Jump to content

Cyb5r3

Cyb5r3
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы CYB5R3 , B5R, DIA1, Cytochrome B5 Reductase 3
Внешние идентификаторы Омим : 613213 ; MGI : 94893 ; GeneCards : Cyb5r3 ; OMA : CYB5R3 - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_007326
NM_000398
NM_001129819
NM_001171660
NM_001171661

NM_029787

Refseq (белок)

NP_000389
NP_001123291
NP_001165131
NP_001165132
NP_015565

NP_084063

Расположение (UCSC) Chr 22: 42,62 - 42,72 МБ Chr 15: 83,04 - 83,06 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

NADH-Cytochrome B5 Reductase 3 -это фермент , который у людей кодируется CyB5R3 геном . [ 5 ] [ 6 ]

Структура

[ редактировать ]

Ген cyb5r3 расположен на 22 -й хромосоме, причем его специфическое место - 22q13.2. Ген содержит 12 экзонов . [ 7 ] CyB5R3 кодирует белок 34,2 кДа, который состоит из 301 аминокислот; 63 пептидов наблюдались с помощью данных масс -спектрометрии . [ 8 ] [ 9 ]

Весь ген длиной около 31 кб. Экзон 2 содержит соединение мембранного связывающего домена и каталитического домена B5R, который показывает, что существует две формы B5R: растворимая форма и мембрана, связанная с мембраной. 5 -'часть этого гена не имеет типичных регуляторных транскрипционных элементов, но в общей сложности последовательность GGGCGG в общей сложности. Содержание GC в этой 5 -футовой части гена составляет 86%, что намного выше, чем в среднем GC всего гена, который составляет 55%. Существует также атипичный сигнал полиаденилирования в 3'-Untransled Green гена. [ 5 ]

Белок, кодируемый геном CyB5R3, представляет собой цитохром B5 -редуктазу, флавопротеин , который продуцируется в виде двух разных изоформ с различными локализациями. Существует амфипатическая микросомальная изоформа, которая обнаружена во всех типах клеток, но эритроциты; Эта изоформа имеет один гидрофобный домен, а лежащий в анке, и один каталитический домен, который является гидрофильным . Другая изоформа, растворимая изоформа цитохрома B5 -редуктазы, обнаруживается в эритроцитах человека. Этот белок усечен и кодируется альтернативной транскрипцией, которая производит только больший гидрофильный домен. [ 10 ] Белок содержит 4 остатка цистеина, Cys -203, -273, -283 и -297. Считается, что Cys-283 участвует в связывании NADH путем химической модификации; Фактически, как Cys-273, так и Cys-283, как полагают, близки к сайту связывания NADH. [ 11 ] NH val 2- терминальная структура мембрансвязывающего домена составляет CH3 (CH2) 12-Co-Gly-Ala-Gln-Leu-Ser-sthr-leu-his-met-val-leu-phe-pro- -TRP-PHE-LEU-TYR-SER-LEU-LEU-MET-LYS. [ 12 ]

Две формы NADH-цитохрома B5-редуктазы известны, мембраносвязанная форма в соматических клетках (закрепленная в эндоплазматической ретикулуме , митохондриях и других мембранах) и растворимая форма в эритроцитах . Мембраносвязанная форма имеет как мембраносвязывающие, так и каталитические домены. Растворимая форма имеет только каталитический домен. Этот ген кодирует обе формы фермента, которые возникают из тканевых альтернативных транскриптов, которые различаются в первом экзоне. Мутации в этом гене вызывают метгемоглобинемии. [ 7 ]

Цитохром B5 -редуктаза участвует в передаче снижения эквивалентов от донора физиологического электрона NADH, через домен FAD к мелким молекулам цитохрома B5. Это также активно участвует во многих реакциях окисления и восстановления, таких как восстановление метгемоглобина до гемоглобина. [ 10 ] Из двух форм NADH-цитохрома B5-редуктазы, мембранная форма существует в основном на цитоплазматической стороне эндоплазматического ретикулума и функционирует в десатурации и удлинении жирных кислот , в биосинтезе холестерина и в метаболизме лекарств. Форма эритроцитов расположена в растворимой фракции циркулирующих эритроцитов и участвует в восстановлении метгемоглобина . [ 7 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Мутации в гене CyB5R3 вызывают метгемоглобинемию I и II. Это редкое аутосомно-рецессивное заболевание из-за дефицита изоформы NADH-цитохрома B5-редуктазы. [ 13 ] Было описано много мутаций этого гена и последующего проявления заболевания. [ 14 ] Болезнь проявляется как накопление окисленного Fe+3 у людей. [ 10 ] Рецессивный врожденный метемоглобинемия типа I (RCM) характеризуется дефицитом растворимой изоформы и манифестами в качестве цианоза кожи и слизистых оболочек. [ 15 ] В типе II дефект влияет на обе изоформы и, таким образом, влияет на более общие ткани, такие как эритроциты, лейкоциты и все ткани тела. Этот тип связан с умственным дефицитом и другими неврологическими симптомами, которые могут быть связаны с тем, что система цитохрома B5 играет решающую роль в десатурации жирных кислот в организме. [ 16 ] Недавно сообщалось, что аномальный липидный метаболизм, связанный с десатурацией жирных кислот, вероятно, является вторичным фенотипом, а не прямой причиной заболевания. Авторы описывают новое понимание этиологии неврологических расстройств, вызванных дефицитом CYB5R3D. [ 17 ] Один пациент был описан как новый класс этого расстройства, тип III. Это условие характеризовалось дефицитом цитохрома B5 -редуктазы в лимфоцитах, тромбоцитах и ​​эритроцитах, но это не было связано с умственной замедлением. [ 18 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Известно, что CyB5R3 взаимодействует с CyB5A , ENO1 и SUMO2 среди других белков. [ 7 ]

