СИВН1

СИВН1
Идентификаторы
Псевдонимы	SYVN1 , DER3, HRD1, синовиолин 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 608046 ; МГИ : 1921376 ; Гомологен : 32700 ; Генные карты : SYVN1 ; OMA : SYVN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	65,134,532 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	6,103,742 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; body of pancreas; ; right lobe of liver; ; bone marrow cells; ; appendix; ; stromal cell of endometrium; ; islet of Langerhans; ; right lobe of thyroid gland; ; lymph node; ; left lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; lacrimal gland; ; salivary gland; ; decidua; ; left lobe of liver; ; islet of Langerhans; ; molar; ; spleen; ; seminal vesicula; ; renal corpuscle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	chaperone binding; unfolded protein binding; ATPase binding; metal ion binding; protein binding; ubiquitin-specific protease binding; ubiquitin protein ligase activity; transferase activity;
Cellular component	integral component of membrane; endoplasmic reticulum membrane; nucleoplasm; smooth endoplasmic reticulum; integral component of endoplasmic reticulum membrane; endoplasmic reticulum quality control compartment; Derlin-1 retrotranslocation complex; Hrd1p ubiquitin ligase complex; Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex; membrane; endoplasmic reticulum;
Biological process	protein stabilization; protein K48-linked ubiquitination; retrograde protein transport, ER to cytosol; IRE1-mediated unfolded protein response; negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; protein N-linked glycosylation via asparagine; endoplasmic reticulum mannose trimming; ERAD pathway; endoplasmic reticulum unfolded protein response; ubiquitin-dependent ERAD pathway; protein ubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84447
	74126
	ENSG00000162298
	ENSMUSG00000024807
	Q86TM6
	Q9DBY1
	НМ_032431 ; НМ_172230
	НМ_001164709 ; НМ_028769
	НП_115807 ; НП_757385
	НП_001158181 ; НП_083045
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Е3 убиквитин-протеинлигаза синовиолин представляет собой фермент , который у человека кодируется SYVN1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок, участвующий в деградации, связанной с эндоплазматическим ретикулумом (ER). Кодируемый белок удаляет развернутые белки, накопленные во время стресса ER , путем ретроградного транспорта в цитозоль из ER. Этот белок также использует систему убиквитин-протеасома для дополнительной деградации развернутых белков. Этот ген и ген митохондриального рибосомального белка L49 используют в своих соответствующих 3'-UTR часть одной и той же геномной последовательности. Анализ последовательностей выявил два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162298 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024807 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Амано Т , Ямасаки С , Ягишита Н , Цучимоти К , Шин Х , Кавахара К , Аратани С , Фудзита Х , Чжан Л , Икеда Р , Фуджи Р , Миура Н , Комия С , Нисиока К , Маруяма И , Фукамидзу А , Накадзима Т (октябрь 2003 г.). «Синовиолин/Hrd1, убиквитинлигаза Е3, как новый патогенный фактор артропатии» . Гены и развитие . 17 (19): 2436–49. дои : 10.1101/gad.1096603 . ПМК 218080 . ПМИД 12975321 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ингибитор синовиального апоптоза SYVN1 1, синовиолин» .

