Тревор Лоули
Тревор Лоули FMedSci — преподаватель и руководитель группы в лаборатории взаимодействия хозяина и микробиоты в Институте Велкома Сэнгера (WSI) . Он также является соучредителем и главным научным директором биотехнологической компании Microbiotica.
За свою карьеру Лоули стал пионером в применении высокопроизводительных подходов к геномике и культивированию для характеристики кишечных патогенов и исследования микробиомов, содержащихся на организмах-хозяевах и внутри них, в периоды здоровья и болезней.
Образование и карьера
[ редактировать ]Лоули получил степень бакалавра биологии в 1997 году в Университете Акадии . Затем он учился на докторскую степень в Университете Альберты , в лабораториях Дайаны Тейлор и Лоры Фрост, где изучал механизмы, которые патогенные бактерии используют для распространения генов устойчивости к антибиотикам. [1] После получения докторской степени Тревор получил Канадского института медицинских исследований постдокторскую стипендию для работы в лабораториях Стэнли Фалькоу и Дениз Монак в Стэнфордском университете , где он изучал влияние лечения антибиотиками на заболевание и передачу сальмонеллы. [2]
В 2007 году Лоули получил премию Лондонского королевского общества за начало исследовательской программы по Clostridiodes difficile заболеванию и передаче в Институте Wellcome Sanger . В 2010 году он был назначен научным сотрудником по развитию карьеры на факультете Института Сэнгера, а в 2014 году был назначен руководителем группы факультета и старшим руководителем группы в 2021 году.
В декабре 2016 года Лоули вместе с Гордоном Дуганом и Майком Романосом стал соучредителем биотехнологической компании Microbiotica благодаря стартовому финансированию в размере 12 миллионов фунтов стерлингов от Cambridge Innovation Capital, IP Group и Seventure. В марте 2022 года Microbiotica получила финансирование серии B для проведения двух клинических исследований на пациентах с раком и язвенным колитом. [3] Microbiotica разрабатывает живые бактериальные препараты , биомаркеры и технологии на основе микробиома, ориентированные на аутоиммунные заболевания и рак .
Исследовать
[ редактировать ]Лоули возглавляет лабораторию взаимодействия хозяина и микробиоты в Институте Сэнгера, которая исследует отношения между людьми и бактериями и вирусами, которые вместе формируют их микробиом. [4]
Лоули и его команда используют ряд методов и инструментов, включая крупномасштабный метагеномный анализ, генетику, мышиные и клеточные модели, современное культивирование микробов , транскриптомику , протеомику и машинное обучение , для исследования микробных сообществ, связанных со здоровьем человека. а также ряд нарушений развития, болезней и плохо изученных синдромов. Их особенно интересует, как микробиом влияет на долгосрочный рост, развитие и устойчивость к болезням детей из западных стран, а также стран с низким и средним уровнем дохода.
Они работали над концепциями, аналитическими инструментами и методологией, позволяющими делать фундаментальные открытия и переводить лекарства и диагностику из микробиома человека, используя подходы, основанные на данных и гипотезах.
Они сосредоточены на нескольких ключевых областях, включая:
- Характеристика эволюции таксономического и функционального разнообразия микробиома человека; [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11]
- Исследование микробиома раннего возраста и того, как родовые и клинические вмешательства влияют на приобретение и сборку микробиома. [12] [13] [14]
- Понимание взаимодействия хозяина и микробиома и факторов воспалительных заболеваний и рака [15] [16] [17] [18]
- Изучение фундаментальной биологии, передачи и патогенеза C. difficile . [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25]
Группа Лоули является автором более 100 статей. Их работа регулярно освещается в научной и популярной прессе. [26] [27]
Награды и почести
[ редактировать ]Лоули был избран членом Академии медицинских наук в 2023 году. [28] В 2015 году Лоули получила «Премию новатора» Фонда Пегги Лиллис за новаторскую работу в области живой биотерапии.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лоули, Тревор (2003). Жизненный цикл конъюгативной плазмиды (кандидатская диссертация) (Диссертация). Университет Альберты.
