Домен GYF

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

ССЫЛКА
ССЫЛКА
	кристаллическая структура бинарного комплекса u5 snrnp
Идентификаторы
Символ	ССЫЛКА
Пфам	PF02213
ИнтерПро	ИПР003169
УМНЫЙ	ССЫЛКА
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1гиф / СКОПе / СУПФАМ
CDD	cd00072
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

В молекулярной биологии домен GYF ( домен глицина - тирозина - фенилаланина состоящий примерно из 60 аминокислот ) представляет собой белковый домен, , который содержит консервативный GP[YF]xxxx[MV]xxWxxx[GN]YF мотив . Он был идентифицирован во человека внутриклеточном белке , называемом CD2-связывающим белком 2 ( CD2BP2 ), который связывается с сайтом, содержащим два тандемных сегмента PPPGHR в цитоплазматической области CD2 . Эксперименты по связыванию и мутационный анализ продемонстрировали решающую важность трипептида GYF в связывании лиганда . Домен GYF также обнаружен в нескольких других эукариотических белках с неизвестной функцией. ^{[ 1 ]} Было высказано предположение, что домен GYF, обнаруженный в этих белках, также может участвовать в распознавании последовательностей, богатых пролином . ^{[ 2 ]} Разрешение структуры домена CD2BP2 GYF с помощью ЯМР-спектроскопии выявило компактный домен с топологией бета-бета-альфа-бета-бета, где единственная альфа-спираль отклонена от скрученного антипараллельного бета-листа . Консервативные остатки домена GYF создают сплошной участок преимущественно гидрофобной природы, который образует неотъемлемую часть сайта связывания лиганда. ^{[ 2 ]} Существует ограниченная гомология внутри C-концевых 20-30 аминокислот различных доменов GYF, что подтверждает идею о том, что эта часть домена структурно , но не функционально важна. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Нисидзава К., Фрейнд С., Ли Дж., Вагнер Г., Рейнхерц Э.Л. (декабрь 1998 г.). «Идентификация пролин-связывающего мотива, регулирующего активацию Т-лимфоцитов, запускаемую CD2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (25): 14897–902. Бибкод : 1998PNAS...9514897N . дои : 10.1073/pnas.95.25.14897 . ПМК 24547 . ПМИД 9843987 .
^ Jump up to: ^а ^б Фройнд С., Доч В., Нисидзава К., Рейнхерц Э.Л., Вагнер Г. (июль 1999 г.). «Домен GYF представляет собой новую структурную складку, которая участвует в передаче лимфоидных сигналов через богатые пролином последовательности». Нат. Структура. Биол . 6 (7): 656–60. дои : 10.1038/10712 . ПМИД 10404223 . S2CID 19688996 .
^ Фройнд С., Куне Р., Ян Х., Парк С., Райнхерц Э.Л., Вагнер Г. (ноябрь 2002 г.). «Динамическое взаимодействие CD2 с GYF и доменом SH3 разделенных эффекторных молекул» . ЭМБО Дж . 21 (22): 5985–95. дои : 10.1093/emboj/cdf602 . ПМК 137194 . ПМИД 12426371 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR003169.

Внешние ссылки

ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива LIG_GYF

[pmid9843987-1] Нисидзава К., Фрейнд С., Ли Дж., Вагнер Г., Рейнхерц Э.Л. (декабрь 1998 г.). «Идентификация пролин-связывающего мотива, регулирующего активацию Т-лимфоцитов, запускаемую CD2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (25): 14897–902. Бибкод : 1998PNAS...9514897N . дои : 10.1073/pnas.95.25.14897 . ПМК 24547 . ПМИД 9843987 .

[pmid10404223-2] Jump up to: ^а ^б Фройнд С., Доч В., Нисидзава К., Рейнхерц Э.Л., Вагнер Г. (июль 1999 г.). «Домен GYF представляет собой новую структурную складку, которая участвует в передаче лимфоидных сигналов через богатые пролином последовательности». Нат. Структура. Биол . 6 (7): 656–60. дои : 10.1038/10712 . ПМИД 10404223 . S2CID 19688996 .

[pmid12426371-3] Фройнд С., Куне Р., Ян Х., Парк С., Райнхерц Э.Л., Вагнер Г. (ноябрь 2002 г.). «Динамическое взаимодействие CD2 с GYF и доменом SH3 разделенных эффекторных молекул» . ЭМБО Дж . 21 (22): 5985–95. дои : 10.1093/emboj/cdf602 . ПМК 137194 . ПМИД 12426371 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]