.). «Транкрипционная активация элемента инициатора альфа-субъединицы F (1) F (0) АТФ-синтазы с помощью USF2 опосредована p300». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Общие предметы . 1428 (2–3): 169–76. дои : 10.1016/s0304-4165(99)00061-6 . ПМИД 10434034 .
Кумари Д., Усдин К. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие факторов транскрипции USF1, USF2 и альфа-Pal/Nrf-1 с промотором FMR1. Последствия для синдрома умственной отсталости Fragile X» . Журнал биологической химии . 276 (6): 4357–64. дои : 10.1074/jbc.M009629200 . ПМИД 11058604 .
Колонич А, Апати А, Нахаевский С, Гати Р, Брозик А, Магоци М (2002). «Нерегулируемая активация STAT-5, ERK1/2 и c-Fos может способствовать фенотипической трансформации миелодиспластического синдрома в острый лейкоз». Гематология . 31 (2): 125–38. дои : 10.1163/15685590152492936 . ПМИД 11583024 .
Бенгтссон С.Х., Мадейски-Бенгтсон К., Нильссон Дж., Бьюрселл Г. (июль 2002 г.). «Регуляция транскрипции гена липазы карбоксилового эфира человека в моноцитах THP-1: E-box, необходимый для активации, связывает вышестоящие стимулирующие факторы 1 и 2» . Биохимический журнал . 365 (Часть 2): 481–8. дои : 10.1042/BJ20020223 . ПМЦ 1222691 . ПМИД 11945176 .
Вильявисенсио Э.Х., Юн Дж.В., Фрэнк DJ, Фюхтбауэр Э.М., Уолтерхаус Д.О., Ианнакконе П.М. (апрель 2002 г.). «Совместная регуляция E-box человеческого GLI1 с помощью TWIST и USF». Бытие . 32 (4): 247–58. дои : 10.1002/gen.10078 . ПМИД 11948912 . S2CID 12132097 .
Мур М.Л., Парк Э.А., Макмиллин Дж.Б. (май 2003 г.). «Вышестоящий стимулирующий фактор подавляет индукцию экспрессии карнитинпальмитоилтрансферазы-Ибета с помощью PGC-1» . Журнал биологической химии . 278 (19): 17263–8. дои : 10.1074/jbc.M210486200 . ПМИД 12611894 .
Пиквелл Г.В., Ши Х., Кваттроки Л.С. (апрель 2003 г.). «Взаимодействие вышестоящих белков стимулирующего фактора с E-боксом, расположенным внутри 5'-фланкирующего гена CYP1A2 человека, способствует активации базального транскрипционного гена». Биохимическая фармакология . 65 (7): 1087–96. дои : 10.1016/S0006-2952(03)00037-6 . ПМИД 12663044 .
Чжу Дж., Джаннола Д.М., Чжан Ю., Ривера А.Дж., Эмерсон С.Г. (октябрь 2003 г.). «NF-Y взаимодействует с USF1/2, индуцируя гемопоэтическую экспрессию HOXB4» . Кровь . 102 (7): 2420–7. дои : 10.1182/кровь-2003-01-0251 . ПМИД 12791656 .

Внешние ссылки

ФакторБук USF2

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105698 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058239 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8954795-5] Гроенен П.М., Гарсия Э., Дебир П., Девриендт К., Фринс Дж.П., Ван де Вен У.Дж. (декабрь 1996 г.). «Структура, последовательность и локализация на хромосоме 19 человеческого USF2 и его перестройка у пациента с поликистозной дисплазией почек». Геномика . 38 (2): 141–8. дои : 10.1006/geno.1996.0609 . ПМИД 8954795 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: вышестоящий транскрипционный фактор 2 USF2, взаимодействие c-fos» .

[pmid17353931-7] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid8576131-8] Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Анрион А., Кан А., Раймонжан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и действующие свойства вышестоящих изоформ стимулирующего фактора» . Журнал биологической химии . 271 (3): 1405–15. дои : 10.1074/jbc.271.3.1405 . ПМИД 8576131 .

[pmid12611894-9] Мур М.Л., Парк Э.А., Макмиллин Дж.Б. (май 2003 г.). «Вышестоящий стимулирующий фактор подавляет индукцию экспрессии карнитинпальмитоилтрансферазы-Ибета с помощью PGC-1» . Журнал биологической химии . 278 (19): 17263–8. дои : 10.1074/jbc.M210486200 . ПМИД 12611894 .

[pmid14502648-10] Кейбл PL, Уилсон, Калифорния, Кальцоне Ф.Дж., Раушер Ф.Дж., Скалли Р., Ливингстон Д.М., Ли Л., Блэквелл CB, Фуреал, Пенсильвания, Афшари, Калифорния (октябрь 2003 г.). «Новая консенсусная ДНК-связывающая последовательность белковых комплексов BRCA1» . Молекулярный канцерогенез . 38 (2): 85–96. дои : 10.1002/mc.10148 . ПМИД 14502648 . S2CID 24956554 .

[pmid19074828-11] Агирре Х, Хименес-Веласко А, Сан-Хосе-Энерис Е, Гарате Л, Бандрес Е, Кордеу Л, Апарисио О, Саес Б, Наварро Г, Вилас-Сорноса А, Перес-Рожер I, Гарсиа-Фонсильяс Х, Торрес А, Хейнигер А., Каласанс М.Дж., Фортес П., Роман-Гомес Дж., Проспер Ф. (декабрь 2008 г.). «Снижение уровня регуляции hsa-miR-10a в CD34+ клетках хронического миелолейкоза увеличивает рост клеток, опосредованный USF2» . Молекулярные исследования рака . 6 (12): 1830–40. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-08-0167 . ПМИД 19074828 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]