- ^ https://webapps.cihr-irsc.gc.ca/funding/detail_e?pResearchId=9805600&p_version=CIHR&p_language=E&p_session_id=3266369 [ мертвая ссылка ]
- ^ «Микробиотика готова пересечь терапевтический порог с достижением важной вехи клинических испытаний» . Кембриджский независимый . 01.07.2022 . Проверено 22 июня 2023 г.
- ^ «Лаборатория Лоули» . www.sanger.ac.uk . Проверено 24 октября 2023 г.
- ^ Камарильо-Герреро, Луис Ф.; Алмейда, Александр; Ранхель-Пинерос, Гильермо; Финн, Роберт Д.; Лоули, Тревор Д. (февраль 2021 г.). «Массовое расширение разнообразия кишечных бактериофагов человека» . Клетка . 184 (4): 1098–1109.е9. дои : 10.1016/j.cell.2021.01.029 . ПМЦ 7895897 . ПМИД 33606979 .
- ^ Бересфорд-Джонс, Бенджамин С.; Форстер, Сэмюэл К.; Старс, Марк Д.; Нотли, Джордж; Вичиани, Элиза; Браун, Хилари П.; Бёмлер, Дэниел Дж.; Содерхольм, Амелия Т.; Кумар, Нитин; Вервье, Кевин; Кросс, Джастин Р.; Алмейда, Александр; Лоули, Тревор Д.; Педикорд, Вирджиния А. (январь 2022 г.). «Каталог мышиных желудочно-кишечных бактерий обеспечивает трансляцию между микробиотой кишечника мыши и человека посредством функционального картирования» . Клетка-хозяин и микроб . 30 (1): 124–138.e8. дои : 10.1016/j.chom.2021.12.003 . ПМЦ 8763404 . ПМИД 34971560 .
- ^ Браун, Хилари П.; Алмейда, Александр; Кумар, Нитин; Вервье, Кевин; Адум, Энн Т.; Вичиани, Элиза; Доусон, Николас-младший; Форстер, Сэмюэл К.; Корми, Клэр; Гулдинг, Дэвид; Лоули, Тревор Д. (декабрь 2021 г.). «Адаптация хозяина в кишечнике Firmicutes связана с потерей споруляции и изменением цикла передачи» . Геномная биология . 22 (1): 204. дои : 10.1186/s13059-021-02428-6 . ISSN 1474-760X . ПМЦ 8340488 . ПМИД 34348764 .
- ^ Джеймс, Кайли Р.; Гомес, Томас; Эльментайте, Раса; Кумар, Нитин; Гулливер, Эмили Л.; Кинг, Хэмиш В.; Старс, Марк Д.; Бэрэм, Бетани Р.; Фердинанд, Джон Р.; Петрова, Велислава Н.; Полански, Кшиштоф; Форстер, Сэмюэл К.; Джарвис, Лорна Б.; Суханек, Ондрей; Хоулетт, Сара (2 марта 2020 г.). «Отличительные микробные и иммунные ниши толстой кишки человека» . Природная иммунология . 21 (3): 343–353. дои : 10.1038/s41590-020-0602-z . ISSN 1529-2908 . ПМК 7212050 . ПМИД 32066951 .
- ^ Алмейда, Александр; Митчелл, Алекс Л.; Боланд, Мигель; Форстер, Сэмюэл К.; Глур, Грегори Б.; Тарковская, Александра; Лоули, Тревор Д.; Финн, Роберт Д. (25 апреля 2019 г.). «Новый геномный план микробиоты кишечника человека» . Природа . 568 (7753): 499–504. Бибкод : 2019Natur.568..499A . дои : 10.1038/s41586-019-0965-1 . ISSN 0028-0836 . ПМК 6784870 . ПМИД 30745586 .
