Jump to content

Дэвид Пенни

Дэвид Пенни
Пенни в 2004 году
Рожденный ( 1938-09-28 ) 28 сентября 1938 г.
Таумарунуи , Новая Зеландия
Умер 20 мая 2024 г. (20 мая 2024 г.) (85 лет)
Пальмерстон-Норт , Новая Зеландия
Альма-матер
Награды
Научная карьера
Поля Теоретическая биология
Учреждения
Докторанты Барбара Р. Холланд [1]
Майк Стил [2]

Эдвард Дэвид Пенни CNZM FRSNZ (28 сентября 1938 — 20 мая 2024) — новозеландский биолог- теоретик и эволюционист . Он исследовал природу эволюционных преобразований и опубликовал множество публикаций в области филогенетического древа , генетики и эволюционной биологии . Вклад Пенни в науку был отмечен несколькими наградами и наградами, а также принят в Национальную академию наук .

Образование и карьера

[ редактировать ]

Пенни родилась в Таумарунуи и получила образование в средней школе для мальчиков Нью-Плимута , а затем получила степень бакалавра по ботанике и химии в Кентерберийском университете . Он защитил докторскую диссертацию по ботанике в Йельском университете в 1965 году, а затем работал научным сотрудником в Университете Макмастера . [3] Он вернулся в Новую Зеландию в 1966 году и присоединился к сотрудникам Университета Мэсси на факультете биологии растений, Школе биологических наук, Институте молекулярных биологических наук и Институте фундаментальных наук, а в 2005 году Пенни был назван заслуженным профессором. [3] С 2002 по 2010 год Пенни был соруководителем Центра Аллана Уилсона , одного из первых новозеландских центров передового опыта исследований , расположенного в Университете Мэсси. До своего закрытия в 2015 году центр занимался исследованием эволюции и экологии растений и животных Новой Зеландии и Тихого океана. После выхода на пенсию в 2017 году Пенни получил звание почетного профессора Университета Мэсси. [3]

Избранные исследования

[ редактировать ]

Исследования Пенни были сосредоточены на теоретической биологии, молекулярной эволюции , эволюции человека и истории науки. [3]

Ранние работы

[ редактировать ]

В 1970-х годах Пенни изучал, как генетическую информацию обо всех формах жизни можно использовать для исследования таких вопросов, как происхождение жизни, возникновение эволюции и отношения между видами и сообществами. Он помог разработать «математические методы и компьютерные программы для анализа последовательностей ДНК и построения эволюционных деревьев… [развивая]… новые идеи, подтверждающие идею о том, что люди эволюционировали в Африке, а затем мигрировали из Африки и что первые формы жизни были на основе более простой молекулы РНК, а не ДНК». [4] [5] В 1998 году он стал соавтором статьи, в которой представил убедительные основанные на ДНК доказательства того, что маори в Новую Зеландию включала от 50 до 100 женщин . миграция путешествия, воссоздающие ранние трансокеанские путешествия». [6]

Филогенетические деревья

[ редактировать ]

Было сказано, что статья « Построение филогенетических деревьев» (1967 г.) [7] именно это впервые заинтересовало Пенни прослеживанием процесса эволюции. [8] Один из авторов этой статьи, Уолтер Фитч, в 1988 году отметил, что вдохновением для их исследования 1967 года была разработка компьютерной программы, которая могла бы взломать генетический код и создать «молекулярную палеонтологическую запись в белках и нуклеиновых кислотах». [9] Ранние исследования Пенни бросили вызов теориям эволюции того времени. Стремясь прояснить надежную основу классификации, в 1982 году он вступил в полемику о том, следует ли выражать отношения между организмами в «эволюционных терминах или в кластерах, основанных на общем сходстве», и пришел к выводу, что сохранение исходных данных поддерживает правильную классификацию. [10]