  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100243 - ENSEMBL , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000018042 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Jump up to: а беременный Tomatsu S, Kobayashi Y, Fukumaki Y, Yubisui T, Orii T, Sakaki Y (август 1989 г.). «Организация и полная нуклеотидная последовательность человеческого гена NADH-цитохрома B5 редуктазы». Ген . 80 (2): 353–61. doi : 10.1016/0378-1119 (89) 90299-0 . PMID   2479590 .
  6. ^ Bull PC, Shephard EA, Povey S, Santisteban I, Phillips IR (октябрь 1988). «Клонирование и хромосомное картирование цитохрома B5 -редуктазы (DIA1) человека (DIA1)». Анналы человеческой генетики . 52 (Pt 4): 263–8. doi : 10.1111/j.1469-1809.1988.tb01105.x . PMID   3268037 . S2CID   33190583 .
  7. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый «Ген Entrez: Cyb5r3 Cytochrome B5 Reductase 3» .
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, J, J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg. , Duan H, Ulen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC   4076475 . PMID   23965338 .
  9. ^ «Надх-цитохром B5 Редактаза 3» . Сердечный органеллерный белок Атлас База знаний (copakb) . [ Постоянная мертвая ссылка ]
  10. ^ Jump up to: а беременный в Elahian F, Sepehrizadeh Z, Moghimi B, Mirzaei SA (Jun 2014). «Человеческий цитохром B5 Редактаза: структура, функция и потенциальные приложения». Критические обзоры в биотехнологии . 34 (2): 134–43. doi : 10.3109/073885551.2012.732031 . PMID   23113554 . S2CID   207467769 .
  11. ^ Ширабе К, Юбисуи Т., Нишино Т., Такешита М (апрель 1991). «Роль остатков цистеина в человеческом NADH-цитохроме B5-редуктазы, изученной с помощью сайт-направленного мутагенеза. Cys-273 и Cys-283 расположены близко к сайту связывания NADH, но не являются каталитически важными» . Журнал биологической химии . 266 (12): 7531–6. doi : 10.1016/s0021-9258 (20) 89479-4 . PMID   2019583 .
  12. ^ Мураками К., Юбисуи Т., Такешита М., Мията Т (февраль 1989 г.). «NH2-концевые структуры микросомальных микросомальных NADH-цитохрома B5 человека и крысы». Журнал биохимии . 105 (2): 312–7. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122659 . PMID   2498303 .
  13. ^ Галива Н.М., Ненашева С.А., Клегмена И.С., Полиаков А.В. (ноябрь 2012 г.). «[Новая большая делеция C.22-1320_633+1224DEL в гене CyB5R3 от пациентов с наследственной метеемоглобинемией]». Genetika . 48 (11): 1336–46. PMID   23297489 .
  14. ^ Фермо Э., Бьянчи П., Верцеллати С., Марчелло А.П., Гаратти М., Марангони О., Барселлни В., Занелла А. (2008). «Результативная здесь расстояния метеемоглобинемия: две новые мутации в гене NADH-цитохрома B5 Reductas» Клетки крови, молекулы и заболевания 41 (1): 50–5 Doi : 10.1016/ j.bcmd.2008.02.02.0  18343696PMID
  15. ^ Galeeva NM, Voevoda MI, Spiridonova MG, Stepeanov VA, Poliakov AV (апрель 2013 г.). «[Частота популяции и возраст мутации C.806C> T в гене CyB5R3 в качестве причины рецессивного врожденного метемоглобинемии в якутии]». Genetika . 49 (4): 523–30. doi : 10.7868/s0016675813030065 . PMID   23866629 .
  16. ^ MP Hudspeth, Джозеф С., Холден К.Р. (январь 2010 г.). «Новая мутация в метеемоглобинемии типа II». Журнал детской неврологии . 25 (1): 91–3. doi : 10.1177/0883073809336136 . PMID   19471045 . S2CID   5230624 .
  17. ^ Siendones E, Ballesteros M, Navas P (октябрь 2018). «Клеточные и молекулярные механизмы рецессивного наследственного метеемоглобинемии типа II» . Журнал клинической медицины . 7 (341): 341. doi : 10.3390/jcm7100341 . PMC   6210646 . PMID   30309019 .
  18. ^ Нагай Т., Ширабе К, Юбисуи Т., Такешита М (февраль 1993 г.). «Анализ мутанта NADH-цитохрома B5 Рредуктазы: очевидный« тип III »« Меемоглобинемия может быть объяснена как тип I с нестабильной редуктазой » . Кровь . 81 (3): 808–14. doi : 10.1182/blood.v81.3.808.808 . PMID   8427971 .
[ редактировать ]

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 8a071a090bb4989a37f1d7e06a67074f__1721226540
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/8a/4f/8a071a090bb4989a37f1d7e06a67074f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
CYB5R3 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)