✖


Jump to content

Масс-спектрометрическая визуализация

Масс-спектрометрическая визуализация ( MSI ) — это метод, используемый в масс-спектрометрии для визуализации пространственного распределения молекул, таких как биомаркеры , метаболиты , пептиды или белки, по их молекулярным массам. После сбора масс-спектра в одном месте образец перемещается в другую область и так далее, пока не будет просканирован весь образец. При выборе пика в полученных спектрах, который соответствует интересующему соединению, данные МС используются для картирования его распределения по образцу. В результате получаются изображения пространственного распределения составного элемента попиксельно. Каждый набор данных содержит настоящую галерею изображений, поскольку любой пик в каждом спектре может быть пространственно отображен. Несмотря на то, что MSI обычно считается качественным методом, сигнал, генерируемый этим методом, пропорционален относительному содержанию аналита. Следовательно, количественная оценка возможна, когда ее проблемы будут преодолены. Хотя широко используются традиционные методологии, такие как Радиохимия и иммуногистохимия достигают той же цели, что и MSI, они ограничены в своих возможностях анализировать несколько образцов одновременно и могут оказаться недостаточными, если исследователи не имеют предварительных знаний об изучаемых образцах. [1] Наиболее распространенными технологиями ионизации в области MSI являются визуализация DESI , визуализация MALDI , масс-спектрометрическая визуализация вторичных ионов ( SIMS-визуализация ) и наномасштабная SIMS (NanoSIMS). [2] [3] [4]

История

[ редактировать ]

внедрили MSI с использованием вторично-ионной масс-спектрометрии (SIMS) для изучения поверхностей полупроводников. Более 50 лет назад Кастаинг и Слодзиан [5] Тем не менее, это была новаторская работа Ричарда Каприоли и его коллег в конце 1990-х годов, демонстрирующая, как матричная лазерная десорбция/ионизация (MALDI) может применяться для визуализации крупных биомолекул (таких как белки и липиды) в клетках и тканях, чтобы выявить функцию этих молекул и то, как их функции изменяются при таких заболеваниях, как рак, что привело к широкому использованию MSI. В настоящее время используются различные методы ионизации, включая SIMS, MALDI и десорбционную ионизацию электрораспылением (DESI) , а также другие технологии. Тем не менее, MALDI в настоящее время является доминирующей технологией в отношении клинического и биологического применения MSI. [6]

Принцип работы

[ редактировать ]

MSI основан на пространственном распределении выборки. Следовательно, принцип работы зависит от метода, который используется для получения пространственной информации. В MSI используются два метода: микрозонд и микроскоп. [7]

Микрозонд

[ редактировать ]

Этот метод выполняется с использованием сфокусированного луча ионизации для анализа определенной области образца путем создания масс-спектра. Масс-спектр сохраняется вместе с пространственной координацией места проведения измерения. Затем новая область выбирается и анализируется путем перемещения образца или луча ионизации. Эти шаги повторяются до тех пор, пока весь образец не будет отсканирован. Объединив все отдельные масс-спектры, можно построить карту распределения интенсивностей в зависимости от местоположений x и y. В результате получают восстановленные молекулярные изображения образца. [7]

Микроскоп

[ редактировать ]

В этом методе 2D -позиционно-чувствительный детектор используется для измерения пространственного происхождения ионов, генерируемых на поверхности образца, с помощью ионной оптики инструментов. Разрешение пространственной информации будет зависеть от увеличения микроскопа, качества ионной оптики и чувствительности детектора. Новый регион еще нужно сканировать, но количество позиций резко сокращается. Ограничением этого режима является ограниченная глубина зрения, присущая всем микроскопам. [7]

Зависимость от источника ионов

[ редактировать ]

Методы ионизации, доступные для MSI, подходят для различных приложений. Некоторыми критериями выбора метода ионизации являются требования к подготовке пробы и параметры измерения, такие как разрешение, диапазон масс и чувствительность. Исходя из этого, наиболее распространенными методами ионизации являются MALDI , SIMS и DESI, которые описаны ниже. Тем не менее, другими второстепенными методами являются лазерная абляция, ионизация электрораспылением (LAESI) , лазерная абляция и индуктивно-связанная плазма (LA-ICP) и ионизация электрораспылением, десорбция нанораспылением (nano-DESI) .

