Интерфером
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | база данных интерфероном генов, регулируемых |
| Организмы | Мудрый человек Мускулистые мышцы Пан-троглодиты |
| Контакт | |
| Лаборатория | Институт медицинских исследований Монаша Кембриджский университет |
| Первичное цитирование | Шамит А. Самараджива и др. (2009) [1] |
| Дата выпуска | 2008 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://www.interferome.org |
Интерфером — это онлайн- биоинформационная база данных генов, регулируемых интерфероном (IRG). [1] Эти гены, регулируемые интерфероном, также известны как гены, стимулируемые интерфероном (ISG). База данных содержит информацию о генах, регулируемых типом I (ИФН-альфа, бета), типом II (ИФН-гамма) и типом III (ИФН-лямбда) и регулярно обновляется. Он используется интерферона и цитокинов. сообществом исследователей [2] как инструмент анализа и информационный ресурс. Интерфероны были идентифицированы как противовирусные белки более 50 лет назад. Однако их участие в иммуномодуляции , пролиферации клеток , воспалении и других гомеостатических с тех пор было выявлено процессах. Эти цитокины используются в качестве терапевтических средств при многих заболеваниях, таких как хронические вирусные инфекции, рак и рассеянный склероз . [3] Эти интерфероны регулируют транскрипцию примерно 2000 генов в зависимости от подтипа интерферона, дозы, типа клеток и стимула. Эта база данных генов, регулируемых интерфероном, представляет собой попытку объединить информацию из высокопроизводительных экспериментов и баз данных молекулярной биологии для получения детального понимания биологии интерферона.
Содержание
[ редактировать ]Интерфером включает в себя следующие наборы данных:
- Данные об экспрессии генов, регулируемых интерфероном, у Homo sapiens , Mus musculus и Pan troglodytes , отобранных вручную из более чем 30 общедоступных и собственных наборов микрочипов и протеомных данных.
Инструменты
[ редактировать ]Interferome предлагает множество способов поиска и получения данных из базы данных:
- Идентифицировать сигнатуры генов, регулируемых интерфероном, в данных микрочипов;
- генной онтологии ; Анализ и аннотация
- Нормальная тканевая экспрессия генов, регулируемых интерфероном;
- Регуляторный анализ генов, регулируемых интерфероном;
- Анализ BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) и загрузка ортологической последовательности;
Управление интерферомом
[ редактировать ]Интерфером управляется командой Университета Монаша : Института медицинских исследований Монаша и Кембриджского университета.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Самараджива, Шамит А; Форстер Сэм; Очеттль Кэти; Герцог Пол Дж (январь 2009 г.). «ИНТЕРФЕРОМ: база данных генов, регулируемых интерфероном» . Нуклеиновые кислоты Рез . 37 (Проблема с базой данных). Англия: D852-7. дои : 10.1093/нар/gkn732 . ПМК 2686605 . ПМИД 18996892 .
- ^ "Дом" . isicr.org .
- ^ «О раке» . 30 августа 2017 г.