Родоторула

Родоторула
	Колонии Rhodotorula mucilaginosa на агаре Сабуро (с 2 % глюкозы)
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
Королевство:	Грибы
Разделение:	Базидиомикота
Сорт:	Микроботриомицеты
Заказ:	Споридиоболалес
Семья:	Споридиоболовые
Род:	Родоторула ; ФК Харрисон (1927)
Типовой вид
	Родоторула глютинис ; ( Мельница ) ФК Харрисон (1928)
Синонимы
	Хромоторула ФК Харрисон (1927) ; Родоспоридий И. Банно (1967) ;

Родоторула — род грибов класса Микроботриомицеты . Большинство видов известны в виде дрожжей , которые образуют колонии от оранжевого до красного цвета при выращивании на декстрозном агаре Сабуро (SDA). Цвет является результатом действия пигментов , которые дрожжи создают, чтобы блокировать определенные длины волн света (620–750 нм), которые в противном случае могли бы повредить клетку. Состояния гиф , ранее отнесенные к роду Rhodosporidium , дают начало телиоспорам , из которых выходят базидии с латеральными перегородками , образуя сидячие базидиоспоры . Виды встречаются по всему миру и могут быть изолированы из воздуха, воды, почвы и других субстратов.

Таксономия

Родоторула была создана в 1927 году канадским микробиологом Фрэнсисом К. Харрисоном для размещения дрожжей с красным пигментом (древнегреческое ῥόδον (родон) означает розовый). Последующие авторы добавили к этому роду более 150 дополнительных видов. Однако молекулярные исследования, основанные на кладистическом анализе последовательностей ДНК , показали, что Rhodotorula sensu lato является полифилетическим (смесь неродственных видов). Следовательно, большинство видов, ранее отнесенных к Rhodotorula, были перенесены в роды других отрядов, включая Agaricostilbales , Cystobasidiales , Cystofilobasidiales , Filobasidiales , Kriegeriales , Microstromatales , Tremellales , Trichosporonales и Ustilaginales . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Лишь небольшая монофилетическая группа из примерно 20 видов, относящихся к Rhodotorula типу Glutinis , остается у Rhodotorula sensu stricto . ^{[ 1 ]}

В 1967 году японский миколог Исао Банно представил род Rhodosporidium для полового состояния Rhodotorula , продуцирующего гифы и базидиоспоры . ^{[ 3 ]} После внесения изменений в Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений практика давать разные названия телеоморфным и анаморфным формам одного и того же гриба была прекращена, а это означает, что Rhodosporidium стал синонимом более раннего названия Rhodotorula . ^{[ 1 ]}

среда обитания

Виды Rhodotorula — обычные обитатели окружающей среды. Их можно культивировать из почвы, воды, молока, фруктовых соков и образцов воздуха. ^{[ 4 ]} Они способны замечательно поглощать азотистые соединения из окружающей среды, растя даже в воздухе, тщательно очищенном от любых фиксированных азотных примесей. В таких условиях содержание азота в сухом весе видов Rhodotorula может упасть до 1% по сравнению с примерно 14% для большинства бактерий, растущих в нормальных условиях. ^{[ 5 ]}

Патология

что только Rhodotorula mucilaginosa и R. Glutinis Известно, вызывают заболевания у людей. До 1985 года не было зарегистрировано случаев заражения Rhodotorula . ^{[ 4 ]} Однако в период с 1960 по 2000 год было зарегистрировано сорок три случая инфекций кровотока Rhodotorula (BSI). ^{[ 6 ]} Виды Rhodotorula чаще всего встречаются у пациентов с иммуносупрессией и/или при использовании технологий инородного тела, таких как центральные венозные катетеры. ^{[ 6 ]} Инфекцию Rhodotorula обычно лечат путем удаления катетера и применения противогрибковых препаратов. Виды Rhodotorula чувствительны к амфотерицину B и флуцитозину . ^{[ 6 ]}

Виды Rhodotorula также могут вызывать инфекции у животных. Сообщалось о кожных инфекциях у кур и морских животных, а также инфекциях легких и отитах у овец и крупного рогатого скота. ^{[ 4 ]}