Пенни участвовал в исследовательских группах, изучавших методы построения деревьев. В 1985 году он участвовал в работе по оценке их надежности, и в исследовательской работе был сделан вывод, что необходим баланс между традиционным подходом « взвешивания символов » и компьютерным подходом, использующим растущее понимание числовой таксономии . [11] Другая статья 1992 года, отмечая временами надежность традиционных методов, также представила новый подход. Это было известно как LogDet и, по словам авторов статьи, «[позволяло] методам выбора дерева последовательно восстанавливать правильное дерево, когда последовательности развиваются в соответствии с простыми асимметричными моделями... производят последовательности различного нуклеотидного состава... и более реалистичнее, чем большинство стандартных моделей». [12] В 1993 году он стал соавтором исследовательской работы, в которой утверждалось, что методы построения эволюционных деревьев достигли прогресса. В реферате авторы объяснили сигналы макромолекул из общей истории и уточнили цель исследования: обсудить методы, которые были «эффективными (быстрыми), последовательными, мощными, надежными и фальсифицируемыми» для построения эволюционных деревьев из эти паттерны или сигналы. В документе сделан вывод, что большинство методов вывода деревьев нуждаются в исправлениях, но «признание того, что методы могут быть одновременно эффективными и последовательными [было] также полезно». [13]

Эволюция эукариотов

[ редактировать ]

Статья, написанная в соавторстве с Пенни в 2006 году, [14] бросила вызов преобладавшему в то время мнению, что эукариоты возникли в результате геномов слияния архей и бактерий, предполагая, что они «с большей вероятностью были уменьшены за счет потери последовательностей и клеточного упрощения после возможного появления хищных эукариот». [15] : стр. 12 Это исследование было важным, поскольку оно предположило, что современные эукариотные и прокариотные клетки долгое время следовали разными эволюционными траекториями, подтверждая, «что эволюция не происходит монотонно от более простого к более сложному». [14] Пенни рассказал NBC News, что результаты могут кого-то удивить, но подчеркнул, что существует мало свидетельств того, что теория слияния объясняет «особые генетические и клеточные особенности эукариот». Он предположил, что это пример эволюции, идущей «назад, в сторону и иногда вперед». [16] Группа международных ученых оспорила выводы статьи 2006 года. Они утверждали, что авторы «выдвинули предвзятые мнения», которые представляли « раннюю интронную эукариотную ) точку зрения на раннюю эволюцию, которая была распространена в 1980 году и которая была показана традиционными научными критериями как несостоятельная более десяти лет назад». [17] : стр.542-543 В том же журнале Пенни и др. ответил, что новая информация клеточной и молекулярной геномики предоставила ранее недоступную информацию о происхождении эукариот. Они согласились, что «все еще преждевременно делать выбор между первыми, ранними или поздними интронами... тем не менее, наш основной вывод заключается в том, что имеется хороший прогресс в понимании сложности предковой эукариотической клетки». [17] : стр.543

Пенни также был частью исследовательской группы, которая изучала теории происхождения эукариот и отметила, что некоторые из них игнорируют историю жизни и экологические принципы, и было необходимо оспорить предсказания о том, что в ранней жизни был длительный период без хищников . Авторы пришли к выводу, что их результаты «согласуются с ожиданием того, что способность получать энергию за счет поглощения других одноклеточных клеток развилась на ранних этапах эволюции… таким образом, исходя из первых принципов, маловероятно, что когда-либо существовал длительный период (1–3 миллиарда лет), когда не было хищников, которые жили, поглощая более мелкие клетки». Это имело значение при рассмотрении наиболее вероятного времени появления эукариот и поставило под сомнение точку зрения о том, что эти клетки возникли где-то между 9,85–2,75 миллиарда лет назад. Исходя из того, что фагоцитирующие хищники были почти исключительно эукариотами, в статье утверждалось, что они существовали на более ранних стадиях эволюции. [18]

Эволюция птиц

[ редактировать ]

