Неинвазивное пренатальное тестирование
Неинвазивное пренатальное тестирование | |
---|---|
Другие имена | НИПТ |
Специальность | Медицинская диагностика , акушерство и гинекология |
Неинвазивное пренатальное тестирование ( НИПТ ) – это метод, используемый для определения риска рождения плода с определенными хромосомными аномалиями , такими как трисомия 21 , трисомия 18 и трисомия 13 . [1] [2] [3] При этом тестировании анализируются небольшие фрагменты ДНК, циркулирующие в крови беременной женщины. [4] В отличие от большей части ДНК, обнаруженной в ядре клетки, эти фрагменты не находятся внутри клеток, а находятся в свободном состоянии и поэтому называются бесклеточной ДНК плода (cffDNA). Эти фрагменты обычно содержат менее 200 строительных блоков ДНК (пар оснований) и возникают, когда клетки умирают, а их содержимое, включая ДНК, высвобождается в кровоток. cffDNA происходит из плацентарных клеток и обычно идентична ДНК плода. Анализ вкДНК плаценты дает возможность раннего выявления определенных хромосомных аномалий без вреда для плода. [5]
Фон
[ редактировать ]Использование УЗИ и биохимических маркеров для выявления анеуплоидий обычно проводится в первом и/или втором триместре беременности. Однако оба этих подхода имеют высокий уровень ложноположительных результатов — 2–7%. [6] Если эти тесты указывают на повышенный риск анеуплоидии, то используются инвазивные диагностические тесты, такие как амниоцентез или биопсия ворсин хориона . Однако многие женщины чувствуют себя некомфортно при инвазивном тестировании из-за риска выкидыша, который составляет около 0,5%. [7] Неинвазивное пренатальное тестирование является промежуточным этапом между пренатальным скринингом и инвазивным диагностическим тестированием. Единственный физический риск, связанный с процедурой, — это забор крови, и риск выкидыша отсутствует. [8]
Циркулирующая вкДНК может быть обнаружена в материнской крови между 5-й и 7-й неделями гестационного возраста . [9] однако больше ДНК плода доступно для анализа обычно через 10 недель, поскольку количество ДНК плода со временем увеличивается. [10] cffDNA, РНК и интактные клетки плода можно использовать для неинвазивной оценки генетического статуса плода. Последние достижения в секвенировании ДНК, такие как массовое параллельное секвенирование (MPS) и цифровая полимеразная цепная реакция (ПЦР), в настоящее время изучаются для обнаружения хромосомных анеуплоидий с помощью НИПТ/НИПС. [11] [12] [13] [14]
С 2014 года неинвазивное тестирование выявило анеуплоидии в хромосомах 13, 16, 18, 21, 22, X и Y, в том числе синдром Дауна (вызванный трисомией 21), синдром Эдвардса (вызванный трисомией 18), синдром Патау (вызванный трисомией 13). ), а также анеуплоидии половых хромосом, такие как синдром Тернера (45, X) и синдром Клайнфельтера (47, XXY). [15] [16] [17] Эти методы секвенирования вкДНК имеют уровень чувствительности и специфичности более 99% при выявлении трисомии 21. Уровень чувствительности и специфичности ниже для других анеуплоидий, таких как трисомия 18 (97–99% и > 99% соответственно), трисомия 13 (87 –99% и >99% соответственно) и 45,Х (92–95% и 99% соответственно). Низкий уровень ложноположительных результатов (1–3%) является одним из преимуществ НИПТ, позволяющим беременным женщинам избежать инвазивных процедур. [18] В Великобритании Управление по рекламным стандартам заявило, что не следует приводить цифры «коэффициента обнаружения», если эти цифры не сопровождаются (т.е. рядом) надежным показателем «положительной прогностической ценности»; и четкие объяснения того, что означают обе цифры. [19]
НИПТ может определить отцовство и пол плода на более ранних сроках беременности, чем предыдущие тесты (включая, возможно, ультразвуковое исследование). [20] Он также используется для определения резус-D резус-фактора плода, что может предотвратить ненужное профилактическое лечение у матерей с резус-отрицательным резус-фактором. [21] [22] Наконец, он используется для обнаружения генетических мутаций , таких как дупликации или микроделеции , включая 1p, 5p, 15q, 22q, 11q, 8q и 4p. Однако чувствительность и специфичность этих тестов для большинства из них еще не подтверждены. [8]
Однако исследование Natera SMART показало, что большинство случаев делеции 22q11.2 можно обнаружить с помощью NIPT/NIPS на основе SNP (Panorama), включая более мелкие вложенные делеции, сохраняя при этом низкий уровень ложноположительных результатов. [23] Однонуклеотидный полиморфизм (SNP). НИПТ также может обнаруживать триплоидию и различать материнскую и «фетальную» ДНК, что снижает скорость перерисовки и позволяет определять пол каждого плода при беременности двойней и может быть выполнено начиная с 9 недель беременности. [24] [25]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дондорп, Выбо; де Верт, Гвидо; Бомбард, Ивонн; Бьянки, Диана В.; Бергманн, Карстен; Борри, Паскаль; Читти, Лин С.; Фельманн, Флоренция; Форцано, Франческа; Холл, Элисон; Хеннеман, Лидевий (2015). «Неинвазивное пренатальное тестирование на анеуплоидию и не только: проблемы ответственных инноваций в пренатальном скрининге» . Европейский журнал генетики человека . 23 (11): 1438–1450. дои : 10.1038/ejhg.2015.57 . ISSN 1476-5438 . ПМЦ 4613463 . ПМИД 25782669 .