- ^ Форстер, Сэмюэл К.; Кумар, Нитин; Анонье, Блессинг О.; Алмейда, Александр; Вичиани, Элиза; Старс, Марк Д.; Данн, Мэтью; Мкандавире, Тапока Т.; Чжу, Ана; Шао, Ян; Пайк, Линдси Дж.; Луи, Томас; Браун, Хилари П.; Митчелл, Алекс Л.; Невилл, Б. Энн (февраль 2019 г.). «Коллекция генома и культур кишечных бактерий человека для улучшенного метагеномного анализа» . Природная биотехнология . 37 (2): 186–192. дои : 10.1038/s41587-018-0009-7 . ISSN 1087-0156 . ПМК 6785715 . ПМИД 30718869 .
- ^ Браун, Хилари П.; Форстер, Сэмюэл К.; Анонье, Блессинг О.; Кумар, Нитин; Невилл, Б. Энн; Старс, Марк Д.; Гулдинг, Дэвид; Лоули, Тревор Д. (26 мая 2016 г.). «Культивирование «некультивируемой» человеческой микробиоты выявляет новые таксоны и обширное спорообразование» . Природа . 533 (7604): 543–546. Бибкод : 2016Natur.533..543B . дои : 10.1038/nature17645 . ISSN 0028-0836 . ПМЦ 4890681 . ПМИД 27144353 .
- ^ Шао, Ян; Форстер, Сэмюэл К.; Цалики, Евдокия; Вервье, Кевин; Стрэнг, Анджела; Симпсон, Нанди; Кумар, Нитин; Старс, Марк Д.; Роджер, Элисон; Броклхерст, Питер; Филд, Найджел; Лоули, Тревор Д. (3 октября 2019 г.). «Замедленная микробиота и колонизация условно-патогенных микроорганизмов при родах с помощью кесарева сечения» . Природа . 574 (7776): 117–121. Бибкод : 2019Natur.574..117S . дои : 10.1038/s41586-019-1560-1 . ISSN 0028-0836 . ПМК 6894937 . ПМИД 31534227 .
- ^ Нджунге, Джеймс М.; Тикелл, Киркби; Диалло, Абдулай Хама; Саим бин Шахид, Абу Садат Мохаммад; Гази, штат Мэриленд Амран; Салим, Али; Кази, Заубина; Али, Сайед; Тигои, Кэролайн; Мупере, Иезекииль; Лансиони, Кристина Л.; Ёсиока, Эмили; Чисти, Мохаммод Джобайер; Мбуру, Моисей; Нгари, Моисей (3 ноября 2022 г.). «Протокол исследования вложенных когортных исследований сети детских острых заболеваний и питания (CHAIN): мультиомический подход к пониманию смертности среди детей в странах Африки к югу от Сахары и Южной Азии» . Открытое исследование Гейтса . 6 : 77. doi : 10.12688/gatesopenres.13635.2 . ISSN 2572-4754 . ПМЦ 9646488 . ПМИД 36415883 .
- ^ Браун, Хилари П; Шао, Ян; Лоули, Тревор Д. (октябрь 2022 г.). «Передача микробиоты человека от матери к ребенку» . Современное мнение в микробиологии . 69 : 102173. doi : 10.1016/j.mib.2022.102173 . ПМИД 35785616 . S2CID 250239760 .
- ^ Виллемен, Клелия; Шесть, Энн; Невилл, Б. Энн; Лоули, Тревор Д.; Робинсон, Мэтью Дж.; Бакдаш, Гейт (январь 2023 г.). «Повышенное значение микробиома в иммунотерапии рака» . Тенденции в иммунологии . 44 (1): 44–59. дои : 10.1016/j.it.2022.11.002 . ПМИД 36464584 . S2CID 254245428 .
