Pacer (белок)

Rubcnl
Идентификаторы
Псевдонимы	Rubcnl , C13orf18, KIAA0226L, KIAA0226-подобное, KIAA0226, как, run, и богатый цистеином домен, содержащий Beclin 1 взаимодействующий белок, Pacer, Рубикон, как регулятор аутофагии, Рубикон, как энхаранц аутофагии, Pacer, Рубикон, как регулятор аутофагии, Рубикон, подобный энханцеру с аутофагией, Pacer, Rubicon
Внешние идентификаторы	MGI : 2685590 ; Гомологен : 57021 ; GeneCards : Rubcnl ; OMA : rubcnl - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	46,438,190 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	75,289,972 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	periodontal fiber; ; blood; ; spleen; ; sperm; ; appendix; ; lymph node; ; rectum; ; epithelium of nasopharynx; ; mucosa of sigmoid colon; ; bone marrow;
	Top expressed in
	spleen; ; granulocyte; ; bone marrow; ; primary oocyte; ; secondary oocyte; ; zygote; ; adrenal gland; ; islet of Langerhans; ; embryo; ; thymus;
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	80183
	271221
	ENSG00000102445
	Ensmusg00000034959
	Q9H714
	Q3TD16
showNM_025113 ; NM_001286761 ; NM_001286762 ; NM_001286763 ; NM_001286764 ;
	NM_001286765; NM_001286766; NM_001349772
	NM_198642 ; NM_001374214
showNP_001273690 ; NP_001273691 ; NP_001273692 ; NP_001273693 ; NP_001273694 ;
	NP_001273695; NP_079389; NP_001336701
	NP_941044 ; NP_001361143
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Pacer (также известный как Rubicon-подобный)-это белок , который у людей кодируется геном Rubcnl . ^{[ 5 ]} Было показано, что PACER увеличивает клеточную аутофагию посредством регуляции PI3KC3 . ^{[ 6 ]}

Pacer содержит домен гомологии Rubicon (RH) на его C-конце, который опосредует связывание с небольшим GTPase Rab7, когда Rab7 фосфорилируется после повреждения митохондрий ^{[ 7 ]}. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Этот домен разделен с RH Domain, содержащей членов семьи , Rubicon и Plekhm1 . ^{[ 10 ]} В то время как PACER, по -видимому, повышает аутофагическую активность, Rubicon является негативным регулятором аутофагии . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000102445 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000034959 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Rubcnl - белок, связанный с UVRAG как энхансер аутофагии - Homo sapiens (Human) - Rubcnl Gene & Protein» . www.uniprot.org . Получено 2022-05-31 .
^ Cheng X, Ma X, Ding X, Li L, Jiang X, Shen Z, et al. (Март 2017). «Pacer обеспечивает функцию комплексов PI3K класса III и хмеля в созревании аутофагосом путем привлечения STX17» . Молекулярная клетка . 65 (6): 1029–1043.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.02.010 . PMID 28306502 .
^ Tuuroka Da, Basak B, Puerta Cordova AS, Khuu G, Rose K, Al. (Июль 2024 г.). Rab7a Phosphoswitch координация Журнал клеточной биологии 223 (7). doi : 10.1083/ jcb.202309015 11090050PMC PMID 38728007 .
^ «Rubcnl - белок, связанный с UVRAG как энхансер аутофагии - Homo sapiens (Human) - Rubcnl Gene & Protein» . www.uniprot.org . Получено 2022-05-31 .
^ Bhargava HK, Tabata K, Byck JM, Hamasaki M, Farrell DP, Anishchenko I, et al. (Июль 2020 г.). «Структурная основа для ингибирования аутофагии человека Rubicon-Rab7 Complex» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (29): 17003–17010. Bibcode : 2020pnas..11717003b . doi : 10.1073/pnas.2008030117 . PMC 7382272 . PMID 32632011 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Beltran S, Nassif M, Vicencio E, Arcos J, Labrador L, Cortes Bi, et al. (Март 2019). «Сетевой подход идентифицирует PACER как белок аутофагии, участвующий в патогенезе ALS» . Молекулярная нейродегенерация . 14 (1): 14. doi : 10.1186/s13024-019-0313-9 . PMC 6437924 . PMID 30917850 .