Визуализация SIMS и NanoSIMS

[ редактировать ]

Масс-спектрометрия вторичных ионов (ВИМС) используется для анализа твердых поверхностей и тонких пленок путем распыления поверхности сфокусированным пучком первичных ионов , а также сбора и анализа выброшенных вторичных ионов. Существует множество различных источников первичного ионного пучка. Однако первичный ионный пучок должен содержать ионы, находящиеся на более высоком конце энергетической шкалы. Некоторые распространенные источники: Cs. + , О 2 + , О, Ар + и Га + . [8] Визуализация SIMS выполняется аналогично электронной микроскопии ; пучок первичных ионов испускается через образец, а вторичные масс-спектры записываются. [9] SIMS оказывается преимуществом в обеспечении высочайшего разрешения изображения, но только на небольшой площади образцов. [10] Более того, этот метод широко считается одним из наиболее чувствительных форм масс-спектрометрии, поскольку он может обнаруживать элементы в концентрациях всего 10 12 -10 16 атомов на кубический сантиметр. [11] [примечание 1] [примечание 2]

Мультиплексная ионно-лучевая визуализация (MIBI) — это метод SIMS, в котором для мечения соединений в биологических образцах используются антитела, меченные изотопами металлов. [12]

Изменения в SIMS: В SIMS были внесены некоторые химические модификации для повышения эффективности процесса. В настоящее время используются два отдельных метода, помогающих повысить общую эффективность за счет увеличения чувствительности измерений ВИМС: ВИМС с матричным усилением (ME-SIMS). Он имеет ту же пробоподготовку, что и MALDI, поскольку имитирует химические ионизационные свойства MALDI. . ME-SIMS не отбирает столько материала. Однако, если тестируемый аналит имеет низкую массу, он может давать спектры, аналогичные спектрам MALDI. ME-SIMS оказался настолько эффективным, что позволил обнаружить химические вещества с малой массой на субклеточном уровне, что было невозможно до разработки метода ME-SIMS. [4] Второй используемый метод называется металлизацией образца (Meta-SIMS). Это процесс добавления золота или серебра в образец. При этом вокруг образца образуется слой золота или серебра, толщина которого обычно не превышает 1–3 нм. Использование этого метода привело к увеличению чувствительности для образцов большей массы. Добавление металлического слоя также позволяет преобразовать изолирующие образцы в проводящие образцы, поэтому компенсация заряда в экспериментах ВИМС больше не требуется. [13]

Субклеточное (50 нм) разрешение обеспечивается NanoSIMS. [2] позволяющий проводить абсолютный количественный анализ на уровне органелл.

MALDI-изображение

[ редактировать ]
Мышиная почка: (а) MALDI-спектры ткани. (б) Ткань, окрашенная H&E. N-гликаны с m/z = 1996,7 (c) расположены в коре и мозговом веществе, тогда как m/z = 2158,7 (d) находятся в коре головного мозга, (e) Наложение изображения этих двух образований, (f) необработанная контрольная ткань . [14]
Основная статья: MALDI-изображения

Лазерная десорбция-ионизация с помощью матрицы может использоваться в качестве метода масс-спектрометрической визуализации относительно больших молекул. [4] Недавно было показано, что наиболее эффективным типом матрицы является ионная матрица для MALDI-визуализации тканей. В этой версии метода образец, обычно тонкий срез ткани , перемещается в двух измерениях при масс-спектра . записи [15] Хотя MALDI имеет преимущество, заключающееся в возможности регистрации пространственного распределения более крупных молекул, это достигается за счет более низкого разрешения, чем метод SIMS. Предел латерального разрешения для большинства современных инструментов, использующих MALDI, составляет 20. м. В экспериментах MALDI для ионизации обычно используется лазер Nd:YAG (355 нм) или N 2 (337 нм). [4]

Фармакодинамику и токсикодинамику в тканях изучали с помощью MALDI-визуализации. [16]

DESI визуализация

[ редактировать ]

Десорбция электрораспылением. Ионизация — менее разрушительный метод, сочетающий в себе простоту и быстрый анализ пробы. Образец распыляется электрически заряженным туманом растворителя под углом, который вызывает ионизацию и десорбцию различных молекулярных частиц. Затем формируются двумерные карты содержания выбранных ионов на поверхности образца в зависимости от пространственного распределения. [17] [10] Этот метод применим к твердым, жидким, замороженным и газообразным образцам. Кроме того, DESI позволяет анализировать широкий спектр органических и биологических соединений, таких как ткани животных и растений, а также образцы клеточных культур, без сложной пробоподготовки. [6] [10] Несмотря на то, что этот метод имеет самое низкое разрешение среди других, он позволяет создавать высококачественные изображения при сканировании большой площади, например при сканировании всего участка тела. [10] Фн

Сравнение методов ионизации

[ редактировать ]
Сравнение типичных параметров методов MSI [10]
Источник ионизации Тип ионизации Аналиты Пространственное разрешение Массовый диапазон
ВИМС Ионная пушка Жесткий Ионы элементов, малые молекулы, липиды <10 м 0-1000 Да
МАЛЬДИ УФ лазерный луч Мягкий Липиды, пептиды, белки 20 м 0-100 000 Да
ХОТЯ Растворитель-спрей Мягкий Малые молекулы, липиды, пептиды 50 м 0-2000 Да

Сочетание различных методов MSI и других методов визуализации.

[ редактировать ]

Комбинирование различных методов MSI может быть полезным, поскольку каждый конкретный метод имеет свои преимущества. Например, когда в одном и том же срезе ткани необходима информация как о белках, так и о липидах, необходимо выполнить DESI для анализа липидов, затем MALDI для получения информации о пептиде и завершить нанесение красителя (гематоксилин и эозин) для медицинской диагностики структурная характеристика ткани. [10] На другой стороне MSI с другими методами визуализации флуоресцентное окрашивание с помощью MSI и магнитно-резонансную томографию (МРТ) можно выделить с МРТ. Флуоресцентное окрашивание может дать информацию о внешнем виде некоторых белков, присутствующих в любом процессе внутри ткани, тогда как MSI может дать информацию о молекулярных изменениях, присутствующих в этом процессе. Объединив оба метода, можно создать мультимодальную картину или даже трехмерные изображения распределения различных молекул. [10] Напротив, МРТ с MSI сочетает в себе непрерывное трехмерное представление изображения МРТ с детальным структурным представлением с использованием молекулярной информации из MSI. Несмотря на то, что MSI сама может генерировать 3D-изображения, изображение является лишь частью реальности из-за ограничения глубины анализа, в то время как МРТ обеспечивает, например, подробную форму органа с дополнительной анатомической информацией. Этот совмещенный метод может быть полезен для точной диагностики рака и нейрохирургии. [10]

Обработка данных

[ редактировать ]

Стандартный формат данных для наборов данных масс-спектрометрической визуализации

[ редактировать ]

для Было предложено использовать imzML обмена данными в стандартизированном XML-файле на основе формата mzML . [18] Его поддерживают несколько программных средств MS для обработки изображений. Преимуществом этого формата является гибкость обмена данными между различными приборами и программным обеспечением для анализа данных. [19]

Программное обеспечение

[ редактировать ]

Существует множество бесплатных пакетов программного обеспечения для визуализации и анализа данных масс-спектрометрии. Конвертеры из формата Thermo Fisher, формата Analyse, формата GRD и формата Bruker в формат imzML были разработаны проектом Computis. Также доступны некоторые программные модули для просмотра масс-спектрометрических изображений в формате imzML: Biomap (Novartis, бесплатно), Datacube Explorer (AMOLF, бесплатно), [20] EasyMSI (CEA), Mirion (JLU), MSiReader (NCSU, бесплатно) [21] и спектральный анализ. [22]

Для обработки файлов .imzML с помощью бесплатного статистического и графического языка R доступен набор скриптов R, который позволяет параллельную обработку больших файлов на локальном компьютере, удаленном кластере или в облаке Amazon. [23]

Существует еще один бесплатный статистический пакет для обработки данных imzML и Analyse 7.5 в R — Cardinal. [24]

СПУТНИК [25] представляет собой пакет R, содержащий различные фильтры для удаления пиков, характеризующихся некоррелированным пространственным распределением с местоположением образца или пространственной случайностью .

Приложения

[ редактировать ]

Замечательная способность MSI — определять локализацию биомолекул в тканях, даже если ранее о них не было никакой информации. Эта особенность сделала MSI уникальным инструментом для клинических и фармакологических исследований. Он предоставляет информацию о биомолекулярных изменениях, связанных с заболеваниями, путем отслеживания белков, липидов и клеточного метаболизма. Например, идентификация биомаркеров с помощью MSI может показать детальную диагностику рака. Кроме того, можно получить недорогие изображения для фармацевтических исследований, например, изображения молекулярных сигнатур, которые будут указывать на ответ на лечение конкретным лекарством или эффективность конкретного метода доставки лекарства. [26] [27] [28]

Колокализация ионов изучалась как способ сделать вывод о локальных взаимодействиях между биомолекулами. Подобно колокализации при микроскопии , корреляция использовалась для количественной оценки сходства между ионными изображениями и создания сетевых моделей. [29]

Преимущества, проблемы и ограничения

[ редактировать ]

Основное преимущество MSI для изучения расположения и распределения молекул внутри ткани заключается в том, что этот анализ может обеспечить либо большую селективность, больше информации или большую точность, чем другие. Более того, этот инструмент требует меньших затрат времени и ресурсов для получения аналогичных результатов. [17] В таблице ниже показано сравнение преимуществ и недостатков некоторых доступных методов, включая MSI, в сопоставлении с анализом распределения лекарств. [5]

Сравнение преимуществ и недостатков методов оценки распространения наркотиков [5]
Методология Ответ на вопрос Преимущества Недостатки
Ауторадиография Где и сколько радиоактивности Очень высокое пространственное разрешение; надежное количественное определение Ex vivo; требуется препарат с радиоактивной меткой; не отличает препарат от метаболитов.
Иммуногистохимия Где Короткое время обработки; легкая интерпретация; недорогой Ex vivo; требуются антитела, которые различаются по чувствительности и специфичности; трудности с назначением; порог обнаружения; отсутствие стандартной системы подсчета очков
флуоресценция Где Возможно in vivo; разумная стоимость Не количественный; плохое разрешение; автофлуоресцентная интерференция
Позитронно-эмиссионная томография (ПЭТ) Где, что и деятельность Возможно in vivo; хорошее разрешение; возможность подключения к рентгеновской компьютерной томографии, гамма-камере Дорогой; короткоживущие изотопы; нужен циклотрон для производства изотопов
Когерентный антистокс

Комбинационное рассеяние

микроскопия (КАРС)

Где и что Без этикеток; субклеточное пространственное разрешение Не количественный; плохая селективность; высокий фоновый шум
Электрохимический атомный

силовая микроскопия (АСМ)

Где и что Визуализация без меток; высокое разрешение Не количественный; плохая воспроизводимость; высокий фон
МСИ Где и что Мультиплекс; визуализация без меток; хорошее пространственное разрешение Полуколичественный; эффекты ионного подавления; комплексный анализ

Примечания

[ редактировать ]
  1. ^ для сравнения: в 1 куб. см углерода (алмаза) содержится около 1,8 х 10 23 атомы. 10 12 до 10 16 соответствует от 6 частей на триллион (ppt) до 60 частей на миллиард (ppb).
  2. ^ чувствительность зависит от элемента (или молекулы), а также от природы анализируемой поверхности и условий анализа.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]

«Визуализация следов металлов в биологических системах», стр. 81–134, в «Металлы, микробы и минералы: биогеохимическая сторона жизни» (2021), стр. xiv + 341. Авторы Ю, Цзяо; Харанхедкар, Шефали; Набатилан, Ариэль; Фарни, Кристофер; Вальтер де Грюйтер, Берлин.Редакторы Кронек, Питер М.Х. и Соса Торрес, Марта. DOI 10.1515/9783110589771-004

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Монро Э., Аннангуди С., Хэтчер Н., Гутштейн Х., Рубахин С., Свидлер Дж. (2008). «SIMS и MADLI MS Визуализация спинного мозга» . Протеомика . 8 (18): 3746–3754. дои : 10.1002/pmic.200800127 . ПМК   2706659 . ПМИД   18712768 .
  2. ^ Перейти обратно: а б Сюздак, Гэри (сентябрь 2023 г.). «Субклеточная количественная визуализация метаболитов на уровне органелл» . Природный метаболизм . 5 (9): 1446–1448. дои : 10.1038/s42255-023-00882-z . ISSN   2522-5812 .
  3. ^ Ронер Т., Стааб Д., Стокли М. (2005). «Масс-спектрометрическая визуализация срезов биологических тканей MALDI». Механизмы старения и развития . 126 (1): 177–185. дои : 10.1016/j.mad.2004.09.032 . ПМИД   15610777 . S2CID   30982189 .
  4. ^ Перейти обратно: а б с д Макдоннелл Л.А., Хирен Р.М. (2007). «Визуализация масс-спектрометрии». Обзоры масс-спектрометрии . 26 (4): 606–43. Бибкод : 2007MSRv...26..606M . дои : 10.1002/mas.20124 . hdl : 1874/26394 . ПМИД   17471576 .
  5. ^ Перейти обратно: а б с Кобице, DF; Гудвин, RJA; Андрен, ЧП; Нильссон, А; Маккей, CL; Эндрю, Р. (01 июля 2015 г.). «Понимание технологий будущего: масс-спектрометрическая визуализация как инструмент исследования и разработки лекарств» . Британский журнал фармакологии . 172 (13): 3266–3283. дои : 10.1111/bph.13135 . ISSN   1476-5381 . ПМК   4500365 . ПМИД   25766375 .
  6. ^ Перейти обратно: а б Адди, Рубен Д.; Баллафф, Бенджамин; Бове, Джудит ВМГ; Морро, Ганс; Макдоннелл, Лиам А. (2015). «Текущее состояние и будущие проблемы масс-спектрометрической визуализации для клинических исследований». Аналитическая химия . 87 (13): 6426–6433. дои : 10.1021/acs.analchem.5b00416 . ПМИД   25803124 .
  7. ^ Перейти обратно: а б с Макдоннелл, Лиам А.; Хирен, Рон, Массачусетс (1 июля 2007 г.). «Визуализация масс-спектрометрии». Обзоры масс-спектрометрии . 26 (4): 606–643. Бибкод : 2007MSRv...26..606M . дои : 10.1002/mas.20124 . hdl : 1874/26394 . ISSN   1098-2787 . ПМИД   17471576 .
  8. ^ Амстальден Ван Хов Э., Смит Д., Хирен Р. (2010). «Краткий обзор масс-спектрометрической визуализации». Журнал хроматографии А. 1217 (25): 3946–3954. дои : 10.1016/j.chroma.2010.01.033 . ПМИД   20223463 .
  9. ^ Пеннер-Хан, Джеймс Э. (2013). «Глава 2. Технологии обнаружения металлов в одиночных клетках. Раздел 2.1. Масс-спектрометрия вторичных ионов». В Банки, Люсия (ред.). Металломика и клетка . Ионы металлов в науках о жизни. Том. 12. Спрингер. стр. 15–40. дои : 10.1007/978-94-007-5561-1_2 . ISBN  978-94-007-5560-4 . ПМИД   23595669 . электронная книга ISBN   978-94-007-5561-1 ISSN   1559-0836 электронный- ISSN   1868-0402
  10. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час Бодзон-Кулаковская, Анна; Судер, Петр (01 января 2016 г.). «Визуальная масс-спектрометрия: приборы, приложения и сочетание с другими методами визуализации». Обзоры масс-спектрометрии . 35 (1): 147–169. Бибкод : 2016MSRv...35..147B . дои : 10.1002/mas.21468 . ISSN   1098-2787 . ПМИД   25962625 .
  11. ^ Чабала Дж., Сони К., Ли Дж., Гавлиров К., Леви-Сетти Р. (1995). «Химическая визуализация высокого разрешения с помощью сканирующего ионного зонда SIMS». Международный журнал масс-спектрометрии и ионных процессов . 143 : 191–212. Бибкод : 1995IJMSI.143..191C . дои : 10.1016/0168-1176(94)04119-Р .
