Белок набор

НАБОР
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2E50
Идентификаторы
Псевдонимы	SET , 2PP2A, I2PP2A, IGAAD, IPP2A2, PHAPII, TAF-I, TAF-IBETA, SET ядерный протоонкоген, MRD58
Внешние идентификаторы	Омим : 600960 ; MGI : 1860267 ; Гомологен : 55707 ; GeneCards : Set ; OMA : SET - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	128,696,400 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	29,962,589 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; ventricular zone; ; epithelium of nasopharynx; ; epithelium of colon; ; germinal epithelium; ; palpebral conjunctiva; ; lymph node; ; optic nerve; ; parietal pleura;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; epiblast; ; abdominal wall; ; migratory enteric neural crest cell; ; morula; ; ventricular zone; ; embryo; ; vas deferens; ; primitive streak; ; somite;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding; histone binding; protein binding; protein phosphatase inhibitor activity; protein phosphatase regulator activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; nucleoplasm; endoplasmic reticulum; perinuclear region of cytoplasm; nucleus; lipid droplet; protein-containing complex;
Biological process	negative regulation of neuron apoptotic process; nucleosome assembly; regulation of mRNA stability; DNA replication; nucleosome disassembly; nucleocytoplasmic transport; viral process; negative regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of histone acetylation; negative regulation of catalytic activity; regulation of catalytic activity; negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity; regulation of phosphoprotein phosphatase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6418
	56086
	ENSG00000119335
	Ensmusg00000054766
	Q01105
	Q9equ5
	NM_001122821 ; NM_001248000 ; NM_001248001 ; NM_003011 ; NM_001374326
	NM_001204875 ; NM_023871
	NP_001116293 ; NP_001234929 ; NP_001234930 ; NP_003002 ; NP_001361255
	NP_001191804 ; NP_076360
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Набор белка , также известный как набор белков 1 , представляет собой белок , который у людей кодируется SET геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что набор белка взаимодействует :

Кислотный лейциновый ядерный фосфопротеин 32 член семейства A , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
Cdk5r1 , ^{[ 10 ]}
KLF5 , ^{[ 11 ]}
NME1 , ^{[ 12 ]} и
TIF1A . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000119335 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000054766 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Фон Линдн М., Ван Баал С., Вигант Дж., Раап А., Хагемейер А., Гросвельд Г. (август 1992). «Может, предполагаемый онкоген, связанный с миелоидным лейкозом, может быть активирован путем слияния его 3 'половины к разным генам: характеристика установленного гена» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (8): 3346–55. doi : 10.1128/mcb.12.8.3346 . PMC 364582 . PMID 1630450 .
^ Ли М., Маккинье А., Дамуни З. (май 1996 г.). «Набор белков, ассоциированного с миелоидом, является мощным ингибитором белковой фосфатазы 2A» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11059–62. doi : 10.1074/jbc.271.19.11059 . PMID 8626647 .
^ «Ген Entrez: установленная набор транслокация (миелоидный лейкоз, связанный с лейкозом)» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} SEO SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (январь 2001 г.). «Регуляция ацетилирования и транскрипции гистонов путем Inhat, клеточный комплекс человека, содержащий набор онкопротеина» . Клетка . 104 (1): 119–30. doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 00196-9 . PMID 11163245 . S2CID 11144887 .
^ Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (апрель 2002 г.). «HMG2 взаимодействует с набором белков сборки нуклеосомы и является мишенью цитотоксической Т-лимфоцитарной протеазы Гранзим А» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2810–20. doi : 10.1128/mcb.22.8.2810-2820.2002 . PMC 133744 . PMID 11909973 .
^ Qu D, Li Q, Lim Hy, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (март 2002 г.). «Набор белков связывает нейрональный активатор CDK5 P35NCK5A и модулирует активность CDK5/P35NCK5A» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7324–32. doi : 10.1074/jbc.m107270200 . HDL : 10536/dro/du: 30101408 . PMID 11741927 .
^ Miyamoto S, Suzuki T, Muto S, Aizawa K, Kimura A, Mizuno Y, Nagino T, Imai Y, Adachi N, Horikoshi M, Nagai R (Dec 2003). «Положительная и отрицательная регуляция сердечно-сосудистой транскрипционной фактора KLF5 с помощью p300 и онкогенного регулятора, устанавливающегося посредством взаимодействия и ацетилирования на ДНК-связывающем домене» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (23): 8528–41. doi : 10.1128/mcb.23.23.8528-8541.2003 . PMC 262669 . PMID 14612398 .
^ Fan Z, Beresford PJ, Oh Dy, Zhang D, Lieberman J (март 2003 г.). «Супрессор опухоли NM23-H1 представляет собой гранзим A-активированную ДНКазу во время CTL-опосредованного апоптоза, а набор белков сборки нуклеосом является его ингибитором» . Клетка . 112 (5): 659–72. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00150-8 . PMID 12628186 . S2CID 14019153 .