Потенциал биоремедиации

Одной из областей, в которой виды Rhodotorula могут стать важными, является биоремедиация , особенно загрязненных водных объектов. Как и в случае с бактериями, грибы могут естественным образом развивать модифицированный метаболизм для борьбы с загрязнителями окружающей среды, а затем могут быть использованы в биоремедиации. Одной из основных мишеней часто являются полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), поскольку они часто сохраняются в окружающей среде и обладают высоким уровнем токсичности. В результате анализа отложений и тестирования загрязненных вод было обнаружено, что виды Rhodotorula распространены на загрязненных участках. ^{[ 7 ]} В пробах загрязненных вод было отмечено, что виды Rhodotorula обладают способностью разлагать соединения нефти. ^{[ 8 ]} Эти и другие исследования показывают, что виды Rhodotorula могут быть хорошими кандидатами для биоремедиации загрязненных вод ПАУ. В ходе более целенаправленных исследований было обнаружено, что ряд видов Rhodotorula способны разлагать ряд специфических загрязнителей. Например, R. Glutinis и R. Rubra (= R. mucilaginosa было обнаружено, что ) обладают высокой способностью разлагать фенантрен . ^{[ 9 ]} В смешанном грибковом сообществе виды Rhodotorula способствовали эффективной деградации низкомолекулярных ПАУ, и хотя бактериальные сообщества сами по себе были не в состоянии этого сделать, грибковые сообщества также деградировали высокомолекулярные ПАУ (более 3 бензольных колец ), такие как хризен и бензо(а). )пирен . ^{[ 10 ]} штамм R. taiwanensis Показано, что растет при постоянном гамма-излучении 66 Гр/ч при pH 2,3 и в присутствии высоких концентраций соединений ртути и хрома, а также образует биопленки в условиях высокого уровня хронической радиации и низкого pH, что делает его перспективный кандидат для биоремедиации полигонов кислых радиоактивных отходов. ^{[ 11 ]}

Разновидность

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ван Ц, Юрков А.М., Гёкер М., Лумбш Х.Т., Ливитт С.Д., Гроневальд М., Тилен Б., Лю Икс, Бёкхаут Т., Бай Ф (2016). «Филогенетическая классификация дрожжей и родственных таксонов Pucciniomycotina» . Исследования по микологии . 81 : 149–189. дои : 10.1016/j.simyco.2015.12.002 . ПМЦ 4777780 . ПМИД 26951631 .
^ Ли А, Юань Ф, Грюневальд М, Бенш К, Юрков А.М., Ли К, Хан П, Го Л, Эйме MC, Сампайо Дж. П., Джиндаморакот С., Турчетти Б, Инасио Дж., Фунгсин Б., Ван Ц, Бай Ф (2020) . «Разнообразие и филогения базидиомицетов из листьев растений и почвы: предложение двух новых порядков, трех новых семейств, восьми новых родов и ста семи новых видов» . Исследования по микологии . 96 : 17–140. doi : 10.1016/j.simyco.2020.01.002 . ПМК 7082220 . ПМИД 32206137 .
^ Банно I (1967). «Исследования сексуальности родоторулы » . J. Gen. Appl. Микробиол . 13 : 167–196.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Вирт Ф., Голдани Л.З. (сентябрь 2012 г.). «Эпидемиология родоторулы: новый патоген» . Междисциплинарные перспективы инфекционных заболеваний . 2012 : 465717. doi : 10.1155/2012/465717 . ПМК 3469092 . ПМИД 23091485 .
^ Постгейт, Джон: «Внешние пределы жизни», стр. 132-134. Издательство Кембриджского университета, 1994 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Заас А.К., Бойс М., Шелл В., Лодж Б.А., Миллер Дж.Л., Перфект Дж.Р. (ноябрь 2003 г.). «Риск грибка, вызванного Rhodotorula, и тестирование изолятов Rhodotorula на противогрибковую чувствительность » . Журнал клинической микробиологии . 41 (11): 5233–5. doi : 10.1128/jcm.41.11.5233-5235.2003 . ПМК 262498 . ПМИД 14605170 .
^ Чжан Х, Хуан Т, Чен С (февраль 2015 г.). «Игнорируемые популяции донных грибов в водоемах выявляются методами количественной ПЦР и пиросеквенирования 454» . БМК Микробиология . 15:44 . дои : 10.1186/s12866-015-0379-7 . ПМЦ 4349462 . ПМИД 25886005 .
^ Богуславска-Вас Э, Домбровский В (июль 2001 г.). «Сезонная изменчивость дрожжей и дрожжеподобных организмов в воде и донных отложениях Щецинского залива». Международный журнал гигиены и гигиены окружающей среды . 203 (5–6): 451–8. дои : 10.1078/1438-4639-00056 . ПМИД 11556149 .
^ МакГилливрей А.Р., член парламента от Шиариса (май 1993 г.). «Биотрансформация полициклических ароматических углеводородов дрожжами, выделенными из прибрежных отложений» . Прикладная и экологическая микробиология . 59 (5): 1613–8. Бибкод : 1993ApEnM..59.1613M . дои : 10.1128/АЕМ.59.5.1613-1618.1993 . ПМК 182127 . ПМИД 8517753 .
^ Хешам А., Хан С., Тао Ю., Ли Д., Чжан Ю., Ян М. (сентябрь 2012 г.). «Биодеградация высокомолекулярных ПАУ с использованием изолированных дрожжевых смесей: применение метагеномных методов для анализа структуры сообщества». Международное исследование наук об окружающей среде и загрязнении окружающей среды . 19 (8): 3568–78. дои : 10.1007/s11356-012-0919-8 . ПМИД 22535224 . S2CID 8263841 .
^ Ткавц Р., Матросова В.Ю., Гриченко О.Е., Гостинчар С., Вольпе Р.П., Клименкова П., Гайдамакова Е.К., Чжоу К.Э., Стюарт Б.Дж., Лайман М.Г., Малфатти С.А., Рубинфельд Б., Курто М., Сингх Дж., Далгард К.Л., Гамильтон Т., Фрей К.Г. , Гунде-Цимерман Н., Дуган Л., Дейли М.Дж. (2017). «Rhodotorula taiwanensis MD1149» . Границы микробиологии . 8 : 2528. дои : 10.3389/fmicb.2017.02528 . ПМК 5766836 . ПМИД 29375494 .

