СНАПК4

СНАПК4
Идентификаторы
Псевдонимы	SNAPC4 , PTFalpha, SNAP190, полипептид 4 комплекса, активирующего малую ядерную РНК
Внешние идентификаторы	Опустить : 602777 ; МГИ : 2443935 ; Гомологен : 2321 ; GeneCards : SNAPC4 ; OMA : SNAPC4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	136,400,176 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	26,270,665 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; endothelial cell; ; right uterine tube; ; paraflocculus of cerebellum; ; right testis; ; left testis; ; right hemisphere of cerebellum; ; frontal pole; ; pancreatic ductal cell; ; nasal epithelium;
	Top expressed in
	superior frontal gyrus; ; neural layer of retina; ; primary visual cortex; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; spermatocyte; ; yolk sac; ; ventricular zone; ; cerebellar cortex;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; snRNA-activating protein complex;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; snRNA transcription by RNA polymerase III; transcription by RNA polymerase III; regulation of transcription by RNA polymerase II; snRNA transcription by RNA polymerase II; cell differentiation; snRNA transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6621
	227644
	ENSG00000165684
	ENSMUSG00000036281
	Q5SXM2
	Q8BP86
	НМ_003086 ; НМ_001394201 ; НМ_001394202 ; НМ_001394203
	НМ_001290419 ; НМ_172339
	НП_003077
showНП_001277348 ; НП_758842 ; НП_001393660 ; НП_001393661 ; НП_001393662 ;
	NP_001393663; NP_001393664; NP_001393665; NP_001393666; NP_001393667; NP_001393668
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 4 белкового комплекса, активирующего мяРНК, представляет собой белок , который у человека кодируется SNAPC4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNAPC4 взаимодействует с SNAPC1 . ^{[ 7 ]} ПОУ2Ф1 ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} и СНАПК2 . ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165684 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036281 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Вонг М.В., Генри Р.В., Ма Б., Кобаяши Р., Клагес Н., Маттиас П., Струбин М., Эрнандес Н. (январь 1998 г.). «Большая субъединица базального фактора транскрипции SNAPc представляет собой белок домена Myb, который взаимодействует с Oct-1» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (1): 368–77. дои : 10.1128/mcb.18.1.368 . ПМК 121507 . ПМИД 9418884 .
^ «Ген Энтрез: комплекс, активирующий малую ядерную РНК SNAPC4, полипептид 4, 190 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б Ма Б., Эрнандес Н. (февраль 2001 г.). «Карта белок-белковых контактов внутри малого ядерного РНК-активирующего белкового комплекса SNAPc» . Журнал биологической химии . 276 (7): 5027–35. дои : 10.1074/jbc.M009301200 . ПМИД 11056176 .
^ Ховде С., Брукс А., Стронг К., Гейгер Дж. Х. (март 2002 г.). «Кристаллизация комплекса пептид/ДНК Oct-1/SNAP190». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (Часть 3): 511–2. Бибкод : 2002AcCrD..58..511H . дои : 10.1107/S0907444901021461 . ПМИД 11856838 .

Дальнейшее чтение

Генри Р.В., Садовски К.Л., Кобаяши Р., Эрнандес Н. (апрель 1995 г.). «Комплекс TBP-TAF, необходимый для транскрипции генов мяРНК человека РНК-полимеразой II и III». Природа . 374 (6523): 653–6. Бибкод : 1995Natur.374..653H . дои : 10.1038/374653a0 . ПМИД 7715707 . S2CID 4325527 .
Ма Б., Эрнандес Н. (февраль 2001 г.). «Карта белок-белковых контактов внутри малого ядерного РНК-активирующего белкового комплекса SNAPc» . Журнал биологической химии . 276 (7): 5027–35. дои : 10.1074/jbc.M009301200 . ПМИД 11056176 .
Ховде С., Брукс А., Стронг К., Гейгер Дж. Х. (март 2002 г.). «Кристаллизация комплекса пептид/ДНК Oct-1/SNAP190». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (Часть 3): 511–2. Бибкод : 2002AcCrD..58..511H . дои : 10.1107/S0907444901021461 . ПМИД 11856838 .
Хинкли К.С., Хирш Х.А., Гу Л., ЛаМер Б., Генри Р.В. (май 2003 г.). «ДНК-связывающий домен малого ядерного РНК-активирующего белка 190 Myb стимулирует распознавание TATA-бокс-связывающего белка и TATA-бокса» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18649–57. дои : 10.1074/jbc.M204247200 . ПМИД 12621023 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Гу Л., Эссельман В.Дж., Генри Р.В. (июль 2005 г.). «Сотрудничество между малым ядерным РНК-активирующим белковым комплексом (SNAPC) и белком, связывающим TATA-бокс, противодействует ингибированию протеинкиназой CK2 связывания ДНК с помощью SNAPC» . Журнал биологической химии . 280 (30): 27697–704. дои : 10.1074/jbc.M503206200 . ПМИД 15955816 .
Гу Л., Хусейн-Поннампалам Р., Хоффманн-Беннинг С., Генри Р.В. (сентябрь 2007 г.). «Протеинкиназа CK2 фосфорилирует SNAP190, чтобы отрицательно регулировать связывание ДНК SNAPC и транскрипцию U6 человека с помощью РНК-полимеразы III» . Журнал биологической химии . 282 (38): 27887–96. дои : 10.1074/jbc.M702269200 . ПМИД 17670747 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165684 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036281 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9418884-5] Jump up to: ^а ^б ^с Вонг М.В., Генри Р.В., Ма Б., Кобаяши Р., Клагес Н., Маттиас П., Струбин М., Эрнандес Н. (январь 1998 г.). «Большая субъединица базального фактора транскрипции SNAPc представляет собой белок домена Myb, который взаимодействует с Oct-1» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (1): 368–77. дои : 10.1128/mcb.18.1.368 . ПМК 121507 . ПМИД 9418884 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: комплекс, активирующий малую ядерную РНК SNAPC4, полипептид 4, 190 кДа» .

[pmid11056176-7] Jump up to: ^а ^б Ма Б., Эрнандес Н. (февраль 2001 г.). «Карта белок-белковых контактов внутри малого ядерного РНК-активирующего белкового комплекса SNAPc» . Журнал биологической химии . 276 (7): 5027–35. дои : 10.1074/jbc.M009301200 . ПМИД 11056176 .

[pmid11856838-8] Ховде С., Брукс А., Стронг К., Гейгер Дж. Х. (март 2002 г.). «Кристаллизация комплекса пептид/ДНК Oct-1/SNAP190». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (Часть 3): 511–2. Бибкод : 2002AcCrD..58..511H . дои : 10.1107/S0907444901021461 . ПМИД 11856838 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]