Дальнейшее чтение

Нагата К., Кавасе Х., Ханда Х, Яно К, Ямасаки М., Исими Ю., Окуда А., Кикучи А., Мацумото К (май 1995). «Коэффициент репликации, кодируемый предполагаемым онкогеном, установленным, связанным с миелоидным лейкозом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (10): 4279–83. Bibcode : 1995pnas ... 92.4279n . doi : 10.1073/pnas.92.10.4279 . PMC 41927 . PMID 7753797 .
Maruyama K, Sugano S (январь 1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Адачи Y, Павлакис Г.Н., Коупленд Т.Д. (март 1994). «Идентификация сайтов фосфорилирования in vivo набора, ядерной фосфопротеины, кодируемого точкой перерыва транслокации при острой недифференцированной лейкозе» . Письма Febs . 340 (3): 231–5. Bibcode : 1994febsl.340..231a . doi : 10.1016/0014-5793 (94) 80144-4 . PMID 8131851 . S2CID 36974869 .
Vaesen M, Barnikol-Watanabe S, Götz H, Awni La, Cole T, Zimmermann B, Kratzin HD, Hilschmann N (февраль 1994 г.). «Очистка и характеристика двух предполагаемых белков HLA класса II: Phapi и Phapii». Биологическая химия Hoppe-Seyler . 375 (2): 113–26. doi : 10.1515/bchm3.1994.375.2.113 . PMID 8192856 .
Адачи Y, Павлакис Г.Н., Коупленд Т.Д. (январь 1994). «Идентификация и характеристика набора, ядерный фосфопротеин, кодируемый точкой разрыва транслокации при острой недифференцированной лейкозе» . Журнал биологической химии . 269 (3): 2258–62. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 42162-4 . PMID 8294483 .
Adler HT, Nallaseth FS, Walter G, Tkachuk DC (ноябрь 1997 г.). «Лейкемические слитые белки HRX образуют гетерокомплекс с набором белка, ассоциированного с лейкозом, и белковой фосфатазой 2а» . Журнал биологической химии . 272 (45): 28407–14. doi : 10.1074/jbc.272.45.28407 . PMID 9353299 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Carlson SG, Eng E, Kim EG, Perlman EJ, Copeland TD, Ballermann BJ (октябрь 1998 г.). «Экспрессия SET, ингибитор белковой фосфатазы 2A, в развитии почек и опухоли Вильмса» . Журнал Американского общества нефрологии . 9 (10): 1873–80. doi : 10.1681/asn.v9101873 . PMID 9773788 .
Brennan CM, Gallouzi IE, Steitz JA (октябрь 2000). «Протеиновые лиганды, чтобы ухаживать за модуляцией его взаимодействия с мРНК -мишенью in vivo» . Журнал клеточной биологии . 151 (1): 1–14. doi : 10.1083/jcb.151.1.1 . PMC 2189805 . PMID 11018049 .
Шикама Н., Чан Х.М., Крстич-Демонокос М., Смит Л., Ли К.В., Кернс В., Ла Тангю Н.Б. (декабрь 2000). «Функциональное взаимодействие между белками сборки нуклеосом и коактиваторами семейства белков P300/CREB» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8933–43. doi : 10.1128/mcb.20.23.8933-8943.2000 . PMC 86548 . PMID 11073993 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (ноябрь 2000). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Исследование генома . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
SEO SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (январь 2001 г.). «Регуляция ацетилирования и транскрипции гистонов путем Inhat, клеточный комплекс человека, содержащий набор онкопротеина» . Клетка . 104 (1): 119–30. doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 00196-9 . PMID 11163245 . S2CID 11144887 .
Минакучи М., Каказу Н., Горрин-Ривас М.Дж., Абэ Т., Коупленд Т.Д., Уэда К., Адачи Ю (март 2001 г.). «Идентификация и характеристика SEB, нового белка, который связывается с острым недифференцированным набором белков, ассоциированного с лейкозом» (PDF) . Европейский журнал биохимии . 268 (5): 1340–51. doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02000.x . HDL : 2433/150179 . PMID 11231286 .
Beresford PJ, Zhang D, Oh Dy, Fan Z, Greer EL, Russo ML, Jaju M, Lieberman J (ноябрь 2001 г.). «Гранзим А активирует эндоплазматическую ретикулуму, связанную с каспаз-независимой нуклеазой, чтобы индуцировать одноцепочечную ДНК» . Журнал биологической химии . 276 (46): 43285–93. doi : 10.1074/jbc.m108137200 . PMID 11555662 .
Qu D, Li Q, Lim Hy, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (март 2002 г.). «Набор белков связывает нейрональный активатор CDK5 P35NCK5A и модулирует активность CDK5/P35NCK5A» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7324–32. doi : 10.1074/jbc.m107270200 . HDL : 10536/dro/du: 30101408 . PMID 11741927 .
Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (апрель 2002 г.). «HMG2 взаимодействует с набором белков сборки нуклеосомы и является мишенью цитотоксической Т-лимфоцитарной протеазы Гранзим А» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2810–20. doi : 10.1128/mcb.22.8.2810-2820.2002 . PMC 133744 . PMID 11909973 .
Cervoni N, Detich N, Seo SB, Chakravarti D, Szyf M (Jul 2002). «Набор онкопротеинов/TAF-1beta, ингибитор гистонцетилтрансферазы, ингибирует активное деметилирование ДНК, интегрируя метилирование ДНК и молчание транскрипции» . Журнал биологической химии . 277 (28): 25026–31. doi : 10.1074/jbc.m202256200 . PMID 11978794 .