Внешние ссылки

Родоторула на сайте Dr. Fungus

[Wang2016-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ван Ц, Юрков А.М., Гёкер М., Лумбш Х.Т., Ливитт С.Д., Гроневальд М., Тилен Б., Лю Икс, Бёкхаут Т., Бай Ф (2016). «Филогенетическая классификация дрожжей и родственных таксонов Pucciniomycotina» . Исследования по микологии . 81 : 149–189. дои : 10.1016/j.simyco.2015.12.002 . ПМЦ 4777780 . ПМИД 26951631 .

[li2020-2] Ли А, Юань Ф, Грюневальд М, Бенш К, Юрков А.М., Ли К, Хан П, Го Л, Эйме MC, Сампайо Дж. П., Джиндаморакот С., Турчетти Б, Инасио Дж., Фунгсин Б., Ван Ц, Бай Ф (2020) . «Разнообразие и филогения базидиомицетов из листьев растений и почвы: предложение двух новых порядков, трех новых семейств, восьми новых родов и ста семи новых видов» . Исследования по микологии . 96 : 17–140. doi : 10.1016/j.simyco.2020.01.002 . ПМК 7082220 . ПМИД 32206137 .

[3] Банно I (1967). «Исследования сексуальности родоторулы » . J. Gen. Appl. Микробиол . 13 : 167–196.

[Wirth12-4] Перейти обратно: ^а ^б ^с Вирт Ф., Голдани Л.З. (сентябрь 2012 г.). «Эпидемиология родоторулы: новый патоген» . Междисциплинарные перспективы инфекционных заболеваний . 2012 : 465717. doi : 10.1155/2012/465717 . ПМК 3469092 . ПМИД 23091485 .

[5] Постгейт, Джон: «Внешние пределы жизни», стр. 132-134. Издательство Кембриджского университета, 1994 г.

[Zaas03-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Заас А.К., Бойс М., Шелл В., Лодж Б.А., Миллер Дж.Л., Перфект Дж.Р. (ноябрь 2003 г.). «Риск грибка, вызванного Rhodotorula, и тестирование изолятов Rhodotorula на противогрибковую чувствительность » . Журнал клинической микробиологии . 41 (11): 5233–5. doi : 10.1128/jcm.41.11.5233-5235.2003 . ПМК 262498 . ПМИД 14605170 .

[7] Чжан Х, Хуан Т, Чен С (февраль 2015 г.). «Игнорируемые популяции донных грибов в водоемах выявляются методами количественной ПЦР и пиросеквенирования 454» . БМК Микробиология . 15:44 . дои : 10.1186/s12866-015-0379-7 . ПМЦ 4349462 . ПМИД 25886005 .

[8] Богуславска-Вас Э, Домбровский В (июль 2001 г.). «Сезонная изменчивость дрожжей и дрожжеподобных организмов в воде и донных отложениях Щецинского залива». Международный журнал гигиены и гигиены окружающей среды . 203 (5–6): 451–8. дои : 10.1078/1438-4639-00056 . ПМИД 11556149 .

[MacGillivray93-9] МакГилливрей А.Р., член парламента от Шиариса (май 1993 г.). «Биотрансформация полициклических ароматических углеводородов дрожжами, выделенными из прибрежных отложений» . Прикладная и экологическая микробиология . 59 (5): 1613–8. Бибкод : 1993ApEnM..59.1613M . дои : 10.1128/АЕМ.59.5.1613-1618.1993 . ПМК 182127 . ПМИД 8517753 .

[10] Хешам А., Хан С., Тао Ю., Ли Д., Чжан Ю., Ян М. (сентябрь 2012 г.). «Биодеградация высокомолекулярных ПАУ с использованием изолированных дрожжевых смесей: применение метагеномных методов для анализа структуры сообщества». Международное исследование наук об окружающей среде и загрязнении окружающей среды . 19 (8): 3568–78. дои : 10.1007/s11356-012-0919-8 . ПМИД 22535224 . S2CID 8263841 .

[11] Ткавц Р., Матросова В.Ю., Гриченко О.Е., Гостинчар С., Вольпе Р.П., Клименкова П., Гайдамакова Е.К., Чжоу К.Э., Стюарт Б.Дж., Лайман М.Г., Малфатти С.А., Рубинфельд Б., Курто М., Сингх Дж., Далгард К.Л., Гамильтон Т., Фрей К.Г. , Гунде-Цимерман Н., Дуган Л., Дейли М.Дж. (2017). «Rhodotorula taiwanensis MD1149» . Границы микробиологии . 8 : 2528. дои : 10.3389/fmicb.2017.02528 . ПМК 5766836 . ПМИД 29375494 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]