CTDP1

CTDP1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1J2X, 1ONV, 2K7L
Идентификаторы
Псевдонимы	CTDP1 , CCFDN, FCP1, субъединица 1 фосфатазы CTD
Внешние идентификаторы	Опустить : 604927 ; МГИ : 1926953 ; Гомологен : 31254 ; Генные карты : CTDP1 ; OMA : CTDP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 18 (human)
End	79,754,503 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	80,512,910 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; skin of leg; ; oocyte; ; granulocyte; ; blood; ; mucosa of transverse colon; ; skin of abdomen; ; secondary oocyte; ; monocyte;
	Top expressed in
	spermatid; ; otic vesicle; ; epiblast; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; hair follicle; ; seminiferous tubule; ; Gonadal ridge; ; primitive streak; ; somite; ; Paneth cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity; protein binding; hydrolase activity; phosphoprotein phosphatase activity; TFIIF-class transcription factor complex binding; Tat protein binding;
Cellular component	cytoplasm; centrosome; spindle pole; RNA polymerase II, holoenzyme; spindle; microtubule organizing center; midbody; spindle midzone; cytoskeleton; nucleus; nucleoplasm; intracellular membrane-bounded organelle; protein-containing complex; actin cytoskeleton; nuclear speck;
Biological process	transcription elongation from RNA polymerase II promoter; protein dephosphorylation; exit from mitosis; transcription by RNA polymerase II; cell division; negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development; dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; cell cycle; positive regulation by host of viral transcription; positive regulation of viral transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9150
	67655
	ENSG00000282752 ; ENSG00000060069
	ENSMUSG00000033323
	Q9Y5B0
	Q7TSG2
	НМ_001202504 ; НМ_004715 ; НМ_048368 ; НМ_001318511
	НМ_026295
	НП_001189433 ; НП_001305440 ; НП_004706 ; НП_430255
	НП_080571
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица РНК-полимеразы II Фосфатаза С-концевого домена представляет собой фермент , который у человека кодируется CTDP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует белок, который взаимодействует с карбокси-концом фактора инициации транскрипции TFIIF, фактора транскрипции, который регулирует элонгацию, а также инициацию РНК-полимеразой II. Белок также может представлять собой компонент голоферментного комплекса РНК-полимеразы II. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию двух вариантов транскрипта, кодирующих две разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CTDP1 взаимодействует с белком, содержащим повторы WD 77 , ^{[ 8 ]} GTF2F1 ^{[ 6 ]} и ПОЛР2А . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000060069 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000282752, ENSG00000060069 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033323 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Аршамбо Дж., Чемберс Р.С., Кобор М.С., Хо Ю., Картье М., Болотин Д., Эндрюс Б., Кейн С.М., Гринблатт Дж. (февраль 1998 г.). «Необходимый компонент фосфатазы С-концевого домена, который взаимодействует с фактором транскрипции IIF в Saccharomyces cerevisiae» . Proc Natl Acad Sci США . 94 (26): 14300–5. Бибкод : 1997PNAS...9414300A . дои : 10.1073/pnas.94.26.14300 . ПМК 24951 . ПМИД 9405607 .
^ Jump up to: ^а ^б Аршамбо Дж., Пан Дж., Дамус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С., Дамус М.Э., Гринблатт Дж. (ноябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица человеческой протеинфосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . J Биол Хим . 273 (42): 27593–601. дои : 10.1074/jbc.273.42.27593 . ПМИД 9765293 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фосфатаза CTDP1 CTD (карбокси-концевой домен, РНК-полимераза II, полипептид А), субъединица 1» .
^ Ликкардо, Паоло; Аменте Стефано; Руджеро Лука; Монти Мария; Пуччи Пьеро; Лания Луиджи; Маджелло Барбара (февраль 2003 г.). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом метилосомного комплекса, участвующим в сборке мяРНП» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (3). Англия: 999–1005. дои : 10.1093/нар/gkg197 . ПМК 149217 . ПМИД 12560496 .
^ Скалли, Р; Андерсон С.Ф.; Чао ДМ; Вэй В; Йе Л; Молодой РА; Ливингстон DM; Парвин Дж.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США 94 (11). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ISSN 0027-8424 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома CTDP1 и CTDP1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М. и др. (1997). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .
Маршалл Н.Ф., Дамус Г.К., Дамус М.Э. (1998). «Регуляция фосфатазы карбоксил-концевого домена с помощью tat-белка ВИЧ-1» . Ж. Биол. Хим . 273 (48): 31726–30. дои : 10.1074/jbc.273.48.31726 . ПМИД 9822634 .
Чо Х., Ким Т.К., Мансебо Х. и др. (1999). «Протеиновая фосфатаза осуществляет переработку РНК-полимеразы II» . Генс Дев . 13 (12): 1540–52. дои : 10.1101/gad.13.12.1540 . ПМК 316795 . ПМИД 10385623 .
Ангеличева Д., Турнев И., Краситель Д. и др. (1999). «Синдром врожденной катаракты и невропатии лицевого дисморфизма (CCFDN): новое нарушение развития у цыган, связанное с 18qter» . Евро. Дж. Хум. Жене . 7 (5): 560–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200319 . ПМИД 10439962 .