Дальнейшее чтение

Ng D, Hu N, Hu Y, Wang C, Giffen C, Tang ZZ, et al. (Октябрь 2008 г.). «Репликация общегеномного исследования сквамозного рака пищевода пищевода» . Международный журнал рака . 123 (7): 1610–1615. doi : 10.1002/ijc.23682 . PMC 2552411 . PMID 18649358 .
Кронин С., Томик Б., Брэдли Д.Г., Струйство А., Хардиман О (февраль 2009 г.). «Скрининг на репликацию ассоциаций SNP по всему геному в спорадических ALS» . Европейский журнал человеческой генетики . 17 (2): 213–218. doi : 10.1038/ejhg.2008.194 . PMC 2986065 . PMID 18987618 .
Yang N, Eijsink JJ, Lendvai A, Volders HH, Klip H, Buikema HJ, et al. (Ноябрь 2009 г.). «Маркеры метилирования для CCNA1 и C13ORF18 тесно связаны с высококлассной интраэпителиальной неоплазией шейки матки и раком шейки матки при соскобах шейки матки» . Эпидемиология рака, биомаркеры и профилактика . 18 (11): 3000–3007. doi : 10.1158/1055-9965.EPI-09-0405 . PMID 19843677 .
Eijsink JJ, Lendvai A, Deregowski V, Klip HG, Verpooten G, Dehaspe L, et al. (Апрель 2012 г.). «Панель метилирования с четырьмя генами в качестве теста на сортировку у пациентов с папилломавирусом человека высокого риска» . Международный журнал рака . 130 (8): 1861–1869. doi : 10.1002/ijc.26326 . PMID 21796628 . S2CID 35295117 .
Husman C, Wisman GB, Kazemier HG, Van Vugt MA, Van Der Ze AG, Stuaring E, et al. (Июнь 2013 г.). «Функциональная проверка предполагаемого гена супрессора опухоли C13ORF18 при раке шейки матки с помощью искусственных факторов транскрипции » Молекулярная онкология 7 (3): 669–6 Doi : 10.1016/ j.molonc.2013.02.0 5528488PMC 23522960PMID

Эта статья о гене о хромосоме человека 13 представляет собой заглушку . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000102445 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000034959 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] «Rubcnl - белок, связанный с UVRAG как энхансер аутофагии - Homo sapiens (Human) - Rubcnl Gene & Protein» . www.uniprot.org . Получено 2022-05-31 .

[6] Cheng X, Ma X, Ding X, Li L, Jiang X, Shen Z, et al. (Март 2017). «Pacer обеспечивает функцию комплексов PI3K класса III и хмеля в созревании аутофагосом путем привлечения STX17» . Молекулярная клетка . 65 (6): 1029–1043.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.02.010 . PMID 28306502 .

[7] Tuuroka Da, Basak B, Puerta Cordova AS, Khuu G, Rose K, Al. (Июль 2024 г.). Rab7a Phosphoswitch координация Журнал клеточной биологии 223 (7). doi : 10.1083/ jcb.202309015 11090050PMC PMID 38728007 .

[8] «Rubcnl - белок, связанный с UVRAG как энхансер аутофагии - Homo sapiens (Human) - Rubcnl Gene & Protein» . www.uniprot.org . Получено 2022-05-31 .

[9] Bhargava HK, Tabata K, Byck JM, Hamasaki M, Farrell DP, Anishchenko I, et al. (Июль 2020 г.). «Структурная основа для ингибирования аутофагии человека Rubicon-Rab7 Complex» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (29): 17003–17010. Bibcode : 2020pnas..11717003b . doi : 10.1073/pnas.2008030117 . PMC 7382272 . PMID 32632011 .

[:0-10] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Beltran S, Nassif M, Vicencio E, Arcos J, Labrador L, Cortes Bi, et al. (Март 2019). «Сетевой подход идентифицирует PACER как белок аутофагии, участвующий в патогенезе ALS» . Молекулярная нейродегенерация . 14 (1): 14. doi : 10.1186/s13024-019-0313-9 . PMC 6437924 . PMID 30917850 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]