ARID5B

ARID5B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1IG6, 2OEH
Идентификаторы
Псевдонимы	ARID5B , DESRT, MRF-2, MRF2, домен взаимодействия 5B, богатый AT
Внешние идентификаторы	Опустить : 608538 ; МГИ : 2175912 ; Гомологен : 45872 ; GeneCards : ARID5B ; ОМА : ARID5B — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	62,096,944 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	68,114,570 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	beta cell; ; saphenous vein; ; pericardium; ; vena cava; ; urethra; ; parietal pleura; ; decidua; ; mucosa of urinary bladder; ; lactiferous duct; ; superficial temporal artery;
	Top expressed in
	zygote; ; left lung lobe; ; stroma of bone marrow; ; Paneth cell; ; ciliary body; ; secondary oocyte; ; decidua; ; ascending aorta; ; ureter; ; vas deferens;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription coactivator activity; protein binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; histone demethylase activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; liver development; negative regulation of transcription, DNA-templated; histone demethylation; kidney development; nitrogen compound metabolic process; male gonad development; female gonad development; post-embryonic development; fibroblast migration; adrenal gland development; multicellular organism growth; fat cell differentiation; platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; cell development; muscle organ morphogenesis; skeletal system morphogenesis; positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; roof of mouth development; face morphogenesis; adipose tissue development; fat pad development; cellular response to leukemia inhibitory factor; positive regulation of nucleic acid-templated transcription; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	84159
	71371
	ENSG00000150347
	ENSMUSG00000019947
	Q14865
	Q8BM75
	НМ_001244638 ; НМ_032199
	НМ_023598
	НП_001231567 ; НП_115575
	НП_076087
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 5B, содержащий интерактивный домен, богатый AT, представляет собой белок , который у человека кодируется ARID5B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Альтернативные названия этого гена включают фактор распознавания модулятора 23.

Геномика

Ген расположен на длинном плече хромосомы 10 (10q21.2) на «плюсовой» цепи. Его длина составляет 195 261 пару оснований. Он кодирует белок предсказанной длины и молекулярной массы 1188 аминокислот и 132,375 килодальтон соответственно.

Клиническое значение

С помощью полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) было замечено, что некоторые однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), расположенные в этом гене, в значительной степени связаны с восприимчивостью. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} а также результаты лечения ^{[ 11 ]} детского острого лимфобластного лейкоза в этнически разнообразных группах населения.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000150347 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019947 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лахуд М.Х., Ристевски С., Вентер Д.Д., Джермин Л.С., Бертончелло И., Заварсек С., Хасторп С., Драго Дж., де Крецер Д., Герцог П.Дж., Кола I (август 2001 г.). «Нацеливание на ген Desrt, нового ДНК-связывающего белка класса ARID, вызывает задержку роста и аномальное развитие репродуктивных органов» . Геномные исследования . 11 (8): 1327–34. дои : 10.1101/гр.168801 . hdl : 10536/DRO/DU:30121320 . ПМИД 11483573 .
^ Чжу Л., Ху Дж., Лин Д., Уитсон Р., Итакура К., Чен Ю. (август 2001 г.). «Динамика ДНК-связывающего домена Mrf-2 в свободном состоянии и в комплексе с ДНК». Биохимия . 40 (31): 9142–50. дои : 10.1021/bi010476a . ПМИД 11478881 .
^ «Ген Энтреза: ARID5B AT-богатый интерактивный домен 5B (MRF1-подобный)» .
^ Сюй Х., Ян В., Перес-Андреу В., Девидас М., Фань Ю., Ченг С. и др. (май 2013 г.). «Новые варианты восприимчивости 10p12.31-12.2 к детскому острому лимфобластному лейкозу в этнически разнообразных популяциях» . Журнал Национального института рака . 105 (10): 733–42. дои : 10.1093/jnci/djt042 . ПМК 3691938 . ПМИД 23512250 .
^ Тревиньо Л.Р., Ян В., Френч Д., Хунгер С.П., Кэрролл В.Л., Девидас М. и др. (сентябрь 2009 г.). «Геномные варианты зародышевой линии, связанные с острым лимфобластным лейкозом у детей» . Природная генетика . 41 (9): 1001–5. дои : 10.1038/ng.432 . ПМЦ 2762391 . ПМИД 19684603 .
^ Папэммануил Э., Хоскинг Ф.Дж., Виджаякришнан Дж., Прайс А., Олвер Б., Шеридан Э. и др. (сентябрь 2009 г.). «Локусы 7p12.2, 10q21.2 и 14q11.2 связаны с риском развития острого лимфобластного лейкоза у детей» . Природная генетика . 41 (9): 1006–10. дои : 10.1038/ng.430 . ПМЦ 4915548 . ПМИД 19684604 .
^ Сюй Х., Ченг С., Девидас М., Пей Д., Фань Ю., Ян В. и др. (март 2012 г.). «Генетические полиморфизмы ARID5B способствуют расовым различиям в заболеваемости и результатах лечения детского острого лимфобластного лейкоза» . Журнал клинической онкологии . 30 (7): 751–7. дои : 10.1200/JCO.2011.38.0345 . ПМЦ 3295551 . ПМИД 22291082 .