Маршалл Н.Ф., Дамус М.Э. (2000). «Чувствительность С-концевого домена РНК-полимеразы II к фосфатазе в комплексах ранней элонгации на основных поздних матрицах ВИЧ-1 и аденовируса 2» . Ж. Биол. Хим . 275 (42): 32430–7. дои : 10.1074/jbc.M005898200 . ПМИД 10938286 .
Ликчардо П., Наполитано Г., Маджелло Б., Лания Л. (2001). «Ингибирование трансактивации Tat РНК-полимеразой II CTD-фосфатазой FCP1» . СПИД . 15 (3): 301–7. дои : 10.1097/00002030-200102160-00002 . ПМИД 11273209 . S2CID 33054695 .
Бхаруча Д.С., Чжоу М., Нехай С. и др. (2002). «Протеин-фосфатаза из Т-клеток человека усиливает трансактивацию долгоконцевого повтора вируса иммунодефицита человека типа 1» . Вирусология . 296 (1): 6–16. дои : 10.1006/виро.2002.1438 . ПМИД 12036313 .
Вашингтон К., Аммосова Т., Бёлленс М. и др. (2002). «Протеинфосфатаза-1 дефосфорилирует С-концевой домен РНК-полимеразы-II» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40442–8. дои : 10.1074/jbc.M205687200 . ПМИД 12185079 .
Мандал С.С., Чо Х., Ким С. и др. (2002). «FCP1, фосфатаза, специфичная для гептапептидного повтора крупнейшей субъединицы РНК-полимеразы II, стимулирует элонгацию транскрипции» . Мол. Клетка. Биол . 22 (21): 7543–52. дои : 10.1128/MCB.22.21.7543-7552.2002 . ПМК 135672 . ПМИД 12370301 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ликкардо П., Аменте С., Руджеро Л. и др. (2003). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом метилосомного комплекса, участвующим в сборке мяРНП» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (3): 999–1005. дои : 10.1093/нар/gkg197 . ПМК 149217 . ПМИД 12560496 .
Нгуен Б.Д., Чен Х.Т., Кобор М.С. и др. (2003). «Структура раствора карбоксильно-концевого домена RAP74 и ЯМР-характеристика сайтов связывания FCP1 RAP74 и TFIIB человека». Биохимия . 42 (6): 1460–9. дои : 10.1021/bi0265473 . ПМИД 12578358 .
Фридл Э.М., Лейн В.С., Эрдьюмент-Бромаж Х. и др. (2003). «Фосфатаза С-концевого домена и активность удлинения транскрипции FCP1 регулируются фосфорилированием» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (5): 2328–33. Бибкод : 2003PNAS..100.2328F . дои : 10.1073/pnas.2628049100 . ПМЦ 151340 . ПМИД 12591939 .
Камада К., Редер Р.Г., Берли С.К. (2003). «Молекулярный механизм рекрутирования TFIIF-ассоциированной фосфатазы С-концевого домена РНК-полимеразы (FCP1) с помощью транскрипционного фактора IIF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (5): 2296–9. Бибкод : 2003PNAS..100.2296K . дои : 10.1073/pnas.262798199 . ПМЦ 151334 . ПМИД 12591941 .
Нгуен Б.Д., Эбботт К.Л., Потемпа К. и др. (2003). «ЯМР-структура комплекса, содержащего субъединицу TFIIF RAP74 и фосфатазу карбоксильного домена РНК-полимеразы II FCP1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (10): 5688–93. Бибкод : 2003PNAS..100.5688N . дои : 10.1073/pnas.1031524100 . ПМК 156262 . ПМИД 12732728 .
Варон Р., Гудинг Р., Стеглих С. и др. (2003). «Частичный дефицит фосфатазы С-концевого домена РНК-полимеразы II связан с врожденной катарактой, синдромом дисморфизма лицевого нерва». Нат. Жене . 35 (2): 185–9. дои : 10.1038/ng1243 . ПМИД 14517542 . S2CID 22461437 .
Ю X, Чини CC, He M и др. (2003). «Домен BRCT представляет собой домен, связывающий фосфобелок». Наука . 302 (5645): 639–42. Бибкод : 2003Sci...302..639Y . дои : 10.1126/science.1088753 . ПМИД 14576433 . S2CID 29407635 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 18 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000060069 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000282752, ENSG00000060069 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033323 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9405607-5] Аршамбо Дж., Чемберс Р.С., Кобор М.С., Хо Ю., Картье М., Болотин Д., Эндрюс Б., Кейн С.М., Гринблатт Дж. (февраль 1998 г.). «Необходимый компонент фосфатазы С-концевого домена, который взаимодействует с фактором транскрипции IIF в Saccharomyces cerevisiae» . Proc Natl Acad Sci США . 94 (26): 14300–5. Бибкод : 1997PNAS...9414300A . дои : 10.1073/pnas.94.26.14300 . ПМК 24951 . ПМИД 9405607 .

[pmid9765293-6] Jump up to: ^а ^б Аршамбо Дж., Пан Дж., Дамус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С., Дамус М.Э., Гринблатт Дж. (ноябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица человеческой протеинфосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . J Биол Хим . 273 (42): 27593–601. дои : 10.1074/jbc.273.42.27593 . ПМИД 9765293 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фосфатаза CTDP1 CTD (карбокси-концевой домен, РНК-полимераза II, полипептид А), субъединица 1» .

[pmid12560496-8] Ликкардо, Паоло; Аменте Стефано; Руджеро Лука; Монти Мария; Пуччи Пьеро; Лания Луиджи; Маджелло Барбара (февраль 2003 г.). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом метилосомного комплекса, участвующим в сборке мяРНП» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (3). Англия: 999–1005. дои : 10.1093/нар/gkg197 . ПМК 149217 . ПМИД 12560496 .

[pmid9159119-9] Скалли, Р; Андерсон С.Ф.; Чао ДМ; Вэй В; Йе Л; Молодой РА; Ливингстон DM; Парвин Дж.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США 94 (11). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ISSN 0027-8424 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]