После работы в качестве члена группы, исследующей эволюцию птиц в 2008 году, Пенни стал соавтором статьи, которая подтвердила наличие проблем в этой области для биологов-эволюционистов. Авторы заявили, что отчасти это произошло из-за того, что учёных ввели в заблуждение «конвергенция морфологии… [и]… проблем и филогении, основанных на коротких последовательностях ДНК». В документе также предпринята попытка решить проблемы, связанные с «отношениями между кладами и временем эволюции птиц», и на основе филогенетических данных сделан вывод, что «семь видов Метав не имеют общей эволюционной истории внутри Неоавов ». [19] Разрешение споров вокруг понимания эволюционных взаимоотношений между современными птицами из-за этой политомии у основания неонавов находится в центре внимания более поздних исследований, в которых участвовал Пенни. Новые разработки, предложенные в этой статье, включают снижение уровня шума и более точное использование формул для поиска предопределенных группировок в оптимальном дереве. Примечательно, что исследование сообщило о существовании девяти новых митохондриальных геномов , [которые] «поддерживают значительную диверсификацию по крайней мере 12 линий неоптиц в позднем меловом периоде ». [20] Пенни также участвовала в исследовании 2010 года, которое показало, что некоторые бескилевые гнездились и, следовательно, ранее летали. [21] Один из примеров: вымерший моа , тесно связанный с породой птиц тинаму из Южной Америки, по словам Пенни, возможно, прилетел или «был занесен ветром в Новую Зеландию через Антарктиду, прежде чем он замерз». [22]

Происхождение наземных растений

[ редактировать ]

В статье, соавтором которой выступил Пенни в 1995 году, отмечалось, что необходимо больше геномных данных, чтобы «установить и прояснить эволюционные связи... чтобы точно оценить филогенетические деревья... [для]... происхождения наземных растений как предпосылки для понимание перехода от водной среды обитания растений к наземной». [23] : стр.137 В документе оспаривается мнение о том, что изменчивость генных деревьев из разных ядерных генов может привести к выводу о «супергенном» дереве, и предлагается учитывать высокий уровень изменчивости (герогенности) генных деревьев в исследованиях происхождения наземных растений. . Вывод заключался в том, что исследования показали, что «метод объединения различных подмножеств данных последовательно свидетельствует о том, что предки Zygnematales являются ближайшими родственниками наземных растений». [23] : стр.139 Пенни была частью команды, которая в 2013 году продолжила исследование связи между зелеными водорослями и эволюцией наземных растений. В статье об исследовании, соавтором которой является Пенни, сделан вывод, что после анализа набора данных о геноме хлоропластов « только Zygnematales или клада, состоящая из Coleochaetales плюс Zygnematales, [являются] ближайшими ныне живущими родственниками наземных растений». [24]

В 1989 году группа с участием Пенни использовала науку об эволюционных деревьях для анализа последовательностей цепи H1 человеческих вирусов и пришла к выводу, что их результаты «согласуются с биологической (эволюционной) моделью». [25] К 2006 году исследователи, в том числе Пенни, описали молекулярную эпидемиологию респираторно-синцитиального вируса (РСВ), предоставив ключевую информацию, которая поможет разработать вакцину против РСВ и разработать новые стратегии лечения. [26] Частота заражения вирусом гепатита С на островах западной части Тихого океана была проверена в 2013 году, и в статье, соавтором которой является Пенни, выдвинута гипотеза о том, что «генотипы 1 и/или 4 [циркулировали] среди жителей островов южной части Тихого океана и что эти люди [были] генетически предрасположены к спонтанному разрешению инфекции ВГС, чем к тому, чтобы стать хроническими носителями». Однако исследователи предположили, что «распространенность и преобладание ВГС [сделали] его глобальной проблемой здравоохранения, и точные эпидемиологические данные должны лежать в основе любых усилий по предотвращению передачи вируса и контролю над ним». [27]

Взгляды на теорию эволюции

[ редактировать ]

Пенни сказала Ким Хилл на RNZ в 2008 году, что любая модель, которую не удалось протестировать, не имела «большой пользы». [28] и в статье, соавтором которой он был в 1982 году, рассматривались утверждения Карла Поппера о том, что «дарвинизм [не был] проверяемой научной теорией». В исследовании была предпринята попытка проверить теорию эволюции путем сравнения филогенетических деревьев, заняв научную позицию и предложив программу, которая теоретически могла бы опровергнуть даже существование эволюционных деревьев. Он пришел к выводу, что, поскольку это была «фальсифицируемая гипотеза», она действительно соответствовала критериям научных теорий и могла поддерживать теорию эволюции, не учитывая при этом механику эволюции. [29] В 1986 году Пенни и Майкл Хенди написали главу в книге «Очарование статистики» . Они пересмотрели утверждение Карла Поппера о том, что теорию эволюции нельзя проверить как научную теорию из-за трудностей с предсказаниями событий прошлого, и пришли к выводу, что «статистика может использоваться для проверки уникальных событий, произошедших в прошлом». ". [30] Эти дебаты должны были стать постоянной темой в работе Пенни. В 1991 году он участвовал в исследовании, целью которого было однозначно определить, может ли эволюционная теория соответствовать критериям Поппера для демаркации науки. Путем сравнения деревьев из одних и тех же таксонов, но из «разных наборов данных» работа обнаружила, что авторы пришли к выводу, что теория о том, что одной последовательности достаточно, чтобы восстановить всю историю жизни, остается «мифом об универсальном дереве». . [31] В 2003 году он стал соавтором статьи, в которой признал, что доказательство теории эволюции представляет трудности, но отметил, что «проблемы, связанные с проверяемостью эволюционной теории, могут быть решены с помощью более качественной науки… [редко]… одного окончательного теста. ...[скорее всего, с]..конкретными тестами, которые приведут к проверяемым прогнозам». [32]