- ^ Гунджур, Ашрей; Манрике-Ринкон, Андреа Дж; Кляйн, Оливер; Берен, Андреас; Лоули, Тревор Д.; Уэлш, Сара Дж; Адамс, Дэвид Дж. (июль 2022 г.). « Познай самого себя – факторы хозяина, влияющие на реакцию рака на ингибиторы иммунных контрольных точек» . Журнал патологии . 257 (4): 513–525. дои : 10.1002/путь.5907 . ISSN 0022-3417 . ПМЦ 9320825 . ПМИД 35394069 .
- ^ Томпсон, Никола А.; Стюарт, Грант Д.; Уэлш, Сара Дж.; Доэрти, Гэри Дж.; Робинсон, Мэтью Дж.; Невилл, Б. Энн; Вервье, Кевин; Харрис, Саймон Р.; Адамс, Дэвид Дж.; Далхау, Кэти; Брюс, Дэвид; Демирис, Николаос; Лоули, Тревор Д.; Корри, Пиппа Г. (декабрь 2022 г.). «Протокол исследования MITRE: исследование по оценке микробиома как биомаркера эффективности и токсичности у онкологических больных, получающих терапию ингибиторами иммунных контрольных точек» . БМК Рак . 22 (1): 99. дои : 10.1186/s12885-021-09156-x . ISSN 1471-2407 . ПМЦ 8785032 . ПМИД 35073853 .
- ^ Форстер, Сэмюэл К.; Клэр, Саймон; Бересфорд-Джонс, Бенджамин С.; Харкорт, Кэтрин; Нотли, Джордж; Старс, Марк Д.; Кумар, Нитин; Содерхольм, Амелия Т.; Адум, Энн; Вонг, Ханна; Морон, Белен; Брандт, Корделия; Дуган, Гордон; Адамс, Дэвид Дж.; Малой, Кевин Дж. (01 апреля 2022 г.). «Идентификация видов кишечных микробов, связанных с изменчивостью заболевания, в широко используемой мышиной модели колита» . Природная микробиология . 7 (4): 590–599. дои : 10.1038/s41564-022-01094-z . ISSN 2058-5276 . ПМЦ 8975739 . ПМИД 35365791 .
- ^ Кумар, Нитин; Браун, Хилари П.; Вичиани, Элиза; Форстер, Сэмюэл К.; Клэр, Саймон; Харкорт, Кэтрин; Старс, Марк Д.; Дуган, Гордон; Фэрли, Дерек Дж.; Робертс, Пол; Пирмохамед, Мунир; Клоки, Марта Р.Дж.; Йенсен, Ми Биргитте Фрид; Харгривз, Кэтрин Р.; Ип, Маргарет (сентябрь 2019 г.). «Адаптация цикла передачи хозяина во время видообразования Clostridium difficile» . Природная генетика . 51 (9): 1315–1320. дои : 10.1038/s41588-019-0478-8 . hdl : 2436/623457 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 31406348 . S2CID 256819220 .
- ^ Коллинз, Дж.; Робинсон, К.; Данхоф, Х.; Кнетч, CW; ван Леувен, ХК; Лоули, Т.Д.; Аухтунг, Дж. М.; Бриттон, РА (январь 2018 г.). «Диетическая трегалоза повышает вирулентность эпидемии Clostridium difficile» . Природа . 553 (7688): 291–294. Бибкод : 2018Natur.553..291C . дои : 10.1038/nature25178 . ISSN 0028-0836 . ПМЦ 5984069 . ПМИД 29310122 .
- ^ Кнетч, CW; Кумар, Н.; Форстер, Южная Каролина; Коннор, TR; Браун, HP; Харманус, К.; Сандерс, ИМ; Харрис, СР; Тернер, Л.; Моррис, Т.; Перри, М.; Миядзима, Ф.; Робертс, П.; Пирмохамед, М.; Сонгер, Дж. Г. (март 2018 г.). Фенвик, Брэд (ред.). «Зоонозная передача Clostridium difficile, обладающего устойчивостью к противомикробным препаратам, между сельскохозяйственными животными и людьми» . Журнал клинической микробиологии . 56 (3). дои : 10.1128/JCM.01384-17 . ISSN 0095-1137 . ПМК 5824051 . ПМИД 29237792 .
