Рибопереключатель SAM-IV

рибопереключатель S-аденозилметионин (SAM),
рибопереключатель S-аденозилметионин (SAM),
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SAM-IV
Идентификаторы
Символ	САМ-IV
Рфам	RF00634 CL00012
Другие данные
РНК Тип	Цис-рег ; рибопереключатель
Домен(ы)	Бактерии
ТАК	ТАК: 0005836
PDB Структуры	ПДБе

Рибопереключатели SAM-IV представляют собой разновидность рибопереключателя , который специфически связывает S-аденозилметионин (SAM), ^{[ 1 ]} кофактор, используемый во многих реакциях метилирования. Первоначально идентифицированный биоинформатиками , ^{[ 2 ]} Рибопереключатели SAM-IV в основном относятся к Actinomycetales , отряду бактерий . Консервативные особенности рибопереключателя SAM-IV и эксперименты предполагают, что они, вероятно, имеют тот же сайт связывания SAM, что и другой класс рибопереключателей SAM-связывания, называемый рибопереключателями SAM-I . Однако каркасы этих двух типов рибопереключателей, по-видимому, весьма различны. Структурная связь между этими типами рибопереключателей была изучена. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

См. также

Ссылки

^ Вайнберг З., Регулски Э.Э., Хаммонд М.С. и др. (2008). «Аптамерное ядро рибопереключателей SAM-IV имитирует сайт связывания лиганда рибопереключателей SAM-I» . РНК . 14 (5): 822–828. дои : 10.1261/rna.988608 . ПМК 2327355 . ПМИД 18369181 .
^ Вайнберг З., Баррик Дж.Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 структурированных РНК-кандидатов в бактериях с использованием конвейера сравнительной геномики CMfinder» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (14): 4809–4819. дои : 10.1093/нар/gkm487 . ПМК 1950547 . ПМИД 17621584 .
^ Трауш Дж.Дж., Сюй З., Эдвардс А.Л., Рейес Ф.Е., Росс П.Е., Найт Р., Бэти Р.Т. (май 2014 г.). «Структурная основа разнообразия в клане рибопереключателей SAM» . Proc Natl Acad Sci США . 111 (18): 6624–9. Бибкод : 2014PNAS..111.6624T . дои : 10.1073/pnas.1312918111 . ПМК 4020084 . ПМИД 24753586 .
^ Чжан К., Ли С., Каппель К., Пинтилие Дж., Су З., Моу Т.С., Шмид М.Ф., Дас Р., Чиу В. (декабрь 2019 г.). «Крио-ЭМ-структура РНК-рибопереключателя SAM-IV массой 40 кДа с разрешением 3,7 Å» . Нат Коммун . 10 (1): 5511. Бибкод : 2019NatCo..10.5511Z . дои : 10.1038/s41467-019-13494-7 . ПМК 6890682 . ПМИД 31796736 .

Внешние ссылки

Страница SAM-IV_riboswitch на Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Вайнберг З., Регулски Э.Э., Хаммонд М.С. и др. (2008). «Аптамерное ядро рибопереключателей SAM-IV имитирует сайт связывания лиганда рибопереключателей SAM-I» . РНК . 14 (5): 822–828. дои : 10.1261/rna.988608 . ПМК 2327355 . ПМИД 18369181 .

[2] Вайнберг З., Баррик Дж.Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 структурированных РНК-кандидатов в бактериях с использованием конвейера сравнительной геномики CMfinder» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (14): 4809–4819. дои : 10.1093/нар/gkm487 . ПМК 1950547 . ПМИД 17621584 .

[3] Трауш Дж.Дж., Сюй З., Эдвардс А.Л., Рейес Ф.Е., Росс П.Е., Найт Р., Бэти Р.Т. (май 2014 г.). «Структурная основа разнообразия в клане рибопереключателей SAM» . Proc Natl Acad Sci США . 111 (18): 6624–9. Бибкод : 2014PNAS..111.6624T . дои : 10.1073/pnas.1312918111 . ПМК 4020084 . ПМИД 24753586 .

[4] Чжан К., Ли С., Каппель К., Пинтилие Дж., Су З., Моу Т.С., Шмид М.Ф., Дас Р., Чиу В. (декабрь 2019 г.). «Крио-ЭМ-структура РНК-рибопереключателя SAM-IV массой 40 кДа с разрешением 3,7 Å» . Нат Коммун . 10 (1): 5511. Бибкод : 2019NatCo..10.5511Z . дои : 10.1038/s41467-019-13494-7 . ПМК 6890682 . ПМИД 31796736 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]