Пенни сказал, что то, что стало известно как древо жизни , имеет библейское происхождение, а не фразу, впервые использованную Дарвином, хотя он и назвал это «полезным сравнением». Пенни утверждал, что вместо использования концепции древа жизни Дарвин называл свою теорию «происхождением с модификациями», которая, возможно, включала в себя идею эволюционного древа, но технически больше касалась циклов, возникающих в результате « гибридизации , эндосимбиотического переноса генов , латерального перенос генов , рекомбинация, сортировка линий , сложности генеалогических отношений... [подчеркивая, например]... преемственность между популяциями, подвидами и родственными видами». [33]

Ассоциации

[ редактировать ]

Пенни был президентом Ассоциации ученых Новой Зеландии с 1989 по 1991 год. [34]

Пенни умерла в Палмерстон-Норт 20 мая 2024 года в возрасте 85 лет. [35] [36]

Почести и награды

[ редактировать ]

В 1990 году Пенни была избрана членом Королевского общества Новой Зеландии . [37] В 2000 году он был награжден медалью Марсдена за выдающиеся заслуги перед наукой в ​​Новой Зеландии и на международном уровне, где он пользовался широким признанием и сетью сотрудников, а также был отмечен за «стипендию младшего специалиста в Мертон-колледже, Оксфорд, и Дарвин-колледж в Кембридже, а также в качестве бывшего президента Общество молекулярной биологии и эволюции». [4]

В 2004 году Пенни получил медаль Резерфорда за вклад в теоретическую биологию, молекулярную эволюцию и анализ ДНК. [38]

Пенни был назначен кавалером Новозеландского ордена за заслуги перед Новым годом 2006 года за заслуги перед наукой. [39] В годовом отчете Института молекулярных биологических наук за 2007 год отмечалось, что эта награда присуждается «тех людям, которые в любой области деятельности оказали достойные услуги Короне и нации или которые отличились своим выдающимся положением, талантами, вкладом или другими заслугами». . [15] : стр.6

В 2018 году Пенни стала третьим новозеландцем, получившим звание иностранного сотрудника Национальной академии наук . [3]

Вклад Пенни в науку получил широкое признание современников. Питер Локхарт из Университета Мэсси сказал, что Пенни внес «пожизненный и продолжительный вклад в изучение молекулярной эволюции … [и]… его работа характеризуется большим любопытством, интуицией и способностью пересекать дисциплины. В частности, он неоднократно демонстрировал сверхъестественную способность находить инновационные решения проблем и видеть доказательства, которые в конечном итоге откроют математики». [3] Майк Стил из Кентерберийского университета в 2009 году написал в своей благодарственной статье в журнале New Zealand Science Review, что «формула Пенни [осталась] самым замечательным выражением в закрытой форме для любого класса филогенетических деревьев в эволюционной биологии». [3]

