TFB1M

TFB1M
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4GC5, 4GC9
Идентификаторы
Псевдонимы	TFB1M , CGI75, MTTFB, MTTFB1, CGI-75, Транскрипционный фактор B1, митохондриальность
Внешние идентификаторы	Омим : 607033 ; MGI : 2146851 ; Гомологен : 9343 ; GeneCards : TFB1M ; OMA : TFB1M - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	155,314,493 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	3,608,056 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; left testis; ; right testis; ; right lobe of liver; ; testicle; ; Achilles tendon; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	lumbar spinal ganglion; ; primary oocyte; ; seminiferous tubule; ; zygote; ; Paneth cell; ; lacrimal gland; ; endocardial cushion; ; secondary oocyte; ; left lobe of liver; ; atrioventricular junction;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	methyltransferase activity; transferase activity; DNA binding; rRNA methyltransferase activity; protein binding; rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity; RNA binding;
Cellular component	mitochondrial matrix; mitochondrial nucleoid; mitochondrion;
Biological process	rRNA processing; methylation; mitochondrion organization; regulation of transcription, DNA-templated; rRNA methylation; transcription, DNA-templated; rRNA modification;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51106
	224481
	ENSG00000029639
	Ensmusg00000036983
	Q8WW0
	Q8JZM0
	NM_016020 ; NM_001350501 ; NM_001350502
	NM_146074
	NP_057104 ; NP_001337430 ; NP_001337431
	NP_666186
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Диметиладенозин -трансфераза 1, митохондрия; Фактор транскрипции B1, митохондриальный - это митохондриальный фермент , который кодируется TFB1M геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

TFB1M представляет собой митохондриальную метилтрансферазу, которая использует S-аденозилметионин для диметилирования двух высококонсервативных остатков аденозина в 3'-конце митохондриальной RRNA , тем самым регулируя сборку или стабильность небольшой субъединицы митохондриальной рибосомы. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Кроме того, было продемонстрировано, что TFB1M стимулирует транскрипцию из матриц промотора в системе in vitro, содержащей рекомбинантную митохондриальную РНК -полимеразу и TFAM . ^{[ 10 ]} Нет экспериментальных данных, демонстрирующих, что эта функция происходит in vivo ; Паралог TFB2M является более специфичным для этой роли. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TFB1M взаимодействует с TFAM . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000029639 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036983 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Lai CH, Chou Cy, Chang Ly, Liu CS, Lin W (август 2000). «Идентификация новых генов человека эволюционно консервативно сохранена у Caenorhabditis elegans по сравнительной протеомике» . Геном Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} McCulloch V, Seidel-Rogol BL, Shadel GS (январь 2002 г.). «Митохондриальный фактор транскрипции человека связан с РНК-аденин-метилтрансферазами и связывает S-аденозилметионин» . Мол -клеточная биол . 22 (4): 1116–25. doi : 10.1128/mcb.22.4.1116-1125.2002 . PMC 134642 . PMID 11809803 .
^ «Ген Entrez: TFB1M Транскрипционный фактор B1, митохондрия» .
^ Falkenberg M , Gaspari M, Rantanen A, et al. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». НАТ Генет . 31 (3): 289–94. doi : 10.1038/ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .
^ Metodiev MD; Леско Н; Парк CB; Камара Y.; Shi Y.; Wibom R.; Hultenby K.; Густафссон К.М.; Ларссон Нг. (Апрель 2009 г.). «Метилирование 12S рРНК необходимо для стабильности in vivo небольшой субъединицы митохондриальной рибосомы млекопитающих» . Клеточная метаба . 9 (4): 386–97. doi : 10.1016/j.cmet.2009.03.001 . PMID 19356719 .
^ Falkenberg M, Gaspari M, Rantanen A, et al. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». НАТ Генет . 31 (3): 289–94. doi : 10.1038/ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .
^ Хиллен, HS; Морозов, Yi; Sarfallah, a; Темаков, D; Cramer, P (16 ноября 2017 г.). «Структурная основа инициации транскрипции митохондриальной транскрипции» . Клетка . 171 (5): 1072–1081.e10. doi : 10.1016/j.cell.2017.10.036 . PMC 6590061 . PMID 29149603 .
^ МакКаллох, Вики; Шалле Джеральд S (август 2003 г.). «Митохондриальный транскрипционный фактор человеческого транскрипции B1 взаимодействует с областью C-концевой активации H-MTTFA и стимулирует транскрипцию независимо от ее активности метилтрансферазы РНК» . Мол Клетка. Биол . 23 (16): 5816–24. doi : 10.1128/mcb.23.16.5816-5824.2003 . ISSN 0270-7306 . PMC 166325 . PMID 12897151 .

Дальнейшее чтение

Falkenberg M, Gaspari M, Rantanen A, et al. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». НАТ Генет . 31 (3): 289–94. doi : 10.1038/ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Seidel-Rogol BL, McCulloch V, Shadel GS (2003). «Человеческий митохондриальный транскрипционный фактор B1 метилирует рибосомную РНК в консервативной петле ствола». НАТ Генет . 33 (1): 23–4. doi : 10.1038/ng1064 . PMID 12496758 . S2CID 169443 .
Rantanen A, Gaspari M, Falkenberg M, et al. (2003). «Характеристика генов мыши для факторов транскрипции митохондрий B1 и B2». Мамм. Геном . 14 (1): 1–6. doi : 10.1007/s00335-002-2218-z . PMID 12532263 . S2CID 25379746 .
McCulloch V, Shadel GS (2003). «Митохондриальный транскрипционный фактор человеческого транскрипции B1 взаимодействует с областью C-концевой активации H-MTTFA и стимулирует транскрипцию независимо от ее активности метилтрансферазы РНК» . Мол Клетка. Биол . 23 (16): 5816–24. doi : 10.1128/mcb.23.16.5816-5824.2003 . PMC 166325 . PMID 12897151 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 6» . Природа . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003natur.425..805m . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .
Bykhovskaya Y, Mengesha E, Wang D, et al. (2004). «Человеческий митохондриальный транскрипционный фактор B1 в качестве гена модификатора для потери слуха, связанной с митохондриальной мутацией A1555G». Мол Генет. Метаб . 82 (1): 27–32. doi : 10.1016/j.ymgme.2004.01.020 . PMID 15110318 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Gleyzer N, Vercauteren K, Scarpulla RC (2005). «Контроль факторов специфичности транскрипции митохондриальной транскрипции (TFB1M и TFB2M) с помощью ядерных респираторных факторов (NRF-1 и NRF-2) и коактиваторы семейства PGC-1» . Мол Клетка. Биол . 25 (4): 1354–66. doi : 10.1128/mcb.25.4.1354-1366.2005 . PMC 548005 . PMID 15684387 .
Котни Дж., Ван З., Шадель Г.С. (2007). «Относительная изобилие митохондриальной системы транскрипции человека и отдельные роли для H-MTTFB1 и H-MTTFB2 в митохондриальном биогенезе и экспрессии генов» . Нуклеиновые кислоты Res . 35 (12): 4042–54. doi : 10.1093/nar/gkm424 . PMC 1919481 . PMID 17557812 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 6 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000029639 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036983 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10810093-5] Lai CH, Chou Cy, Chang Ly, Liu CS, Lin W (август 2000). «Идентификация новых генов человека эволюционно консервативно сохранена у Caenorhabditis elegans по сравнительной протеомике» . Геном Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .

[pmid11809803-6] Jump up to: ^а ^{беременный} McCulloch V, Seidel-Rogol BL, Shadel GS (январь 2002 г.). «Митохондриальный фактор транскрипции человека связан с РНК-аденин-метилтрансферазами и связывает S-аденозилметионин» . Мол -клеточная биол . 22 (4): 1116–25. doi : 10.1128/mcb.22.4.1116-1125.2002 . PMC 134642 . PMID 11809803 .

[entrez-7] «Ген Entrez: TFB1M Транскрипционный фактор B1, митохондрия» .

[pmid12068295-8] Falkenberg M , Gaspari M, Rantanen A, et al. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». НАТ Генет . 31 (3): 289–94. doi : 10.1038/ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .

[pmid19356719-9] Metodiev MD; Леско Н; Парк CB; Камара Y.; Shi Y.; Wibom R.; Hultenby K.; Густафссон К.М.; Ларссон Нг. (Апрель 2009 г.). «Метилирование 12S рРНК необходимо для стабильности in vivo небольшой субъединицы митохондриальной рибосомы млекопитающих» . Клеточная метаба . 9 (4): 386–97. doi : 10.1016/j.cmet.2009.03.001 . PMID 19356719 .

[renamed_from_12068295_on_20140118095224-10] Falkenberg M, Gaspari M, Rantanen A, et al. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». НАТ Генет . 31 (3): 289–94. doi : 10.1038/ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .

[polrmt-11] Хиллен, HS; Морозов, Yi; Sarfallah, a; Темаков, D; Cramer, P (16 ноября 2017 г.). «Структурная основа инициации транскрипции митохондриальной транскрипции» . Клетка . 171 (5): 1072–1081.e10. doi : 10.1016/j.cell.2017.10.036 . PMC 6590061 . PMID 29149603 .

[pmid12897151-12] МакКаллох, Вики; Шалле Джеральд S (август 2003 г.). «Митохондриальный транскрипционный фактор человеческого транскрипции B1 взаимодействует с областью C-концевой активации H-MTTFA и стимулирует транскрипцию независимо от ее активности метилтрансферазы РНК» . Мол Клетка. Биол . 23 (16): 5816–24. doi : 10.1128/mcb.23.16.5816-5824.2003 . ISSN 0270-7306 . PMC 166325 . PMID 12897151 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]