- ^ Голдвазер, Тамар; Клагман, Сьюзен (2018). «Бесклеточная ДНК для выявления анеуплоидии плода» . Фертильность и бесплодие . 109 (2): 195–200. doi : 10.1016/j.fertnstert.2017.12.019 . ISSN 0015-0282 . ПМИД 29447662 .
- ^ Роуз, Нэнси С.; Каймал, Анджали Дж.; Дугофф, Лоррейн; Нортон, Мэри Э.; Медицина, Комитет по практическим бюллетеням Американского колледжа акушеров и гинекологов, Комитет по генетике, Общество матери и плода (2020). «Скрининг хромосомных аномалий плода: Практический бюллетень ACOG, номер 226» . Акушерство и гинекология . 136 (4): e48–e69. дои : 10.1097/AOG.0000000000004084 . ISSN 0029-7844 . ПМИД 32804883 .
- ^ Скшипек, Ханна; Хуэй, Лиза (01 июля 2017 г.). «Неинвазивное пренатальное тестирование на анеуплоидию плода и единичные генные нарушения» . Передовая практика и исследования в области клинического акушерства и гинекологии . 42 : 26–38. дои : 10.1016/j.bpobgyn.2017.02.007 . ISSN 1521-6934 . ПМИД 28342726 .
- ^ «Что такое неинвазивное пренатальное тестирование (НИПТ) и какие заболевания с его помощью можно выявить?: MedlinePlus Genetics» . medlineplus.gov . Проверено 27 июня 2021 г.
- ^ Шамширсаз, Алиреза А.; Бенн, Питер; Иган, Джеймс FX (1 сентября 2010 г.). «Роль скрининга сыворотки во втором триместре в эпоху скрининга после первого триместра» . Клиники лабораторной медицины . 30 (3): 667–676. дои : 10.1016/j.cll.2010.04.013 . ISSN 0272-2712 . ПМИД 20638580 .
- ↑ Амниоцентез и отбор проб ворсин хориона (Green-top Guideline No. 8) rcog.org.uk, 25 октября 2021 г., дата обращения 30 марта 2023 г.
- ^ Jump up to: а б Эллис, Меган; Майнер, Молли А.; Берсон, Элиза; Шридхар, Шилпа; Роте, Маргарет; Хунг, Энтони; Чандрасекхаран, Субхашини (16 января 2015 г.). «Неинвазивное пренатальное тестирование: обзор международного внедрения и проблем» . Международный журнал женского здоровья . 7 : 113–126. дои : 10.2147/IJWH.S67124 . ПМЦ 4303457 . ПМИД 25653560 .
- ^ Райт, Кэролайн Ф.; Бертон, Хилари (2009). «Использование бесклеточных фетальных нуклеиновых кислот в крови матери для неинвазивной пренатальной диагностики» . Обновление репродукции человека . 15 (1): 139–151. дои : 10.1093/humupd/dmn047 . ISSN 1460-2369 . ПМИД 18945714 .
- ^ Чиу, Росса В.К.; Ло, Ю. М. Деннис (1 апреля 2011 г.). «Неинвазивная пренатальная диагностика по анализу нуклеиновых кислот плода в плазме матери: достижение совершеннолетия» . Семинары по фетальной и неонатальной медицине . 16 (2): 88–93. дои : 10.1016/j.siny.2010.10.003 . ISSN 1744-165X . ПМИД 21075065 .
- ^ Сэйрс, Лорен С.; Чо, Милдред К. (2011). «Тестирование бесклеточных нуклеиновых кислот плода: обзор технологии и ее применения» . Акушерско-гинекологический осмотр . 66 (7): 431–442. дои : 10.1097/OGX.0b013e31822dfbe2 . ISSN 0029-7828 . ПМИД 21944155 . S2CID 17018886 .
- ^ Холл, А.; Бостанчи, А.; Райт, CF (2010). «Неинвазивная пренатальная диагностика с использованием технологии бесклеточной ДНК плода: применение и последствия» . Геномика общественного здравоохранения . 13 (4): 246–255. дои : 10.1159/000279626 . ISSN 1662-4246 . ПМИД 20395693 . S2CID 26020661 .
- ^ Хунг, ECW; Чиу, РВК; Ло, YMD (1 апреля 2009 г.). «Обнаружение циркулирующих нуклеиновых кислот плода: обзор методов и приложений» . Журнал клинической патологии . 62 (4): 308–313. дои : 10.1136/jcp.2007.048470 . ISSN 0021-9746 . ПМИД 19329710 . S2CID 21367768 .