Внешние ссылки

человека ARID5B Расположение генома ARID5B и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Юань Ю.К., Уитсон Р.Х., Лю Ц, Итакура К., Чен Ю (ноябрь 1998 г.). «Новый ДНК-связывающий мотив имеет структурную гомологию с нуклеазами репликации и восстановления ДНК и полимеразами». Структурная биология природы . 5 (11): 959–64. дои : 10.1038/2934 . ПМИД 9808040 . S2CID 10099806 .
Уитсон Р.Х., Хуан Т., Итакура К. (май 1999 г.). «Новый ДНК-связывающий домен Mrf-2 распознает основную последовательность из пяти оснований посредством контактов большой и малой канавок». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 258 (2): 326–31. дои : 10.1006/bbrc.1999.0643 . ПМИД 10329386 .
Патсиалу А., Вилскер Д., Моран Э. (2005). «ДНК-связывающие свойства белков семейства ARID» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (1): 66–80. дои : 10.1093/nar/gki145 . ПМК 546134 . ПМИД 15640446 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 10 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000150347 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019947 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11483573-5] Лахуд М.Х., Ристевски С., Вентер Д.Д., Джермин Л.С., Бертончелло И., Заварсек С., Хасторп С., Драго Дж., де Крецер Д., Герцог П.Дж., Кола I (август 2001 г.). «Нацеливание на ген Desrt, нового ДНК-связывающего белка класса ARID, вызывает задержку роста и аномальное развитие репродуктивных органов» . Геномные исследования . 11 (8): 1327–34. дои : 10.1101/гр.168801 . hdl : 10536/DRO/DU:30121320 . ПМИД 11483573 .

[pmid11478881-6] Чжу Л., Ху Дж., Лин Д., Уитсон Р., Итакура К., Чен Ю. (август 2001 г.). «Динамика ДНК-связывающего домена Mrf-2 в свободном состоянии и в комплексе с ДНК». Биохимия . 40 (31): 9142–50. дои : 10.1021/bi010476a . ПМИД 11478881 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: ARID5B AT-богатый интерактивный домен 5B (MRF1-подобный)» .

[8] Сюй Х., Ян В., Перес-Андреу В., Девидас М., Фань Ю., Ченг С. и др. (май 2013 г.). «Новые варианты восприимчивости 10p12.31-12.2 к детскому острому лимфобластному лейкозу в этнически разнообразных популяциях» . Журнал Национального института рака . 105 (10): 733–42. дои : 10.1093/jnci/djt042 . ПМК 3691938 . ПМИД 23512250 .

[9] Тревиньо Л.Р., Ян В., Френч Д., Хунгер С.П., Кэрролл В.Л., Девидас М. и др. (сентябрь 2009 г.). «Геномные варианты зародышевой линии, связанные с острым лимфобластным лейкозом у детей» . Природная генетика . 41 (9): 1001–5. дои : 10.1038/ng.432 . ПМЦ 2762391 . ПМИД 19684603 .

[10] Папэммануил Э., Хоскинг Ф.Дж., Виджаякришнан Дж., Прайс А., Олвер Б., Шеридан Э. и др. (сентябрь 2009 г.). «Локусы 7p12.2, 10q21.2 и 14q11.2 связаны с риском развития острого лимфобластного лейкоза у детей» . Природная генетика . 41 (9): 1006–10. дои : 10.1038/ng.430 . ПМЦ 4915548 . ПМИД 19684604 .

[11] Сюй Х., Ченг С., Девидас М., Пей Д., Фань Ю., Ян В. и др. (март 2012 г.). «Генетические полиморфизмы ARID5B способствуют расовым различиям в заболеваемости и результатах лечения детского острого лимфобластного лейкоза» . Журнал клинической онкологии . 30 (7): 751–7. дои : 10.1200/JCO.2011.38.0345 . ПМЦ 3295551 . ПМИД 22291082 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]