Дальнейшие публикации

[ редактировать ]
  • Эволюция сейчас (2017). [40] Эта книга Пенни была описана как «представляющая исторический взгляд на эволюцию… [призывающая]… к «истинному уважению» к научным знаниям». [41] Другой рецензент начал с того, что отметил Пенни как «старейшину новозеландской науки, всемирно признанного, высоко награждаемого и широко цитируемого теоретика и молекулярного биолога, который всю жизнь увлекался эволюцией». В обзоре сделан вывод, что книга представляет собой «познавательную и развлекательную экскурсию по мышлению одного из величайших новозеландских ученых-эволюционистов… [и]… излагает ключевые шаги на пути к нашему современному пониманию эволюции, рассматривает некоторые большие картины, которые появляются в этой области, и выявляют основные вопросы, которые остаются». [42]
  • Сотрудничество и эгоизм возникают в ходе молекулярной эволюции (2014). [43] Эта статья Пенни бросила вызов понятию «эгоистичного гена» в эволюционной теории и доказала, что «на макромолекулярном уровне генов и белков кооперативный аспект эволюции [был] более очевиден… [потому что]… тысячи белков должны функционировать вместе интегрированным образом, чтобы использовать и производить множество молекул, необходимых для функционирования клетки». [43] : стр.1 В своей рецензии на статью Билл Мартин из Дюссельдорфского университета (Германия) сказал, что, хотя выводы Пенни «не новы… эссе [было] достойным вкладом в историю». [43] : стр.6 Другой рецензент, Энтони Пул из Кентерберийского университета, сказал, что рукопись является своевременным обновлением и переосмыслением идеи. Он предложил, что дополнительные вопросы для обсуждения включают изучение проделанной работы, которая показала, что «сотрудничество может происходить на более высоком уровне, даже если [была] конкуренция между людьми на более низком уровне» и как разделение может избежать попадания в приписывающую агентность. Пенни ответил и согласился с расширением обсуждения, а также отметил, что некоторые примеры, приведенные Пулом, показывающие взаимодействие между организмами, были полезны. [43] : стр. 7-8
  • Наша относительная генетика (2004). [44] Пенни написала эту журнальную статью как обсуждение исследования, проведенного другими, о том, может ли геномная последовательность шимпанзе предоставить информацию о том, как генетическая конституция людей могла возникнуть в результате микроэволюции с упором на реальные гены, а не на регуляцию генов. . Он пришел к выводу, что если бы между нами, нашими предками и человекообразными обезьянами существовал «генетический континуум… [тогда]… эти процессы [были] генетически достаточными, чтобы полностью объяснить уникальность человека – и это был бы мой кандидат на роль главная научная проблема, решенная в первом десятилетии нового тысячелетия». [44]
  1. ^ Голландия, Барбара Рут (2001). Эволюционный анализ больших наборов данных: деревья и не только: диссертация, представленная в частичном выполнении требований для получения степени доктора философии по математике в Университете Мэсси (докторская диссертация). Университет Мэсси.
  2. ^ Сталь, Майкл Энтони (1989). Распределения на двухцветных эволюционных деревьях: диссертация, представленная в частичном выполнении требований для получения степени доктора философии по математике в Университете Мэсси (докторская диссертация). Университет Мэсси.
  3. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и ж г «Почетный профессор присоединяется к известной академии США» . Университет Мэсси. Архивировано из оригинала 4 мая 2018 года . Проверено 30 января 2019 г.
