H2AFJ

H2AJ
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 4EDU
Идентификаторы
Псевдонимы	H2AJ , H2AFJ, H2A.J Histone, H2A Histone Family Memb j j
Внешние идентификаторы	MGI : 3606192 ; Гомологен : 128575 ; GeneCards : H2AJ ; OMA : H2AJ - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 12 (human) Band 12p12.3 Start 14,774,405 bp End 14,778,002 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 6 (mouse) Band 6|6 G1 Start 136,785,242 bp End 136,787,072 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left testis right testis olfactory zone of nasal mucosa mucosa of transverse colon tibial arteries left coronary artery thoracic aorta right coronary artery ascending aorta Descending thoracic aorta Top expressed in Paneth cell internal carotid artery external carotid artery lacrimal gland crypt of lieberkuhn of small intestine fossa condyle blood hair follicle submandibular gland More reference expression data BioGPS n/a
showДжин Онтология Molecular function protein heterodimerization activity DNA binding molecular function Cellular component extracellular exosome chromosome nucleosome nucleus Biological process chromatin organization biological process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 55766 232440 Набор ENSG00000246705 EMSMUSM00000060032 Uniprot Q9BTM1 Q8R1M2 Refseq (мРНК) NM_018267 NM_177925 NM_177688 Refseq (белок) NP_808760 NP_808356 Расположение (UCSC) Chr 12: 14,77 - 14,78 МБ Chr 6: 136,79 - 136,79 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Гистон H2A.J - это белок , который у людей кодируется H2AFJ геном .

Гистоны - это основные ядерные белки, которые ответственны за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Нуклеосомы состоят из приблизительно 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг гистонового октамера, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Хроматиновое волокно дополнительно уплотняется посредством взаимодействия гистона линкера H1, с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка. Этот ген расположен на хромосоме 12 и кодирует вариант гистона H2A. Белок расходится на С-конце по сравнению с членом семейства гистонов консенсуса H2A.

Дальнейшее чтение

• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геном Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC   1356129 . PMID   16344560 .
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID   14702039 .
• Лусич М., Марчелло А., Церето А., Джакка М. (2004). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования фактора на промоторе LTR» . Embo j . 22 (24): 6550–61. doi : 10.1093/emboj/cdg631 . PMC   291826 . PMID   14657027 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC   139241 . PMID   12477932 .
• Deng L, Wang D, De La Fuente C, et al. (2001). «Улучшение активности HAT P300 с помощью ВИЧ-1 ТАТ на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID   11689053 .
• Чадвик Б.П., Уиллард Х.Ф. (2001). «Варианты гистона H2A и неактивная X -хромосома: идентификация второго варианта Macroh2a» . Гул Мол Генет . 10 (10): 1101–13. doi : 10.1093/hmg/10.10.1101 . PMID   11331621 .
• Deng L, De La Fuente C, Fu P, et al. (2001). «Ацетилирование ВИЧ-1 ТАТ с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID   11080476 .
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного хроматина, ассоциированного с вирусом иммунодефицита человека, промотора типа 1 типа» . Мол Клетка. Биол . 18 (5): 2535–44. doi : 10.1128/mcb.18.5.2535 . PMC   110633 . PMID   9566873 .