Defb106a

Defb106a
Доступные структуры
PDB	Поиск UNIPROT человека: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2LWL
Идентификаторы
Псевдонимы	Defb106a , bd-6, defb-6, defb106, defensin beta 106a
Внешние идентификаторы	Гомологен : 134659 ; GeneCards : defb106a ; OMA : defb106a - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	7,829,053 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	liver; ; cell; ; somatic cell; ; white blood cell; ; monocyte; ; blood; ; human musculoskeletal system; ; right lobe of liver; ; skeletal muscle; ; muscle of leg;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	lipopolysaccharide binding; heparin binding; protein binding; CCR2 chemokine receptor binding;
Cellular component	extracellular region; nucleus; cell surface; extrinsic component of membrane; microvesicle; membrane;
Biological process	defense response; defense response to bacterium; innate immune response;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	245909
	n/a
	ENSG00000186579 ; ENSG00000285617
	n/a
	Q8N104
	n/a
	NM_152251
	n/a
	NP_689464
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека

Бета-дефенсин 106 -это белок , который у людей кодируется DEFB106A геном . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Дефенсины образуют семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, изготовленных нейтрофилами. Дефенсины представляют собой короткие обработанные пептидные молекулы, которые классифицируются по структуре на три группы: альфа-дефенсины , бета-дефенсины и тета-дефенсины. Все бета-дефенсиновые гены плотно кластеризованы в четырех-пяти синенических хромосомных областях. Хромосома 8p23 содержит как минимум две копии дублированного бета-дефенсинового кластера. Это дублирование приводит к двум идентичным копиям защиты, бета 106, DEFB106A и DEFB106B, в ориентации на голову. Этот ген DEFB106A представляет более центромерную копию. ^{[ 4 ]}

Функция

Очищенный DEFB106 показал антимикробную активность против Escherichia coli , Candida albicans и Staphylococcus aureus . ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000285617 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000186579, ENSG00000285617 - ENSEMBL , май 2017
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, JIA HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB JR (февраль 2002 г.). «Открытие пяти консервативных бета -дефенсиновых генов с использованием стратегии вычислительного поиска» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (4): 2129–33. Bibcode : 2002pnas ... 99.2129S . doi : 10.1073/pnas.042692699 . PMC 122330 . PMID 11854508 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Defb106a Defensin, бета 106a" .
^ Синь А (январь 2014). «Растворимая экспрессия слияния, характеристика и локализация β-дефенсина 6 ...» Mol Med Rep . 9 (1): 149–55. doi : 10.3892/mmr.2013.1768 . PMID 24189797 .

Дальнейшее чтение

Yamaguchi Y, Nagase T, Makita R, et al. (2002). «Идентификация множества новых изоформ бета-дефенсина, специфичных для эпидидимиса у людей и мышей» . J. Immunol . 169 (5): 2516–23. doi : 10.4049/jimmunol.169.5.2516 . PMID 12193721 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Као Сай, Чен Ю., Чжао Й.Х., Ву Р. (2003). «Поиск на основе Orfeome в эпителиальных клетках, специфичных для эпителиальных клеток, генов человека [бета]-дефенсина человека». Являюсь. J. Respir. Клеточный мол. Биол . 29 (1): 71–80. Citeseerx 10.1.1.108.7808 . doi : 10.1165/rcmb.2002-0205oc . PMID 12600824 .
Semple CA, Rolfe M, Dorin Jr (2003). «Дублирование и отбор в эволюции приматов бета-дефенсиновых генов» . Геном биол . 4 (5): R31. doi : 10.1186/gb-2003-4-5-r31 . PMC 156587 . PMID 12734011 .
Hollox EJ, Armor JA, Barber JC (2003). «Обширное изменение нормального числа копий бета-дефенсина кластера антимикробного гена» . Являюсь. J. Hum. Генет . 73 (3): 591–600. doi : 10.1086/378157 . PMC 1180683 . PMID 12916016 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Taudien S, Galgoczy P, Huse K, et al. (2006). «Полиморфные сегментарные дупликации при 8P23.1 оспаривают определение отдельного репертуара генов дефенсина и сборки смежной эталонной последовательности человека» . BMC Genomics . 5 (1): 92. doi : 10.1186/1471-2164-5-92 . PMC 544879 . PMID 15588320 .
Boniotto M, Ventura M, Eskdale J, et al. (2005). «Доказательства дублирования гена дефенсина человека DEFB4 в хромосомной области 8P22-23 и последствия для анализа распределения аллелей SNP». Генет. Тест . 8 (3): 325–7. doi : 10.1089/gte.2004.8.325 . PMID 15727258 .
Patil AA, Cai Y, Sang Y, et al. (2006). «Межвидовая анализ семейства генов бета-дефенсина млекопитающих: наличие синтенных генов и преимущественная экспрессия в мужском репродуктивном тракте». Физиол. Геномика . 23 (1): 5–17. doi : 10.1152/physiolgenomics.00104.2005 . PMID 16033865 . S2CID 22355626 .

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000285617 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000186579, ENSG00000285617 - ENSEMBL , май 2017

[2] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid11854508-3] Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, JIA HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB JR (февраль 2002 г.). «Открытие пяти консервативных бета -дефенсиновых генов с использованием стратегии вычислительного поиска» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (4): 2129–33. Bibcode : 2002pnas ... 99.2129S . doi : 10.1073/pnas.042692699 . PMC 122330 . PMID 11854508 .

[entrez-4] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Defb106a Defensin, бета 106a" .

[pmid_=_24189797-5] Синь А (январь 2014). «Растворимая экспрессия слияния, характеристика и локализация β-дефенсина 6 ...» Mol Med Rep . 9 (1): 149–55. doi : 10.3892/mmr.2013.1768 . PMID 24189797 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]