  4. Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Медаль Марсдена» . Новозеландская ассоциация ученых NZAS . Архивировано из оригинала 24 декабря 2018 года . Проверено 20 мая 2022 г.
  5. ^ Пенни, Дэвид; и др. (1995). «Улучшенный анализ последовательностей мтДНК человека подтверждает недавнее африканское происхождение Homo sapiens» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 12 (5). Издательство Оксфордского университета (OUP): 863–882. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040263 . ISSN   1537-1719 . ПМИД   7476132 . Архивировано (PDF) из оригинала 14 мая 2022 года.
  6. ^ Мюррей-Макинтош, Розалинд П.; и др. (21 июля 1998 г.). «Тестирование моделей миграции и оценка размера основной популяции в Полинезии с использованием последовательностей мтДНК человека» . ПНАС . 95 (15): 9047–9052. Бибкод : 1998PNAS...95.9047M . дои : 10.1073/pnas.95.15.9047 . ПМК   21200 . ПМИД   9671802 .
  7. ^ Фитч, Уолтер М.; Марголиаш, Эмануэль (20 января 1967 г.). «Построение филогенетических деревьев» . Наука . 155 (2760). Американская ассоциация содействия развитию науки: 279–284. Бибкод : 1967Sci...155..279F . дои : 10.1126/science.155.3760.279 . JSTOR   1720651 . ПМИД   5334057 . Архивировано из оригинала 23 мая 2022 года.
  8. ^ «Э. Дэвид Пенни» . Национальная академия наук . Справочник участников. Архивировано из оригинала 24 марта 2019 года . Проверено 18 мая 2022 г.
  9. ^ Fitch, Уолтер М. (4 июля 1988 г.). «Классика цитирования на этой неделе: Фитч и Марголиаш Построение филогенетических деревьев » (PDF) . Текущее содержание (27). Архивировано (PDF) из оригинала 24 апреля 2005 г.
  10. ^ Пенни, Дэвид (21 мая 1982 г.). «К основе классификации: неполнота мер расстояния, анализ несовместимости и фенетическая классификация» . Журнал теоретической биологии . 96 (2): 129–142. Бибкод : 1982JThBi..96..129P . дои : 10.1016/0022-5193(82)90216-8 . ПМИД   7121024 . Архивировано из оригинала 24 января 2022 года . Проверено 19 мая 2022 г.
  11. ^ Пенни, Дэвид; Хенди, доктор медицины (июнь 1985 г.). «Тестирование методов построения эволюционного дерева» . Кладистика . 1 (3): 266–278. дои : 10.1111/j.1096-0031.1985.tb00427.x . ПМИД   34965674 . S2CID   84162845 . Архивировано из оригинала 19 мая 2022 года.
  12. ^ Локхарт, Питер Дж.; Стил, Майкл А.; Хенди, Майкл Д.; Пенни (1994). «Восстановление эволюционных деревьев в рамках более реалистичной модели эволюции последовательностей» . Молекулярная биология и эволюция . 11 (4): 605–612. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136 . ПМИД   19391266 . Архивировано из оригинала 19 мая 2022 года.
  13. ^ Пенни, Дэвид; и др. (1993). «Некоторые недавние успехи в методах построения эволюционных деревьев, Новозеландский журнал ботаники» . Новозеландский журнал ботаники . 31 (3): 275–288. дои : 10.1080/0028825X.1993.10419505 . Архивировано из оригинала 1 июля 2022 года.
  14. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Курляндия, КГ; Коллинз, LJ; Пенни, Д. (июнь 2006 г.). «Геномика и нередуцируемая природа клеток эукариот» . Наука . 312 (5776): 1011–1014. Бибкод : 2006Sci...312.1011K . дои : 10.1126/science.1121674 . ПМИД   16709776 . S2CID   30768101 . Архивировано из оригинала 20 мая 2022 года.
  15. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Годовой отчет Института молекулярных биологических наук (PDF) (Отчет). 2007. Архивировано (PDF) из оригинала 23 февраля 2013 года . Проверено 20 мая 2022 г.
  16. ^ Хэм, Бекки (19 мая 2006 г.). «Может ли эволюция сделать вещи менее сложными?» . Новости Эн-Би-Си . Архивировано из оригинала 18 мая 2021 года . Проверено 21 мая 2022 г.