Дальнейшее чтение

Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Отчеты ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О. (апрель 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 8 (2): 85–95. дои : 10.1093/dnares/8.2.85 . ПМИД 11347906 .
Канеко М., Исигуро М., Ниинума Ю., Уэсуги М., Номура Ю. (декабрь 2002 г.). «Человеческий HRD1 защищает от апоптоза, вызванного стрессом ER, посредством деградации, связанной с ER» . Письма ФЭБС . 532 (1–2): 147–52. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03660-8 . ПМИД 12459480 . S2CID 44570384 .
Надав Э., Шмуэли А., Барр Х., Гонен Х., Чехановер А., Рейсс Ю. (март 2003 г.). «Новая убиквитинлигаза эндоплазматического ретикулума млекопитающих, гомологичная дрожжевому Hrd1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 303 (1): 91–7. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00279-1 . ПМИД 12646171 .
Киккерт М., Дулман Р., Дай М., Авнер Р., Хасинк Г., ван Вурден С., Танедар С., Ройтельман Дж., Чау В., Вирц Е. (январь 2004 г.). «Человеческий HRD1 представляет собой убиквитинлигазу Е3, участвующую в деградации белков эндоплазматической сети» . Журнал биологической химии . 279 (5): 3525–34. дои : 10.1074/jbc.M307453200 . ПМИД 14593114 .
Лилли Б.Н., Плух Х.Л. (октябрь 2005 г.). «Мультипротеиновые комплексы, которые связывают дислокацию, убиквитинирование и извлечение неправильно свернутых белков из мембраны эндоплазматического ретикулума» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (40): 14296–301. Бибкод : 2005PNAS..10214296L . дои : 10.1073/pnas.0505014102 . ПМЦ 1242303 . ПМИД 16186509 .
Йе Й, Шибата Й, Киккерт М, ван Ворден С, Вирц Э, Рапопорт Т.А. (октябрь 2005 г.). «Привлечение АТФазы p97 и убиквитинлигазы к месту ретротранслокации на мембране эндоплазматического ретикулума» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (40): 14132–8. Бибкод : 2005PNAS..10214132Y . дои : 10.1073/pnas.0505006102 . ПМЦ 1242302 . ПМИД 16186510 .
Шульце А., Стандера С., Бюргер Э., Киккерт М., ван Вурден С., Вирц Е., Конинг Ф., Клёцель П.М., Сигер М. (декабрь 2005 г.). «Белок HERP с убиквитиновым доменом образует комплекс с компонентами пути деградации, связанного с эндоплазматическим ретикулумом». Журнал молекулярной биологии . 354 (5): 1021–7. дои : 10.1016/j.jmb.2005.10.020 . ПМИД 16289116 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Ямасаки С., Ягишита Н., Цучимоти К., Като Ю., Сасаки Т., Амано Т., Беппу М., Аоки Х., Накамура Х., Нисиока К., Накадзима Т. (июль 2006 г.). «Устойчивость к стрессу эндоплазматической сети является приобретенным клеточным свойством ревматоидных синовиальных клеток» . Международный журнал молекулярной медицины . 18 (1): 113–7. дои : 10.3892/ijmm.18.1.113 . ПМИД 16786162 .
Тох М.Л., Маротт Х., Блонд Дж.Л., Джумка У., Эльджаафари А., Мужен Б., Миоссек П. (июль 2006 г.). «Сверхэкспрессия синовиолина в периферической крови и синовиоцитах у пациентов с ревматоидным артритом и продолжающееся повышение у лиц, не ответивших на лечение инфликсимабом» . Артрит и ревматизм . 54 (7): 2109–18. дои : 10.1002/арт.21926 . ПМИД 16802346 .
Артеага М.Ф., Ван Л., Равид Т., Хохштрассер М., Канесса К.М. (июль 2006 г.). «Амфипатическая спираль воздействует на сывороточную и глюкокортикоид-индуцированную киназу 1 на аппарат конъюгации убиквитина, связанный с эндоплазматическим ретикулумом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (30): 11178–83. Бибкод : 2006PNAS..10311178A . дои : 10.1073/pnas.0604816103 . ПМК 1544061 . ПМИД 16847254 .
Омура Т., Канеко М., Окума Ю., Орба Ю., Нагашима К., Такахаши Р., Фудзитани Н., Мацумура С., Хата А., Кубота К., Мурахаши К., Уэхара Т., Номура Ю. (декабрь 2006 г.). «Убиквитинлигаза HRD1 способствует деградации рецептора Pael, субстрата Паркина». Журнал нейрохимии . 99 (6): 1456–69. дои : 10.1111/j.1471-4159.2006.04155.x . hdl : 2115/17141 . ПМИД 17059562 . S2CID 6256027 .
Ян Х, Чжун X, Баллар П, Луо С, Шен Ю, Рубинштейн, округ Колумбия, Монтейро М.Дж., Фанг С. (февраль 2007 г.). «Убиквитинлигаза Hrd1 усиливает деградацию и подавляет токсичность хантингтина, расширенного полиглутамином». Экспериментальные исследования клеток . 313 (3): 538–50. дои : 10.1016/j.yexcr.2006.10.031 . ПМИД 17141218 .
Ямасаки С , Ягишита Н , Сасаки Т , Накадзава М , Като Ю , Ямадера Т , Бэ Э , Торияма С , Икеда Р , Чжан Л , Фудзитани К , Ю Е , Цучимочи К , Ота Т , Арайя Н , Фудзита Х , Аратани С , Эгучи К , Комия С , Маруяма И , Хигаси Н , Сато М , Сену Х , Очи Т , Ёкояма С., Амано Т., Ким Дж., Гей С., Фукамидзу А., Нисиока К., Танака К., Накадзима Т. (январь 2007 г.). «Цитоплазматическое разрушение р53 резидентной эндоплазматической сети убиквитинлигазой «Синовиолин» » . Журнал ЭМБО . 26 (1): 113–22. дои : 10.1038/sj.emboj.7601490 . ПМЦ 1782373 . ПМИД 17170702 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q86TM6 (убиквитин-белковая лигаза E3 синовиолин) на PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162298 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024807 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12975321-5] Амано Т , Ямасаки С , Ягишита Н , Цучимоти К , Шин Х , Кавахара К , Аратани С , Фудзита Х , Чжан Л , Икеда Р , Фуджи Р , Миура Н , Комия С , Нисиока К , Маруяма И , Фукамидзу А , Накадзима Т (октябрь 2003 г.). «Синовиолин/Hrd1, убиквитинлигаза Е3, как новый патогенный фактор артропатии» . Гены и развитие . 17 (19): 2436–49. дои : 10.1101/gad.1096603 . ПМК 218080 . ПМИД 12975321 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ингибитор синовиального апоптоза SYVN1 1, синовиолин» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]