- ^ Кумар, Нитин; Миядзима, Фабио; Он, Мяо; Робертс, Пол; Суэйл, Эндрю; Эллисон, Луиза; Пикард, Дерек; Смит, Годфри; Молинье, Ребекка; Дуган, Гордон; Паркхилл, Джулиан; Рен, Брендан В.; Парри, Кристофер М.; Пирмохамед, Мунир; Лоули, Тревор Д. (15 марта 2016 г.). «Геномное отслеживание инфекций позволяет выявить динамику передачи Clostridium difficile и рецидивов заболевания» . Клинические инфекционные болезни . 62 (6): 746–752. дои : 10.1093/cid/civ1031 . ISSN 1058-4838 . ПМЦ 4772841 . ПМИД 26683317 .
- ^ Фимлейд, Келли А.; Бонд, Джеффри П.; Шутц, Кристин С.; Патнэм, Эмили Э.; Люнг, Жаклин М.; Лоули, Тревор Д.; Шен, Эйми (8 августа 2013 г.). Виолье, Патрик Х. (ред.). «Глобальный анализ пути спорообразования Clostridium difficile» . ПЛОС Генетика . 9 (8): e1003660. дои : 10.1371/journal.pgen.1003660 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 3738446 . ПМИД 23950727 .
- ^ Он, Мяо; Миядзима, Фабио; Робертс, Пол; Эллисон, Луиза; Пикард, Дерек Дж; Мартин, Мелисса Дж; Коннор, Томас Р.; Харрис, Саймон Р.; Фэрли, Дерек; Бэмфорд, Кэтлин Б; Д'Арк, Стефани; Брейзер, Джон; Браун, Дерек; Койя, Джон Э; Дус, Гилл (январь 2013 г.). «Появление и глобальное распространение эпидемической инфекции Clostridium difficile, связанной со здравоохранением» . Природная генетика . 45 (1): 109–113. дои : 10.1038/ng.2478 . ISSN 1061-4036 . ПМЦ 3605770 . ПМИД 23222960 .
- ^ Лоули, Тревор Д.; Клэр, Саймон; Уокер, Алан В.; Старс, Марк Д.; Коннор, Томас Р.; Райзен, Клэр; Гулдинг, Дэвид; Рад, Роланд; Шрайбер, Фернанда; Брандт, Корделия; Дикин, Лаура Дж.; Пикард, Дерек Дж.; Дункан, Сильвия Х.; Флинт, Гарри Дж.; Кларк, Таане Г. (25 октября 2012 г.). Гилмор, Майкл С. (ред.). «Целевое восстановление кишечной микробиоты с помощью простой, определенной бактериотерапии позволяет решить рецидивирующую болезнь Clostridium difficile у мышей» . ПЛОС Патогены . 8 (10): е1002995. дои : 10.1371/journal.ppat.1002995 . ISSN 1553-7374 . ПМЦ 3486913 . ПМИД 23133377 .
- ^ Галлахер, Джеймс (25 октября 2012 г.). « Ключ к лечению кишечных инфекций» — «трансплантация фекалий» . Би-би-си . Проверено 13 июня 2023 г.
- ^ Сэмпл, Ян (9 декабря 2012 г.). «Лекарственно-устойчивая инфекция C difficile обнаружена в больницах США и Канады» . Проверено 13 июня 2023 г.
- ^ «Выдающиеся исследователи в области биомедицины и здравоохранения избраны в стипендии Академии медицинских наук» . Академия медицинских наук . 18 мая 2023 г. Проверено 15 ноября 2023 г.