Семейство белков устойчивости к акрифлавину
| Acr_tran | |||
|---|---|---|---|
 Структурные основы множественной связывающей способности многородного оттока ACRB | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Acr_tran | ||
| Pfam | PF00873 | ||
| PFAM клан | CL0322 | ||
| InterPro | IPR001036 | ||
| Краткое содержание | 1oy6 / scope / supfam | ||
| TCDB | 2.A.6 | ||
| OPM Суперсемейство | 16 | ||
| OPM белок | 2GIF | ||
| |||
- эшерухии Устойчивость к с несколькими лекарствами акрифлавина (гены ACRA и ACRB) кодируют систему оттока , которая, как полагают, защищает бактерию от гидрофобных ингибиторов . [ 1 ] E.coli Acrb Белок является транспортером , который под напряжением протоно-мотительной силой и показывает самую широкую субстратную специфичность среди всех известных многоклеточных насосов, начиная от большинства в настоящее время используемых в настоящее время антибиотиков, дезинфицирующих средств, красителей и моющих средств до простых растворителей .
Структура ACRB без лигандов показывает , что это гомотример 110 кДа на субъединицу. Каждая субъединица содержит 12 трансмембранных спиралей и два больших периплазматических домена (каждая из них превышает 300 остатков) между спиралями 1 и 2, и спирали 7 и 8. рентгеновского Анализ белка ACRB с сверхэкспрессированным продемонстрировал, что три периплазматические домены образуются, в центре, похожая на направляющая структура и соединенная узкая (или закрытая) поре. Поры открываются в периплазму через три вестибюли, расположенные на интерфейсах субъединиц. Эти вестибюли были предложены для обеспечения прямого доступа к лекарственным средствам из периплазмы, а также внешней листовок цитоплазматической мембраны . Три трансмембранных домена протомеров ACRB образуют большую центральную полость шириной 30А, которая охватывает цитоплазматическую мембрану и распространяется на цитоплазму
Рентгеновские кристаллографические структуры тримерного насоса ACRB от E. coli с четырьмя структурно разнообразными лигандами продемонстрировали, что три связываются одновременно молекулы лиганда с чрезвычайно большой центральной полостью 5000 кубических ангстрем, в первую очередь с помощью гидрофобного, ароматического стека и взаимодействия ван-дер-ваальса. Каждый лиганд использует немного другое подмножество остатков ACRB для связывания . Связанные лиганда молекулы часто взаимодействуют друг с другом, стабилизируя связывание.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ma D, Cook DN, Alberti M, Pon Ng, Nikaido H, Hearst JE (октябрь 1993). «Молекулярное клонирование и характеристика генов Acra и Acre of Escherichia coli» . J. Bacteriol . 175 (19): 6299–313. doi : 10.1128/jb.175.19.6299-6313.1993 . PMC 206727 . PMID 8407802 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
СМИ, связанные с семейством белков устойчивости к акрифлавину в Wikimedia Commons
