Рибопереключатель SAM-II
| Рибопереключатель SAM (альфа-протеобактерии) | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SAM_alpha | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СЭМ_альфа |
| Рфам | RF00521 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Цис-рег ; рибопереключатель |
| Домен(ы) | Бактерии |
| ИДТИ | GO:0045814 |
| ТАК | ТАК: 0000035 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Рибопереключатель SAM-II , обнаруженный преимущественно представляет собой элемент РНК у альфапротеобактерий , который связывает S-аденозилметионин (SAM). [ 1 ] Его структура и последовательность, по-видимому, не связаны с рибопереключателем SAM , обнаруженным у грамположительных бактерий . Этот рибопереключатель SAM расположен выше генов metA и metC в Agrobacterium tumefaciens и других генов биосинтеза метионина и SAM в других альфа-протеобактериях. Как и другой рибопереключатель SAM, он, вероятно, блокирует экспрессию этих генов в ответ на повышенные уровни SAM. Значимый вариант рибопереключателей SAM-II был обнаружен у Pelagibacter ubique и родственных ему морских бактерий и назван SAM-V . [ 2 ] Кроме того, как и многие структурированные РНК, рибопереключатели SAM-II могут допускать наличие длинных петель между своими стеблями. [ 3 ]
Структура
[ редактировать ]Рибопереключатель SAM-II короткий, содержит менее 70 нуклеотидов и имеет относительно простую структуру, состоящую из одной шпильки и псевдоузла .
См. также
[ редактировать ]- Рибопереключатель SAM-I
- Рибопереключатель SAM-III
- Рибопереключатель SAM-IV
- SAM-V riboswitch
- Рибопереключатель SAM-VI
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Корбино К.А., Баррик Дж.Э., Лим Дж. и др. (2005). «Доказательства существования второго класса S-аденозилметиониновых рибопереключателей и других регуляторных мотивов РНК у альфа-протеобактерий» . Геном Биол . 6 (8): 70 рандов. дои : 10.1186/gb-2005-6-8-r70 . ПМЦ 1273637 . ПМИД 16086852 .
- ^ Поята Э., Мейер М.М., Эймс Т.Д., Брейкер Р.Р. (ноябрь 2009 г.). «Вариант класса аптамеров рибосвитча для S-аденозилметионина, распространенный у морских бактерий» . РНК . 15 (11): 2046–2056. дои : 10.1261/rna.1824209 . ПМЦ 2764483 . ПМИД 19776155 .
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х., Бог Дж. и др. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата в структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов» . Геном Биол . 11 (3): С31. дои : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . ПМЦ 2864571 . ПМИД 20230605 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |