РАБ11ФИП5
| РАБ11ФИП5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | RAB11FIP5 , GAF1, RIP11, pp75, белок 5, взаимодействующий с семейством RAB11, rab11-FIP5, gaf-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 605536 ; МГИ : 1098586 ; Гомологен : 9158 ; Генные карты : RAB11FIP5 ; ОМА : RAB11FIP5 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок 5, взаимодействующий с семейством Rab11, представляет собой белок , который у человека кодируется RAB11FIP5 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что RAB11FIP5 взаимодействует с RAB11A. [ 6 ] [ 8 ] [ 9 ] и РАБ25 . [ 8 ] [ 9 ]
Торговля везикулами
[ редактировать ]Rab11FIP5 — один из многих белков, которые, как было показано, взаимодействуют с белком Rab11. [ 8 ] Rab-ГТФазы, такие как Rab11, представляют собой ферменты, участвующие в везикулярном транспорте. Rab11, в частности, играет ключевую роль в транспортировке и рециркуляции эндоцитов, направляя ранние эндосомы к комплексам рециркуляции эндосом. [ 10 ] Rab11FIP5, как и большинство других белков Rab11FIP, взаимодействует с Rab11, выступая в качестве адаптерного белка. Это приводит к последующим изменениям в отношении того, какие белки могут взаимодействовать. Это результат того, что различные белки Rab11FIP имеют разных партнеров по связыванию. Этот процесс обеспечивает координацию и организацию эндосомального транспорта и в конечном итоге обеспечивает Rab11 его универсальную функцию в клетке. [ 10 ] Считается, что Rab11 рекрутирует специфические белки Rab11FIP на поверхность везикул, чтобы определить, как везикула будет вести себя. [ 11 ]
Исследования показали, что Rab11FIP5 локализуется в перинуклеарных эндосомах, где помогает сортировать везикул по пути медленной переработки. [ 11 ] Этот процесс включает транспорт белков-грузов, таких как эндоцитированные рецепторы, к комплексам рециркуляции эндосом, а затем к плазматической мембране. Это контрастирует с быстрым конститутивным путем рециркуляции, который обеспечивает прямой транспорт груза от эндосомы к плазматической мембране. [ 11 ] Rab11FIP5 помогает в этом процессе сортировки, связываясь с кинезином II и образуя белковый комплекс для регуляции везикулярного транспорта. Некоторые из белков, которые регулируются посредством Rab11FIP5-опосредованного транспорта везикул, представляют собой белки микротрубочек и рецептор TfR. Это связывает функциональность Rab11FIP5 с клеточным цитоскелетом и поглощением железа клеткой соответственно. [ 11 ]
Другие функции
[ редактировать ]Было показано, что Rab11FIP5 играет роль в нервной системе, поскольку он функционирует в нейронах. Исследования показали, что Rab11FIP5 участвует в регуляции локализации постсинаптического глутаматного рецептора АМРА-типа. Рецептор AMPA — это возбуждающий рецептор, который можно найти на плазматических мембранах нейронов. Исследования показали, что мыши с нокаутом гена Rab11FIP5 страдают тяжелой долгосрочной депрессией нейронов. Предполагается, что без присутствия Rab11FIP5 интернализованные рецепторы AMPA не могут быть возвращены обратно на плазматическую мембрану, поскольку рецепторы не могут быть правильно перенесены во внутриклеточные органеллы, ответственные за рециркуляцию. [ 12 ]
Rab11FIP5 также участвует в создании полярности ткани во время развития. Было показано, что Rab11FIP5 участвует в транспортировке пузырьков и деградации белков, используемых для координации эмбрионального развития. Это проводится таким образом, что помогает поддерживать полярность эктодермы у эмбриональной дрозофилы. [ 13 ]
Предполагается также, что Rab11FIP5 участвует в адаптации эпителиальных клеток слюны к внеклеточному pH. Было показано, что V-АТФаза, белок протонной помпы, зависит от транспорта везикул, опосредованного Rab11FIP5. Когда Rab11FIP5 сбит, клетки слюны не могут правильно транслоцировать V-АТФазу на плазматическую мембрану в ответ на внеклеточный ацидоз. Хотя этот путь остается в значительной степени неизвестным, эти результаты предполагают связь между функцией Rab11FIP5 и поддержанием буферной способности слюны. [ 14 ]
Rab11FIP5 также необходим для регулируемого экзоцитоза в нейроэндокринных клетках. Нокдаун Rab11FIP5 ингибировал стимулируемый кальцием экзоцитоз везикул с плотным ядром (DCV) в клетках нейроэндокринной клеточной линии BON. Мембранные белки DCV теряются на плазматической мембране во время экзоцитоза и возвращаются в аппарат Гольджи по ретроградному пути переноса. Потребность Rab11FIP5 для регулируемого экзоцитоза DCV может быть связана с его ролью в эндосомно-опосредованном ретроградном переносе. [ 15 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135631 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051343 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (6): 355–64. дои : 10.1093/dnares/5.6.355 . ПМИД 10048485 .
