Домен LysM

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Домен LysM
Домен LysM
Идентификаторы
Символ	ЛизМ
Пфам	PF01476
ИнтерПро	IPR000644
УМНЫЙ	ЛизМ
PROSITE	ПС51782
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1e0g / SCOPe / СУПФАМ
CDD	cd00118
Мембраном	1306
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

В молекулярной биологии домен LysM представляет собой белковый домен, обнаруженный во многих внеклеточных белках и рецепторах. Домен LysM назван в честь мотива лизина, который был первоначальным названием мотива последовательности, идентифицированного в бактериальных белках. Первоначально этот регион был идентифицирован как С-концевой повтор, обнаруженный в Enterococcus hirae мурамидазе . ^{[ 1 ]} Домен LysM обнаружен в широком спектре микробных внеклеточных белков, где, как полагают, домен LysM обеспечивает закрепление внеклеточных полисахаридов, таких как пептидогликан и хитин . Домены LysM также обнаружены в растительных рецепторах, включая NFP, рецептор фактора Nod , который необходим для симбиоза корневых клубеньков между бобовыми и симбиотическими бактериями . ^{[ 2 ]} Домен LysM обычно имеет длину от 44 до 65 аминокислотных остатков. ^{[ 3 ]} Структура домена LysM показала, что он состоит из пары антипараллельных бета-цепей, разделенных парой коротких альфа-спиралей . ^{[ 4 ]}

См. также

Нод-фактор

Ссылки

^ Джорис Б., Энглеберт С., Чу С.П., Карияма Р., Данео-Мур Л., Шокман Г.Д., Гуйсен Дж.М. (март 1992 г.). «Модульная конструкция мурамидазы-2 Enterococcus hirae и аутолизина Streptococcus faecalis» . Письма FEMS по микробиологии . 70 (3): 257–64. дои : 10.1016/0378-1097(92)90707-у . ПМИД 1352512 .
^ Арриги, Жан-Франсуа; Барре, Анник; Бен Амор, Бесма; Берсу, Энн; Сориано, Лидия Кампос; Мирабелла, Россана; де Карвалью-Нибель, Фернанда; Журне, Этьен-Паскаль; Герарди, Мишель; Уге, Тьерри; Гертс, Рене (2006). «Семейство генов киназы, подобного лизиновому мотиву и рецептору Medicago truncatula, включает NFP и новые гены, экспрессируемые узелками» . Физиология растений . 142 (1): 265–279. дои : 10.1104/стр.106.084657 . ISSN 0032-0889 . ПМК 1557615 . ПМИД 16844829 .
^ Бьюист Г., Стин А., Кок Дж., Кейперс О.П. (май 2008 г.). «LysM, широко распространенный белковый мотив для связывания с (пептидо)гликанами» . Молекулярная микробиология . 68 (4): 838–47. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06211.x . ПМИД 18430080 .
^ Бейтман А., Байкрофт М. (июнь 2000 г.). «Структура домена LysM из мембраносвязанной литической муреин-трансгликозилазы D (MltD) E. coli». Журнал молекулярной биологии . 299 (4): 1113–9. дои : 10.1006/jmbi.2000.3778 . ПМИД 10843862 .

[1] Джорис Б., Энглеберт С., Чу С.П., Карияма Р., Данео-Мур Л., Шокман Г.Д., Гуйсен Дж.М. (март 1992 г.). «Модульная конструкция мурамидазы-2 Enterococcus hirae и аутолизина Streptococcus faecalis» . Письма FEMS по микробиологии . 70 (3): 257–64. дои : 10.1016/0378-1097(92)90707-у . ПМИД 1352512 .

[2] Арриги, Жан-Франсуа; Барре, Анник; Бен Амор, Бесма; Берсу, Энн; Сориано, Лидия Кампос; Мирабелла, Россана; де Карвалью-Нибель, Фернанда; Журне, Этьен-Паскаль; Герарди, Мишель; Уге, Тьерри; Гертс, Рене (2006). «Семейство генов киназы, подобного лизиновому мотиву и рецептору Medicago truncatula, включает NFP и новые гены, экспрессируемые узелками» . Физиология растений . 142 (1): 265–279. дои : 10.1104/стр.106.084657 . ISSN 0032-0889 . ПМК 1557615 . ПМИД 16844829 .

[Steen-3] Бьюист Г., Стин А., Кок Дж., Кейперс О.П. (май 2008 г.). «LysM, широко распространенный белковый мотив для связывания с (пептидо)гликанами» . Молекулярная микробиология . 68 (4): 838–47. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06211.x . ПМИД 18430080 .

[4] Бейтман А., Байкрофт М. (июнь 2000 г.). «Структура домена LysM из мембраносвязанной литической муреин-трансгликозилазы D (MltD) E. coli». Журнал молекулярной биологии . 299 (4): 1113–9. дои : 10.1006/jmbi.2000.3778 . ПМИД 10843862 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]