- ^ Ло, YMD (2009). «Неинвазивное пренатальное выявление хромосомных анеуплоидий плода с помощью анализа нуклеиновых кислот материнской плазмы: обзор современного состояния» . BJOG: Международный журнал акушерства и гинекологии . 116 (2): 152–157. дои : 10.1111/j.1471-0528.2008.02010.x . ISSN 1471-0528 . ПМИД 19076946 . S2CID 6946087 .
- ^ Николаидес, Кипрос Х.; Сингелаки, Аргиро; Ашур, Галия; Бирдир, Кахит; Тузе, Жизель (1 ноября 2012 г.). «Неинвазивное пренатальное тестирование на трисомии плода в регулярно проверяемой популяции первого триместра» . Американский журнал акушерства и гинекологии . 207 (5): 374.e1–374.e6. дои : 10.1016/j.ajog.2012.08.033 . ISSN 0002-9378 . ПМИД 23107079 .
- ^ Циммерманн, Бернхард; Хилл, Мэтью; Гемелос, Джордж; Демко, Закари; Баневич, Милена; Банер, Йохан; Райан, Эллисон; Сигурйонссон, Стирмир; Чопра, Нихил; Додд, Майкл; Леви, Бринн (2012). «Неинвазивное пренатальное тестирование анеуплоидии хромосом 13, 18, 21, X и Y с использованием целевого секвенирования полиморфных локусов» . Пренатальная диагностика . 32 (13): 1233–1241. дои : 10.1002/pd.3993 . ISSN 1097-0223 . ПМЦ 3548605 . ПМИД 23108718 .
- ^ Паломаки, Гленн Э.; Десиу, Космин; Клоза, Эдвард М.; Ламберт-Мессерлиан, Джералин М.; Хэддоу, Джеймс Э.; Нево, Луи М.; Эрих, Матиас; ван ден Бум, Дирк; Бомбард, Аллан Т.; Гроди, Уэйн В.; Нельсон, Стэнли Ф. (2012). «Секвенирование ДНК материнской плазмы надежно идентифицирует трисомию 18 и трисомию 13, а также синдром Дауна: международное совместное исследование» . Генетика в медицине . 14 (3): 296–305. дои : 10.1038/gim.2011.73 . ISSN 1530-0366 . ПМЦ 3938175 . ПМИД 22281937 .
- ^ Диккенс, Бернард М. (2014). «Этические и правовые аспекты неинвазивной пренатальной генетической диагностики» . Международный журнал гинекологии и акушерства . 124 (2): 181–184. дои : 10.1016/j.ijgo.2013.11.001 . ISSN 1879-3479 . ПМИД 24299974 . S2CID 29627343 .
- ^ «Уведомление о правоприменении – реклама неинвазивного пренатального тестирования» .
- ^ Девани, Стефани А.; Паломаки, Гленн Э.; Скотт, Джоан А.; Бьянки, Диана В. (10 августа 2011 г.). «Неинвазивное определение пола плода с использованием бесклеточной ДНК плода: систематический обзор и метаанализ» . ДЖАМА . 306 (6): 627–636. дои : 10.1001/jama.2011.1114 . ISSN 0098-7484 . ПМК 4526182 . ПМИД 21828326 .
- ^ Гудспид, Тейлор А.; Эллис, Меган; Сэйрс, Лорен С.; Нортон, Мэри Э.; Чо, Милдред К. (1 января 2013 г.). «Трансляция технологии бесклеточной ДНК плода: структурные уроки неинвазивного RhD-типирования крови» . Тенденции в биотехнологии . 31 (1): 7–9. дои : 10.1016/j.tibtech.2012.09.001 . ISSN 0167-7799 . ПМК 6309969 . ПМИД 23040170 .
- ^ Клаузен, Фредерик Банч (2014). «Интеграция неинвазивного пренатального прогнозирования группы крови плода в клиническую дородовую помощь» . Пренатальная диагностика . 34 (5): 409–415. дои : 10.1002/pd.4326 . ISSN 1097-0223 . ПМИД 24431264 . S2CID 222098536 .
- ^ < https://www.natera.com/resource-library/publications/smart-22q-1-2022-полностью-опубликовано
- ^ Дар, П.; Якобссон, Б.; Макферсон, К.; Эгберт, М.; Мэлоун, Ф.; Вапнер, Р.Дж.; Роман, А.С.; Халил, А.; Фаро, Р.; Маданкумар, Р.; Эдвардс, Л.; Хаери, С.; Сильвер, Р.; Вогра, Н.; Хайетт, Дж.; Клюни, Г.; Демко З.; Мартин, К.; Рабиновиц, М.; Флуд, К.; Карлссон, Ю.; Дулаверис, Г.; Мэлоун, К.; Халлингстрем, М.; Клугман, С.; Клифтон, Р.; Као, К.; Хаконарсон, Х.; Нортон, Мэн (2022). «Бесклеточный скрининг ДНК на трисомии 21, 18 и 13 при беременности с низким и высоким риском анеуплоидии с генетическим подтверждением» . Американский журнал акушерства и гинекологии . 227 (2): 259.e1–259.e14. дои : 10.1016/j.ajog.2022.01.019 . ПМИД 35085538 . S2CID 246331398 .
- ^ «Обзор Панорамы V4» .