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000119335 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000054766 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid1630450-5] Фон Линдн М., Ван Баал С., Вигант Дж., Раап А., Хагемейер А., Гросвельд Г. (август 1992). «Может, предполагаемый онкоген, связанный с миелоидным лейкозом, может быть активирован путем слияния его 3 'половины к разным генам: характеристика установленного гена» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (8): 3346–55. doi : 10.1128/mcb.12.8.3346 . PMC 364582 . PMID 1630450 .

[pmid8626647-6] Ли М., Маккинье А., Дамуни З. (май 1996 г.). «Набор белков, ассоциированного с миелоидом, является мощным ингибитором белковой фосфатазы 2A» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11059–62. doi : 10.1074/jbc.271.19.11059 . PMID 8626647 .

[entrez-7] «Ген Entrez: установленная набор транслокация (миелоидный лейкоз, связанный с лейкозом)» .

[pmid11163245-8] Jump up to: ^а ^{беременный} SEO SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (январь 2001 г.). «Регуляция ацетилирования и транскрипции гистонов путем Inhat, клеточный комплекс человека, содержащий набор онкопротеина» . Клетка . 104 (1): 119–30. doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 00196-9 . PMID 11163245 . S2CID 11144887 .

[pmid11909973-9] Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (апрель 2002 г.). «HMG2 взаимодействует с набором белков сборки нуклеосомы и является мишенью цитотоксической Т-лимфоцитарной протеазы Гранзим А» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2810–20. doi : 10.1128/mcb.22.8.2810-2820.2002 . PMC 133744 . PMID 11909973 .

[pmid11741927-10] Qu D, Li Q, Lim Hy, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (март 2002 г.). «Набор белков связывает нейрональный активатор CDK5 P35NCK5A и модулирует активность CDK5/P35NCK5A» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7324–32. doi : 10.1074/jbc.m107270200 . HDL : 10536/dro/du: 30101408 . PMID 11741927 .

[pmid14612398-11] Miyamoto S, Suzuki T, Muto S, Aizawa K, Kimura A, Mizuno Y, Nagino T, Imai Y, Adachi N, Horikoshi M, Nagai R (Dec 2003). «Положительная и отрицательная регуляция сердечно-сосудистой транскрипционной фактора KLF5 с помощью p300 и онкогенного регулятора, устанавливающегося посредством взаимодействия и ацетилирования на ДНК-связывающем домене» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (23): 8528–41. doi : 10.1128/mcb.23.23.8528-8541.2003 . PMC 262669 . PMID 14612398 .

[pmid12628186-12] Fan Z, Beresford PJ, Oh Dy, Zhang D, Lieberman J (март 2003 г.). «Супрессор опухоли NM23-H1 представляет собой гранзим A-активированную ДНКазу во время CTL-опосредованного апоптоза, а набор белков сборки нуклеосом является его ингибитором» . Клетка . 112 (5): 659–72. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00150-8 . PMID 12628186 . S2CID 14019153 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]