  17. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Мартин, В.; Даган, Т.; Кунин Е.В.; Дипиппо, JL; Гогартен, JP; Лейк, JA (27 апреля 2007 г.). Кавана, Этта (ред.). «Письма: Эволюция эукариотов – Ответ» . Наука . 316 (5824): 542–543. дои : 10.1126/science.316.5824.542c . ПМИД   17463271 . S2CID   42994518 . Архивировано из оригинала 22 мая 2022 года.
  18. ^ де Нуайер, Сильвестр; Холланд, Барбара Р.; Пенни, Дэвид (июнь 2009 г.). «Появление хищников в молодости: Эдемского сада не было» . ПЛОС ОДИН . 4 (6): е5507. Бибкод : 2009PLoSO...4.5507D . дои : 10.1371/journal.pone.0005507 . ПМК   2685975 . ПМИД   19492046 .
  19. ^ Морган-Ричардс, Мэри; и др. (23 января 2008 г.). «Эволюция птиц: тестирование клады Метавес с шестью новыми митохондриальными геномами» . Эволюционная биология BMC . 8 (20): 20. Бибкод : 2008BMCEE...8...20M . дои : 10.1186/1471-2148-8-20 . ПМК   2259304 . ПМИД   18215323 .
  20. ^ Пратт, Рене К.; и др. (2009). «На пути к решению проблемы глубокой филогении Neoaves: данные, усиление сигнала и предпосылки» . Молекулярная биология и эволюция . 26 (2): 313–326. дои : 10.1093/molbev/msn248 . hdl : 1885/57145 . ПМИД   18981298 . Архивировано из оригинала 24 ноября 2022 года.
  21. ^ Филлипс, Мэтью Дж.; Гибб, Джиллиан С.; Кримп, Элизабет А.; Пенни, Дэвид (январь 2010 г.). «Тинамус и моа собираются вместе: анализ последовательности митохондриального генома показывает независимую потерю способности летать среди ратитов» . Систематическая биология . 59 (1): 90–107. дои : 10.1093/sysbio/syp079 . ПМИД   20525622 . Архивировано из оригинала 22 мая 2022 года.
  22. ^ Университет Мэсси (2 февраля 2010 г.). «ДНК предполагает, что Моа когда-то летал» . Физическая орг . Архивировано из оригинала 28 июля 2015 года . Проверено 23 мая 2022 г.
  23. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Чжун, Боцзянь; Линьхуа, Солнце; Пенни, Дэвид (июль 2015 г.). «Происхождение наземных растений: филогеномическая перспектива» . Эволюционная биоинформатика онлайн . 11 (11): 137–41. дои : 10.4137/EBO.S29089 . ПМЦ   4498653 . ПМИД   26244002 . Архивировано из оригинала 22 мая 2022 года.
  24. ^ Чжун, Боцзянь; и др. (17 октября 2013 г.). «Водоросли-стрептофиты и вопрос происхождения наземных растений с использованием гетерогенных моделей с тремя новыми геномами хлоропластов водорослей» . Молекулярная биология и эволюция . 31 (1): 177–183. дои : 10.1093/molbev/mst200 . ПМИД   24136916 . Архивировано из оригинала 19 мая 2022 года.
  25. ^ Хендерсон, ИМ; Хенди, Майкл Д.; Денни, Дэвид (9 октября 1989 г.). «Вирусы гриппа, кометы и наука об эволюционных деревьях» . Журнал теоретической ботаники . 3 (9): 289–303. Бибкод : 1989JThBi.140..289H . дои : 10.1016/S0022-5193(89)80087-6 . ПМИД   2615399 . Архивировано из оригинала 23 мая 2022 года.
  26. ^ Мэтисон, Джеймс В.; и др. (2006). «Отличительные закономерности эволюции между подгруппами A и B респираторно-синцитиального вируса из новозеландских изолятов, собранных за тридцать семь лет» . Журнал медицинской вирусологии . 78 (10): 1354–1364. дои : 10.1002/jmv.20702 . ПМИД   16927286 . S2CID   7701907 . Архивировано из оригинала 23 мая 2022 года.
  27. ^ Харрисон, Г. Л. Эбби; и др. (20 августа 2013 г.). Худяков, Юрий Евгеньевич (ред.). «Частота заражения вирусом гепатита С и гаплотипами IL28B в Папуа-Новой Гвинее, Фиджи и Кирибати» . ПЛОС ОДИН . 8 (8). Публичная научная библиотека (PLoS): e66749. Бибкод : 2013PLoSO...866749H . дои : 10.1371/journal.pone.0066749 . ISSN   1932-6203 . ПМЦ   3748064 . ПМИД   23976941 . Архивировано из оригинала 23 мая 2022 года.
  28. ^ «Дэвид Пенни: биология и генетика» . Радио Новой Зеландии. 17 марта 2011 г. Архивировано из оригинала 7 февраля 2018 г. Проверено 30 января 2019 г.
