Setd7

Setd7
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 1H3I, 1MT6, 1MUF, 1N6A, 1N6C, 1O9S, 1XQH, 2F69, 3CBM, 3CBO, 3CBP, 3M53, 3M54, 3M55, 3M56, 3M57, 3M58, 3M59, 3M5A, 3OS5, 3VUZ, 3VV0, 4E47, 4J7F, 4J8O, 4JDS, 4JLG, 5EG2, 5AYF
Идентификаторы
Псевдонимы	SetD7 , kmt7, set7, set7/9, set9, set домен, содержащий лизинтитилтрансферазу 7, SET домен, содержащий 7, гистон -лизинметилтрансфераза
Внешние идентификаторы	Омим : 606594 ; MGI : 1920501 ; Гомологен : 12741 ; GeneCards : setd7 ; OMA SETD7 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 4 (human) Band 4q31.1 Start 139,495,941 bp End 139,606,699 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 3 (mouse) Band 3|3 C Start 51,422,740 bp End 51,468,300 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in tibialis anterior muscle deltoid muscle cardiac muscle tissue of right atrium myocardium of left ventricle skin of arm quadriceps femoris muscle Skeletal muscle tissue of rectus abdominis biceps brachii vastus lateralis muscle Skeletal muscle tissue of biceps brachii Top expressed in triceps brachii muscle temporal muscle sternocleidomastoid muscle ciliary body digastric muscle lobe of cerebellum cerebellar vermis ankle lateral geniculate nucleus epithelium of lens More reference expression data BioGPS More reference expression data
showДжин Онтология Molecular function methyltransferase activity transferase activity p53 binding chromatin binding protein-lysine N-methyltransferase activity protein binding histone-lysine N-methyltransferase activity Cellular component nucleoplasm chromosome nucleolus nucleus Biological process regulation of transcription, DNA-templated peptidyl-lysine monomethylation transcription, DNA-templated cellular response to DNA damage stimulus positive regulation of transcription, DNA-templated peptidyl-lysine methylation methylation heterochromatin organization peptidyl-lysine dimethylation histone lysine methylation response to ethanol regulation of histone H3-K9 methylation chromatin organization Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 80854 73251 Набор ENSG00000145391 Ensmusg00000037111 Uniprot Q8WTS6 Q8VHL1 Refseq (мРНК) NM_001306199 NM_001306200 NM_030648 NM_080793 Refseq (белок) NP_001293128 NP_001293129 NP_085151 NP_542983 Расположение (UCSC) Chr 4: 139,5 - 139,61 МБ CHR 3: 51,42 - 51,47 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Гистон-лизин N-метилтрансфераза SetD7 -это фермент , который у людей кодируется SetD7 геном .

Дальнейшее чтение

• Nagase T, Kikuno R, Hattori A, et al. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 7 (6): 347–55. doi : 10.1093/dnares/7.6.347 . PMID   11214970 .
• Wilson Jr, Jing C, Walker PA, et al. (2002). «Кристаллическая структура и функциональный анализ гистонметилтрансферазы Set7/9» . Клетка . 111 (1): 105–15. doi : 10.1016/s0092-8674 (02) 00964-9 . PMID   12372304 . S2CID   14727763 .
• Jacobs SA, Harp JM, Devarakonda S, et al. (2002). «Активный сайт установленного домена построен на узле». НАТ Структура Биол . 9 (11): 833–8. doi : 10.1038/nsb861 . PMID   12389038 . S2CID   28718612 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC   139241 . PMID   12477932 .
• Kwon T, Chang JH, Kwak E, et al. (2003). «Механизм переноса метила гистона, выявленный структурой SET7/9 -Adomet» . Embo j . 22 (2): 292–303. doi : 10.1093/emboj/cdg025 . PMC   140100 . PMID   12514135 .
• Xiao B, Jing C, Wilson JR, et al. (2003). «Структура и каталитический механизм человеческой гистон метилтрансферазы Set7/9» (PDF) . Природа . 421 (6923): 652–6. Bibcode : 2003natur.421..652x . doi : 10.1038/nature01378 . PMID   12540855 . S2CID   4423407 .
• Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, et al. (2003). «Человеческий sin3 деацетилаза и связанная с тритораксом гистон H3-K4-метилтрансфераза SET1/ASH2 выборочно связывают с помощью фактора пролиферации клеток HCF-1» . Гены Дев . 17 (7): 896–911. doi : 10.1101/gad.252103 . PMC   196026 . PMID   12670868 .
• Kouskouti A, Scheer E, Staub A, et al. (2004). «Ген-специфическая модуляция функции TAF10 с помощью SET9-опосредованного метилирования». Мол Клетка . 14 (2): 175–82. Citeseerx   10.1.1.320.8454 . doi : 10.1016/s1097-2765 (04) 00182-0 . PMID   15099517 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC   528928 . PMID   15489334 .
• Chuikov S, Kurash JK, Wilson JR, et al. (2004). «Регуляция активности р53 посредством метилирования лизина». Природа . 432 (7015): 353–60. Bibcode : 2004natur.432..353c . doi : 10.1038/nature03117 . PMID   15525938 . S2CID   4398310 .
• Couture JF, Collazo E, Hauk G, Trievel RC (2006). «Структурная основа для специфичности сайта метилирования Set7/9». НАТ Структура Мол Биол . 13 (2): 140–6. doi : 10.1038/nsmb1045 . PMID   16415881 . S2CID   38483056 .
• Hayakawa T, Ohtani Y, Hayakawa N, et al. (2007). «RBP2 является комплексным компонентом MRG15 и понижает метилирование внутриагенного гистона H3 лизин 4» . Гены клетки . 12 (6): 811–26. doi : 10.1111/j.1365-2443.2007.01089.x . PMID   17573780 . S2CID   10003129 .