CTCFL

CTCFL
Идентификаторы
Псевдонимы	CTCFL , BORIS, CT27, CTCF-T, HMGB1L1, dJ579F20.2, CCCTC-связывающий фактор, например
Внешние идентификаторы	Опустить : 607022 ; МГИ : 3652571 ; Гомологен : 46476 ; GeneCards : CTCFL ; ОМА : CTCFL — ортологи
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	172,961,318 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; renal cortex; ; lymph node; ; blood; ; liver; ; right lobe of liver; ; kidney; ; duodenum; ; triceps surae; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	spinal ganglia; ; white adipose tissue; ; trigeminal ganglion; ; pons; ; anterior horn of spinal cord; ; ganglion of vagus nerve; ; piriform cortex; ; glossopharyngeal ganglion; ; spermatid; ; Greater petrosal nerve;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; histone binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; metal ion binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; cytoplasm;
Biological process	regulation of gene expression by genetic imprinting; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of histone H3-K4 methylation; DNA methylation involved in gamete generation; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of gene expression; cell cycle; histone methylation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	140690
	664799
	н/д
	ENSMUSG00000070495
	Q8NI51
	А2АПФ3
showНМ_001269040 ; НМ_001269041 ; НМ_001269042 ; НМ_001269043 ; НМ_001269044 ;
	NM_001269045; NM_001269046; NM_001269047; NM_001269048; NM_001269049; NM_001269050; NM_001269051; NM_001269052; NM_001269054; NM_001269055; NM_080618; NM_001386993; NM_001386994; NM_001386995; NM_001386996; NM_001386997
	НМ_001081387 ; НМ_001355185
showНП_001255969 ; НП_001255970 ; НП_001255971 ; НП_001255972 ; НП_001255973 ;
	NP_001255974; NP_001255975; NP_001255976; NP_001255977; NP_001255978; NP_001255979; NP_001255980; NP_001255981; NP_001255983; NP_001255984; NP_542185
	НП_001074856 ; НП_001342114
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Репрессор транскрипции CTCFL, также известный как BORIS (брат регулятора импринтированных сайтов), представляет собой белок , который у человека кодируется CTCFL геном . ^{[ 4 ]}

Функция

CCCTC-связывающий фактор ( CTCF ), фактор из 11 цинковых пальцев , участвующий в регуляции генов, использует различные цинковые пальцы для связывания различных участков ДНК-мишени. CTCF образует чувствительные к метилированию инсуляторы, которые регулируют инактивацию Х-хромосомы . Репрессор транскрипции CTCFL (этот белок) является паралогом CTCF и, по-видимому, экспрессируется преимущественно в цитоплазме сперматоцитов , в отличие от CTCF, который экспрессируется преимущественно в ядрах соматических клеток. CTCF и CTCFL обычно экспрессируются по взаимоисключающему паттерну, который коррелирует со сбросом меток метилирования во время дифференцировки мужских зародышевых клеток. ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070495 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: CTCFL, CCCTC-связывающий фактор (белок цинковых пальцев)» .

Дальнейшее чтение

Кленова Е.М., Морс Х.К., Олссон Р., Лобаненков В.В. (2003). «Новое семейство генов BORIS + CTCF уникально участвует в эпигенетике нормальной биологии и рака». Семин. Рак Биол . 12 (5): 399–414. дои : 10.1016/S1044-579X(02)00060-3 . ПМИД 12191639 .
Д'Арси В., Поре Н., Докье Ф. и др. (2008). «БОРИС, паралог транскрипционного фактора CTCF, аберрантно экспрессируется в опухолях молочной железы» . Бр. Дж. Рак . 98 (3): 571–9. дои : 10.1038/sj.bjc.6604181 . ПМК 2243163 . ПМИД 18195709 .
Волошинска-Рид А., Джеймс С.Р., Линк П.А. и др. (2008). «Зависимая от метилирования ДНК регуляция экспрессии BORIS/CTCFL при раке яичников» . Рак Иммунитет . 7:21 . ПМЦ 2935752 . ПМИД 18095639 .
Рено С., Пугачева Е.М., Дельгадо М.Д. и др. (2008). «Экспрессия CTCF-паралогичного гена рака яичка, брата регулятора импринтированных сайтов (BORIS), регулируется тремя альтернативными промоторами, модулируемыми метилированием CpG, а также факторами транскрипции CTCF и p53» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (21): 7372–88. дои : 10.1093/нар/gkm896 . ПМК 2175345 . ПМИД 17962299 .
Холманских О., Лорио А., Брассер Ф. и др. (2008). «Экспрессия BORIS при меланоме: отсутствие связи с активацией MAGE-A1» . Межд. Дж. Рак . 122 (4): 777–84. дои : 10.1002/ijc.23140 . ПМИД 17957795 . S2CID 28681146 .
Райзингер Дж.И., Чандрамули Г.В., Максвелл Г.Л. и др. (2007). «Глобальный анализ экспрессии генов рака/яичек при раке матки выявил высокую частоту экспрессии BORIS» . Клин. Рак Рез . 13 (6): 1713–9. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2569 . ПМИД 17363524 .
Д'Арси В., Абдуллаев З.К., Поре Н. и др. (2006). «Потенциал BORIS, обнаруженный в лейкоцитах больных раком молочной железы, как ранний маркер онкогенеза». Клин. Рак Рез . 12 (20, часть 1): 5978–86. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2731 . ПМИД 17062669 . S2CID 38340446 .
Хоффманн М.Ю., Мюллер М., Энгерс Р., Шульц В.А. (2007). «Эпигенетический контроль экспрессии CTCFL/BORIS и OCT4 при злокачественных новообразованиях мочеполовой системы». Биохим. Фармакол . 72 (11): 1577–88. дои : 10.1016/j.bcp.2006.06.020 . ПМИД 16854382 .
Хонг Дж.А., Кан Ю., Абдуллаев З. и др. (2005). «Взаимное связывание CTCF и BORIS с промотором NY-ESO-1 совпадает с дерепрессией этого гена рака яичка в клетках рака легких». Рак Рез . 65 (17): 7763–74. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-0823 . ПМИД 16140944 .
Родригес М., Юй Х, Чен Дж., Сунъян З. (2004). «Специфичность связывания фосфопептидов COOH-концевых доменов BRCA1 (BRCT)» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52914–8. дои : 10.1074/jbc.C300407200 . ПМИД 14578343 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Лукинов Д.И., Пугачева Е., Ватолин С. и др. (2002). «BORIS, новый мужской белок, специфичный для зародышевой линии, связанный с событиями эпигенетического перепрограммирования, имеет тот же домен 11-цинковых пальцев, что и CTCF, инсуляторный белок, участвующий в считывании меток импринтинга в соме» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (10): 6806–11. Бибкод : 2002PNAS...99.6806L . дои : 10.1073/pnas.092123699 . ПМК 124484 . ПМИД 12011441 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20 хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .

Внешние ссылки

ФакторБук CTCFL
человека Местоположение генома CTCFL и CTCFL страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070495 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-4] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: CTCFL, CCCTC-связывающий фактор (белок цинковых пальцев)» .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]