  29. ^ Пенни, Дэвид; Фулдс, ЛР; Хенди, доктор медицины (20 мая 1982 г.). «Проверка теории эволюции путем сравнения филогенетических деревьев, построенных из пяти различных белковых последовательностей» . Природа . 297 (5863): 197–200. Бибкод : 1982Natur.297..197P . дои : 10.1038/297197a0 . ПМИД   7078635 . S2CID   4270111 . [ мертвая ссылка ] Все URL
  30. ^ Хенди, Майкл Д.; Пенни, Дэвид (1986). «Как теория эволюции могла быть опровергнута, но это не так». Увлечение статистикой . дои : 10.1201/9781003065388 . ISBN  9781003065388 . S2CID   243399147 . Архивировано из оригинала 5 июня 2022 года.
  31. ^ Пенни, Дэвид; Хенди, Майкл Д.; Сталь, Майкл А. (1991). «Проверка теории происхождения» (PDF) . Филогенетический анализ последовательностей ДНК : 154–183. Архивировано (PDF) из оригинала 17 января 2015 года . Проверено 23 мая 2022 г.
  32. ^ Пенни, Дэвид; Хенди, Майкл Д.; Пул, Энтони М. (2003). «Проверка фундаментальных эволюционных гипотез» . Журнал теоретической биологии . 223 (3): 377–385. Бибкод : 2003JThBi.223..377P . дои : 10.1016/S0022-5193(03)00099-7 . ПМИД   12850457 . Архивировано из оригинала 30 сентября 2023 года . Проверено 1 октября 2023 г.
  33. ^ Пенни, Дэвид (июль 2011 г.). «Теория происхождения Дарвина с модификациями в сравнении с библейским древом жизни» . ПЛОС Биология . 9 (7): e1001096. дои : 10.1371/journal.pbio.1001096 . ПМК   3130011 . ПМИД   21750664 . Архивировано из оригинала 25 июня 2022 года.
  34. ^ «Бывшие президенты» (PDF) . Новозеландская ассоциация ученых. 17 марта 2011 г. Архивировано (PDF) из оригинала 25 января 2022 г. . Проверено 15 ноября 2021 г.
  35. ^ «Некролог Дэвида Пенни» . Новозеландский Вестник . 25 мая 2024 г. Проверено 24 мая 2024 г.
  36. ^ «Умер всемирно признанный учёный из Университета Мэсси» . Стандарт Манавату . 29 мая 2024 г. Проверено 30 мая 2024 г.
  37. ^ «Королевское общество Те Апаранги, наши коллеги по связям с общественностью» . Королевское общество Те Апаранги. Архивировано из оригинала 2 января 2022 года . Проверено 30 января 2019 г.
  38. ^ «Кавалеры медали Резерфорда» . Королевское общество Те Апаранги . Архивировано из оригинала 30 апреля 2017 года . Проверено 20 мая 2022 г.
  39. ^ «Новогодние почести» . Новозеландский вестник Те Кахити о Аотеароа . 13 января 2006 г. Архивировано из оригинала 22 января 2015 г. . Проверено 20 мая 2022 г.
  40. ^ Пенни, Дэвид (2017). Эволюция сейчас . Новая Зеландия: Кслибрис. ISBN  9781499099317 .
  41. ^ Даймонд, Роберт (2017). «Дэвид Пенни бросает вызов «антинаучным» взглядам в своей последней книге» (рецензия на книгу) . Бродвейский мир . Архивировано из оригинала 21 мая 2022 года.
  42. ^ Крэмптон, Джеймс (2018). «Эволюция сегодня» (Рецензия на книгу) . Журнал Королевского общества Новой Зеландии . 48 (4): 291–293. Бибкод : 2018JRSNZ..48..291C . дои : 10.1080/03036758.2017.1392325 . S2CID   220463666 . Архивировано из оригинала 21 мая 2022 г. Альтернативный URL.
  43. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Пенни, Дэвид (ноябрь 2014 г.). «Сотрудничество и эгоизм возникают в ходе молекулярной эволюции» . Биология Директ . 10 (1): 26. дои : 10.1186/s13062-014-0026-5 . ПМК   4266915 . PMID   25486885 . Архивировано из оригинала 23 мая 2022 года.
  44. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Пенни, Дэвид (15 января 2004 г.). «Наша родственная генетика» . Природа . 427 (6971): 208–209. дои : 10.1038/427208a . ПМИД   14724623 . S2CID   4341090 . Архивировано из оригинала 1 июля 2022 года.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 6e083d2718265cd52c79b9c81c166b8f__1720575420
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/6e/8f/6e083d2718265cd52c79b9c81c166b8f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
David Penny - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)