- ^ Jump up to: а б Прекерис Р., Кламперман Дж., Шеллер Р.Х. (декабрь 2000 г.). «Белковый комплекс Rab11/Rip11 регулирует транспорт апикальной мембраны посредством рециркуляции эндосом» . Молекулярная клетка . 6 (6): 1437–48. дои : 10.1016/S1097-2765(00)00140-4 . ПМИД 11163216 .
- ^ «Ген Энтрез: RAB11FIP5, белок 5, взаимодействующий с семейством RAB11 (класс I)» .
- ^ Jump up to: а б с Хейлз CM, Гринер Р., Хобди-Хендерсон К.К., Дорн MC, Харди Д., Кумар Р., Наварра Дж., Чан Э.К., Лапьер Л.А., Голденринг-младший (октябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика семейства Rab11-взаимодействующих белков» . Журнал биологической химии . 276 (42): 39067–75. дои : 10.1074/jbc.M104831200 . ПМИД 11495908 .
- ^ Jump up to: а б Прекерис Р., Дэвис Дж. М., Шеллер Р. Х. (октябрь 2001 г.). «Идентификация нового связывающего домена Rab11/25, присутствующего в белках Eferin и Rip» . Журнал биологической химии . 276 (42): 38966–70. дои : 10.1074/jbc.M106133200 . ПМИД 11481332 .
- ^ Jump up to: а б Грант Б.Д., Дональдсон Дж.Г. (2009). «Пути и механизмы рециркуляции эндоцитов» . Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 10 (9): 597–608. дои : 10.1038/nrm2755 . ПМК 3038567 . ПМИД 19696797 .
- ^ Jump up to: а б с д Шонтейх Э., Уилсон ГМ, Берден Дж., Хопкинс С.Р., Андерсон К., Голденринг Дж.Р., Прекерис Р. (ноябрь 2008 г.). «Комплекс Rip11/Rab11-FIP5 и кинезин II регулирует рециркуляцию эндоцитарного белка» . Журнал клеточной науки . 121 (Часть 22): 3824–33. дои : 10.1242/jcs.032441 . ПМЦ 4365997 . ПМИД 18957512 .
- ^ Бакай Т., Ахмад М., Хурадо С., Маленка Р.К., Зюдхоф ТК (май 2015 г.). «Синаптическая функция Rab11Fip5: избирательная потребность при длительной депрессии гиппокампа» . Журнал неврологии . 35 (19): 7460–74. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1581-14.2015 . ПМЦ 4429152 . ПМИД 25972173 .
- ^ Калеро-Куэнка Ф.Д., Сотильос С. (сентябрь 2016 г.). «Требования Nuf и Rip11 к переработке детерминантов полярности во время развития дрозофилы» . Малые ГТФазы . 9 (4): 352–359. дои : 10.1080/21541248.2016.1235386 . ПМК 5997155 . ПМИД 27687567 .