  12. ^ Анджело, Майкл; Бендалл, Шон С; Финк, Рэйчел; Хейл, Мэтью Б; Хитцман, Чак; Боровский, Александр Д; Левенсон, Ричард М; Лоу, Джон Б; Лю, Скот Д.; Чжао, Шучунь; Наткунам, Яшодха; Нолан, Гарри П. (2014). «Мультиплексная ионно-лучевая визуализация опухолей молочной железы человека» . Природная медицина . 20 (4): 436–442. дои : 10.1038/нм.3488 . ISSN   1078-8956 . ПМК   4110905 . ПМИД   24584119 .
  13. ^ Делкорт А., Бефаи С., Полеунис С., Тростерс М., Бертран П. «Улучшение адгезии металла к кремниевым пленкам: исследование ToF-SIMS». {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
  14. ^ Пауэрс, Томас В.; Нили, Бенджамин А.; Шао, Юань; Тан, Хуэйюань; Тройер, Дин А.; Мехта, Ананд С.; Хааб, Брайан Б.; Дрейк, Ричард Р. (2014). «Масс-спектрометрическое профилирование MALDI-визуализации N-гликанов в зафиксированных формалином парафиновых клинических тканевых блоках и тканевых микрочипах» . ПЛОС ОДИН . 9 (9): е106255. Бибкод : 2014PLoSO...9j6255P . дои : 10.1371/journal.pone.0106255 . ISSN   1932-6203 . ПМК   4153616 . ПМИД   25184632 .
  15. ^ Чауранд П., Норрис Дж.Л., Корнетт Д.С., Мобли Дж.А., Каприоли Р.М. (2006). «Новые разработки в области профилирования и визуализации белков из срезов тканей с помощью масс-спектрометрии MALDI». J. Протеом Рез . 5 (11): 2889–900. дои : 10.1021/pr060346u . ПМИД   17081040 .
  16. ^ Патель, Экта (1 января 2015 г.). «MALDI-MS визуализация для изучения тканевой фармакодинамики и токсикодинамики». Биоанализ . 7 (1): 91–101. дои : 10.4155/био.14.280 . ПМИД   25558938 .
  17. ^ Перейти обратно: а б Нильссон, Анна; Гудвин, Ричард Дж. А.; Шариатгорджи, Мохаммадреза; Валлианату, Феодосия; Уэбборн, Питер Дж. Х.; Андрен, Пер Э. (3 февраля 2015 г.). «Масс-спектрометрическая визуализация при разработке лекарств». Аналитическая химия . 87 (3): 1437–1455. дои : 10.1021/ac504734s . ISSN   0003-2700 . ПМИД   25526173 .
  18. ^ Шрамм, Торстен; Хестер, Зоя; Клинкерт, Иво; Оба, Жан-Пьер; Хирен, Рон, Массачусетс; Брюнель, Ален; Лапревот, Оливье; Десбенуа, Николя; Робб, Мари-Франс; Стокли, Маркус; Шпенглер, Бернхард (30 августа 2012 г.). «imzML — общий формат данных для гибкого обмена и обработки данных масс-спектрометрического изображения» . Журнал протеомики . 75 (16): 5106–5110. дои : 10.1016/j.jprot.2012.07.026 . ISSN   1876-7737 . ПМИД   22842151 . S2CID   25970597 .
  19. ^ А. Рёмпп; Т. Шрамм; А. Хестер; И. Клинкерт; Дж. П. Оба; РМА Херен; М. Стокли; Б. Шпенглер (2011). «Глава imzML: Язык разметки масс-спектрометрии для визуализации: общий формат данных для масс-спектрометрической визуализации при интеллектуальном анализе данных в протеомике: от стандартов к приложениям». Методы молекулярной биологии, Humana Press, Нью-Йорк . Том. 696. стр. 205–224.
  20. ^ Клинкерт, И.; Чухтай, К.; Эллис, СР; Хирен, RMA (2014). «Методы исследования и визуализации данных с полным разрешением для больших наборов данных масс-спектрометрических изображений 2D и 3D». Международный журнал масс-спектрометрии . 362 : 40–47. Бибкод : 2014IJMSp.362...40K . дои : 10.1016/j.ijms.2013.12.012 .
  21. ^ Робишо, Г.; Гаррард, КП; Барри, Дж.А.; Маддиман, округ Колумбия (2013). «MSiReader: интерфейс с открытым исходным кодом для просмотра и анализа файлов изображений MS с высоким разрешением на платформе Matlab» . Журнал Американского общества масс-спектрометрии . 24 (5): 718–721. Бибкод : 2013JASMS..24..718R . дои : 10.1007/s13361-013-0607-z . ПМК   3693088 . ПМИД   23536269 .
