Кровать цинкового пальца
| ZF-клет | |||
|---|---|---|---|
 Структура раствора домена слоя цинкового пальца домена слоя цинкового пальца, содержащий белок 1 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ZF-клет | ||
| Pfam | PF02892 | ||
| PFAM клан | CL0361 | ||
| InterPro | IPR003656 | ||
| |||
В молекулярной биологии домен цинкового пальца в типе слоя представляет собой белковый домен , который был назван в честь Drosophila -белков AF и D Ref, обнаружен в одном или нескольких копиях в клеточных регуляторных факторах и транспозазах от растений, животных и грибков . Кровальный палец представляет собой от 50 до 60 аминокислот домен аминокислот , который содержит характерный мотив с двумя высококонсервативными ароматическими положениями, а также общий паттерн цистеинов и гистидинов , который, как предсказывается, образует цинковый пальцем. Поскольку разнообразные пальцы для кроватей способны связывать ДНК, было высказано предположение, что ДНК-связывание является общей функцией этого домена. [ 1 ] Некоторые белки, которые, как известно, содержат домен, включают животные, растения и грибов AC1 и Hobo-подобные транспозазы; Белок Caenorhabditis elegans DPY-20, прогнозируемый регулятор транскрипционного транскрипции кутикулярного гена ; Drosophila Beaf (фактор, связанный с граничным элементом), который, как считается, участвует в изоляции хроматина; Drosophila Dref, регулятор транскрипции для генов S-фазы; и табак 3AF1 и томатный E4/E8-BP1, свето- и этилен-регулируемые ДНК-связывающие белки, которые содержат два пальца в постель. Считается, что большинство генов в этом семействе развивались из шляп семейства транспозонов ДНК . [ 2 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Aravind L (сентябрь 2000 г.). «Кровать, новый ДНК-связывающий домен в белках и транспозазах, связывающих хроматин, и транспозазы». Тенденции в биохимических науках . 25 (9): 421–3. doi : 10.1016/s0968-0004 (00) 01620-0 . PMID 10973053 .
- ^ Хейворд, Александр; Газел, Аваиса; Андерссон, Гёран; Андерссон, Лейф; Джерн, Патрик; Робинсон-Ричави, Марк (22 марта 2013 г.). «ZBED Evolution: повторное использование транспозонов ДНК в качестве регуляторов разнообразных функций хозяина» . Plos один . 8 (3): E59940. Bibcode : 2013ploso ... 859940h . doi : 10.1371/journal.pone.0059940 . PMC 3606216 . PMID 23533661 .