- ^ Ольке О, Мартин Х.В., Остерберг Н., Русса Э. (март 2011 г.). «Rab11b и его эффектор Rip11 регулируют вызванный ацидозом трафик V-АТФазы в слюнных протоках». Журнал клеточной физиологии . 226 (3): 638–51. дои : 10.1002/jcp.22388 . ПМИД 20717956 . S2CID 10428914 .
- ^ Чжан Х, Цзян С., Миток К.А., Ли Л, Атти А.Д., Мартин ТФДЖ (июль 2017 г.). «BAIAP3, белок Munc13, содержащий домен C2, контролирует судьбу везикул с плотным ядром в нейроэндокринных клетках» . Журнал клеточной биологии . 216 (7): 2151–2166. дои : 10.1083/jcb.201702099 . ПМЦ 5496627 . ПМИД 28626000 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ван Д., Буйон Дж.П., Чжу В., Чан Э.К. (ноябрь 1999 г.). «Определение нового фосфопротеина массой 75 кДа, связанного с SS-A/Ro, и идентификация отдельных человеческих аутоантител» . Журнал клинических исследований . 104 (9): 1265–75. дои : 10.1172/JCI8003 . ПМК 409828 . ПМИД 10545525 .
- Чен Д., Сюй В., Хэ П., Медрано Э.Э., Уайтхарт С.В. (апрель 2001 г.). «Gaf-1, гамма-SNAP-связывающий белок, связанный с митохондриями» . Журнал биологической химии . 276 (16): 13127–35. дои : 10.1074/jbc.M009424200 . ПМИД 11278501 .
- Прекерис Р., Дэвис Дж. М., Шеллер Р. Х. (октябрь 2001 г.). «Идентификация нового связывающего домена Rab11/25, присутствующего в белках Eferin и Rip» . Журнал биологической химии . 276 (42): 38966–70. дои : 10.1074/jbc.M106133200 . ПМИД 11481332 .
- Хейлз CM, Гринер Р., Хобди-Хендерсон К.К., Дорн MC, Харди Д., Кумар Р., Наварра Дж., Чан Э.К., Лапьер Л.А., Голденринг-младший (октябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика семейства Rab11-взаимодействующих белков» . Журнал биологической химии . 276 (42): 39067–75. дои : 10.1074/jbc.M104831200 . ПМИД 11495908 .
- Уоллес Д.М., Линдси А.Дж., Хендрик А.Г., Маккаффри М.В. (декабрь 2002 г.). «Rab11-FIP4 взаимодействует с Rab11 GTP-зависимым образом, и его сверхэкспрессия конденсирует положительный компартмент Rab11 в клетках HeLa». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 299 (5): 770–9. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02720-1 . ПМИД 12470645 .
- Тани К., Сибата М., Кавасе К., Кавасима Х., Хацудзава К., Нагахама М., Тагая М. (апрель 2003 г.). «Картирование функциональных доменов гамма-SNAP» . Журнал биологической химии . 278 (15): 13531–8. дои : 10.1074/jbc.M213205200 . ПМИД 12554740 .
- Кавасе К., Сибата М., Кавасима Х., Хацудзава К., Нагахама М., Тагая М., Тани К. (апрель 2003 г.). «Gaf-1b — это альтернативный вариант сращивания Gaf-1/Rip1. Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 303 (4): 1042–6. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00486-8 . ПМИД 12684040 .
- Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б., Мукерджи М., Стеттлер-Гилл М., Питерс Э.К. (май 2004 г.). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованными металлами и тандемной масс-спектрометрии». Аналитическая химия . 76 (10): 2763–72. дои : 10.1021/ac035352d . ПМИД 15144186 .
- Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С., Металников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вуджетт Дж.Р., Лангеберг Л.К., Скотт Дж.Д., Поусон Т. (август 2004 г.) . «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Современная биология . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
- Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
- Швенк Р.В., Люйкен Дж.Дж., Экель Дж. (ноябрь 2007 г.). «FIP2 и Rip11 определяют опосредованное Rab11a клеточное распределение GLUT4 и FAT/CD36 в клетках H9c2-hIR». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 363 (1): 119–25. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.08.111 . ПМИД 17854769 .