  22. ^ Гонка, AM; Палмер, AD; Декстер, А.; Стивен, RT; Стайлз, IB; Банч, Дж. (2016). «Спектральный анализ: программное обеспечение для масс» (PDF) . Аналитическая химия . 88 (19): 9451–9458. дои : 10.1021/acs.analchem.6b01643 . ПМИД   27558772 .
  23. ^ Гамбоа-Бесерра, Роберто; Рамирес-Чавес, Энрике; Молина-Торрес, Хорхе; Винклер, Роберт (01 июля 2015 г.). «Скрипты MSI.R выявляют летучие и полулетучие свойства при визуализации низкотемпературной плазменной масс-спектрометрии (LTP-MSI) перца чили (Capsicum annuum)». Аналитическая и биоаналитическая химия . 407 (19): 5673–5684. дои : 10.1007/s00216-015-8744-9 . ПМИД   26007697 . S2CID   22813369 .
  24. ^ Бемис, Кайл Д.; Гарри, апрель; Эберлин, Ливия С.; Феррейра, Кристина; ван де Вен, Стефани М.; Маллик, Параг; Столовиц, Марк; Витек, Ольга (15 марта 2015 г.). « Кардинал : пакет R для статистического анализа экспериментов по визуализации на основе масс-спектрометрии» . Биоинформатика . 31 (14): 2418–2420. doi : 10.1093/биоинформатика/btv146 . ПМЦ   4495298 . ПМИД   25777525 .
  25. ^ Инглезе, Паоло; Коррейя, Гонсалу; Такац, Золтан; Николсон, Джереми К.; Глен, Роберт С. (2018). «СПУТНИК: Пакет R для фильтрации пространственно связанных пиков в данных масс-спектрометрического изображения» . Биоинформатика . 35 (1): 178–180. doi : 10.1093/биоинформатика/bty622 . ПМК   6298046 . ПМИД   30010780 .
  26. ^ Суэйлс, Джон Г.; Хэмм, Грегори; Кленч, Малкольм Р.; Гудвин, Ричард Дж. А. (март 2019 г.). «Масс-спектрометрическая визуализация и ее применение в фармацевтических исследованиях и разработках: краткий обзор». Международный журнал масс-спектрометрии . 437 : 99–112. дои : 10.1016/j.ijms.2018.02.007 . ISSN   1387-3806 . S2CID   102892898 .
  27. ^ Адди, Рубен Д.; Баллафф, Бенджамин; Бове, Джудит ВМГ; Морро, Ганс; Макдоннелл, Лиам А. (7 июля 2015 г.). «Текущее состояние и будущие проблемы масс-спектрометрической визуализации для клинических исследований». Аналитическая химия . 87 (13): 6426–6433. дои : 10.1021/acs.analchem.5b00416 . ISSN   0003-2700 . ПМИД   25803124 .
  28. ^ Айхлер, Микаэла; Вальх, Аксель (апрель 2015 г.). «Масс-спектрометрия MALDI Imaging: современные рубежи и перспективы в исследованиях и практике патологии» . Лабораторное исследование . 95 (4): 422–431. дои : 10.1038/labinvest.2014.156 . ISSN   1530-0307 . ПМИД   25621874 .
  29. ^ Инглезе, Паоло; Стриттматтер, Николь; Дориа, Луиза; Мроз, Анна; Спеллер, Эбигейл; Пойнтер, Лиам; Даннхорн, Андреас; Кудо, Хироми; Мирнезами, Реза; Голдин, Роберт Д.; Николсон, Джереми К. (9 января 2018 г.). «Сетевой анализ данных масс-спектрометрической визуализации колоректального рака идентифицирует ключевые метаболиты, общие для развития метастазов» : 230052. doi : 10.1101/230052 . S2CID   90409488 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mass_spectrometry_imaging&oldid=1225778059"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: e2c57d21ff18ab8dc6a7776af5a52208__1716732720
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/e2/08/e2c57d21ff18ab8dc6a7776af5a52208.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Mass spectrometry imaging - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)